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百日筑基篇——R的数据结构与数据类型(R语言初识一)

作为一个生物专业的学生,对计算机编程语言有较多兴趣,在生信分析中,R语言的学习是必不可少的,作为一个萌新,希望以这种方式,对自己的学习不断进行复盘,同时希望多多指教!!今天,整理了R语言中的数据结构和数据类型,理清了其中的关联与区别。大体来说,数据结构提供了一种方式来在程序中组织和操纵数据,而数据类型则定义了数据在内存中的存储和表示方式。即后者为基础元素,前者为存储框架。昔我往矣,杨柳依依;今我来

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#r语言#开发语言
实验篇——基因组共线性分析

本文主要介绍了使用TBtools软件来进行基因组间的共线性分析,并进行可视化。对于物种间共线性的分析,使用TBtools软件,主要是基于MCScanx工具的算法进行的。可以用于检测和可视化基因组中的共线性区域,从而发现不同物种中的保守基因组区域。借问酒家何处有,牧童遥指杏花村。–2023-8-22实验篇。

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深度学习——卷积神经网络(CNN)基础一

本文算是一个从之前的全连接层到卷积层过渡。开始先记录了图像识别中的两个重要概念:平移不变性、局部性。之后介绍了在图像卷积中的严格卷积运算和互相关运算的关系,并代码简单实现了二维卷积核的学习。最后也算初步介绍了特征映射和感受野的概念。黄昏的地平线,划出一句离别。--2023-10-10进阶篇

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#深度学习#cnn#人工智能
实验篇——亚细胞定位

理化性质与亚细胞定位本章详细介绍了许多用于亚细胞定位的网站,其中,我还是比较推荐 WoLFPSORT这个网站的(简单易懂,十分好上手)。至于后续的代码实现我也是基于这个网站,但是因为爬虫学习还不到位(无法爬取到结果页面的url)。只能等以后在学习爬虫时,再修改。羌笛何须怨杨柳,春风不度玉门关。–2023-8-12实验篇。

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#数据库#redis#缓存
机器学习——支持向量机(SVM)

支持向量机(SVM)是一种常见的机器学习方法,常用于分类(线性和非线性分类问题),回归问题。本文将详细介绍一下支持向量机算法。本文在SVM算法原理介绍中:从开始的SVM介绍,到Kernel的介绍,再到算法和核函数的选择,之后就是算法的步骤,以及分类和回归的选择;在代码实现中:亦是分别对SVM中的回归(SVR)和分类(SVC)用代码实现,并可视化结果。关关雎鸠,在河之洲--2023-9-4筑基篇

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#支持向量机#机器学习#算法
机器学习——决策树与随机森林

决策树和随机森林都是常见的机器学习算法,用于分类和回归任务,本文将对这两种算法进行介绍。总之,决策树和随机森林都是基于树结构的机器学习算法,具有可解释性和特征选择的能力。随机森林是多个决策树的集成模型,引入了随机性并通过投票或平均来得出最终预测结果,可以有效降低噪声干扰,提高模型的准确性与稳定性,但是增加了计算量。锦帽貂裘,千骑卷平冈–2023-9-1筑基篇。

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#sklearn#python#机器学习
深度学习——图像分类(CIFAR-10)

本章主要是对一个常见的图像数据集:CIFAR-10,用Resnet18模型来进行图像分类,然后形成一个桌面小程序用来更好的交互和展示。其中最重要的还是模型的建立,通过对不同模型的测试以及超参数的调整来找到”最优解“。明日复明日,明日何其多,我生待明日,万事成蹉跎。--2023-10-24进阶篇

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深度学习——VGG与NiN网络

本章学习了VGG与NIN这两个卷积神经网络模型。VGG引入了块的概念,将多个连续的卷积层和池化层整合为一个VGG块,使用多个VGG块进行特征提取,之后采用了全连接层进行分类。NIN则是使用具有1x1卷积核的多层感知机来代替传统的全连接层,使用多个NIN模块,然后使用全局平均汇聚层将特征图压缩成一个向量。最后展平直接进行分类。天下有始,以为天下母。--2023-10-14进阶篇

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#深度学习#网络#人工智能
深度学习——图像分类(CIFAR-10)

本章主要是对一个常见的图像数据集:CIFAR-10,用Resnet18模型来进行图像分类,然后形成一个桌面小程序用来更好的交互和展示。其中最重要的还是模型的建立,通过对不同模型的测试以及超参数的调整来找到”最优解“。明日复明日,明日何其多,我生待明日,万事成蹉跎。--2023-10-24进阶篇

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在Flask中使用MySQL数据库

前面两章分别对mysql数据库进行了安装、flask的简单介绍,而本章将继续学习flask操作的mysql数据库。本章主要简单介绍了mysql在flask开发中作用,并简单的做了一个向数据库中提交用户信息的页面程序。人间总有一两风,填我十万八千梦。–2023-9-24进阶篇。

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#数据库#flask#mysql
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