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而像ChatGPT这样的通用大模型,在生物医学领域的角色更像是“知识渊博的翻译官”或“文献助理”,它们擅长基于已有的文本知识(如基因注释、文献摘要)进行问答,但几乎从未被要求直接“阅读”原始的ATCG序列。想象一下,未来的生物学家可以将一段新测得的、功能未知的DNA序列丢给AI助手,它能像经验丰富的专家一样,指出其中可能存在的调控元件、预测其可能影响的基因、甚至推断其在不同细胞状态下的功能。模型却

标题:RVQ-Alpha: Bridging Single-Cell Transcriptomics and Large Language Models via Discrete Tokenization and Verifiable Reinforcement Learning。

标题:btag199预见基因表达,DNA序列只讲了一半的故事:给AI模型一扇观测染色质“开关”的窗户大多数预测基因表达的AI模型只看DNA序列,忽略了染色质是否“打开”这个关键开关。一项新研究证明,直接把染色质可及性数据作为输入特征喂给模型,预测精度显著飙升,尤其在那些最难搞定的“高度可变基因”上。更妙的是,这个“加个通道”的策略极其简单,几乎可以移植到任何现有模型上。

SPEND的巧妙之处在于:它把一张噪声较大的光谱图片,按照光谱维度(波数)拆分成奇数和偶数两组数据,让神经网络在这两组“彼此独立又有内在关联”的数据之间学习映射关系,从而实现去噪,而不需要任何“干净”图片作为“标准答案”。工作原理是这样的:先用一束中红外激光照射样品,让目标分子(比如脂肪分子)吸收红外光产生振动,振动产生的热量会扩散到周围的荧光染料上,导致染料的荧光强度瞬间变弱。图注:c图和d图展

你手头有一份复杂的罕见病病例,症状描述、HPO术语、基因检测结果混杂在一起,想快速生成一个可解释的鉴别诊断列表?今天介绍的这个工具,就是你的“诊断外挂”。DeepRare 是一个基于大语言模型的多智能体系统,它能整合超过40个专业工具和最新的医学知识源,处理多种临床输入,生成带有透明推理链的排名诊断假设。简单说,它能把复杂的诊断过程自动化、可追溯化,帮你从海量信息中快速定位方向。这篇教程将手把手带

当遇到新数据集(尤其是测量蛋白质的CODEX、MIBI技术)时,如果目标分子不在预训练的“词汇表”里,模型就束手无策,要么直接报错,要么需要费力地手动将蛋白质“映射”到近似的基因上,这无疑会丢失大量信息并引入偏差。它通过创新的跨层信息传递,将细胞的空间邻域信息与内部的基因共表达网络动态耦合,不仅实现了跨技术、跨器官的卓越预测性能,还能发现被传统模型忽略的、由微环境驱动的细胞亚群。这意味着,同一个基

标题:Orthrus: toward evolutionary and functional RNA foundation models700倍参数碾压巨头:这个RNA基础模型用进化“对比学习”重新定义了“少即是多”现有基因组基础模型,像GPT或BERT一样,通过预测被遮罩的核苷酸或“下一个碱基”来学习DNA语言,却忽略了生物学中最重要的信号——进化。

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当 AI 真的能像一个药剂师前辈那样,在我们设计路线时就及时提醒:“嘿,这个中间体可是个‘定时炸弹’,试试旁边那条更绿的路吧”——这究竟是解放了创造力,还是让化学家变成了只点击“绿色路线”的“操作员”?这或许是 SynCraft 带给我们的,最值得深思的“路标”。更精彩的是,SynCraft 的搜索结果中还自动列出了多条已发表的、避开了 Compound 16 的更安全的替代合成路线。最关键的是,

标题:Detecting and quantifying overparametrization in RNA language models with REDIAL全面超越11种主流方法:这个拓扑工具重新定义了细胞轨迹推断该研究提出了一种基于零样本、无监督框架 REDIAL 的 RNA 语言模型评估方法,首次发现当前 RNA 语言模型存在严重的过参数化和记忆化问题。








