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RefSeq — NCBI数据库的参考序列。Entrez 是 NCBI 使用的能够对众多数据库进行联合搜索的搜索引擎，其对不同的 Gene 进行了编号，每个 gene 的编号就是 entrez gene id。它是最多有 11 位包含大写字母的字符串，一般有着 “X_Y” 的形式，其中 “X”是最多五个便于记忆的蛋白质编号，“_" 是下划线，“Y” 是最多五个便于记忆的物种编号。Ensembl s
sci论文数据获取方式
参数【family】：一个科名或一个科名组成的向量。参数【cultivated】：是否也返回已知的栽培记录？默认为 FALSE。参数【new.world】：NULL（默认值）返回全球记录，TRUE 仅返回新世界记录，FALSE 仅返回旧世界记录。参数【observation.type】：是否返回观测类型的信息（即标本与绘图）？默认值为 FALSE。参数【all.taxonomy】：返回所有分类信息
为了让大家更好的利用公共数据库中的数据，所以需要大家对自己上传的数据进行充分的注释，geo官方给定的了一个metadata spreadsheet (template and examples)，(https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submission/meta/)里面包含了RNA-seq和ChIP-seq数据的模板，可以根据模板填入。待所有数据上传完成并提交
如何利用NHANES数据库计算调整权重的且调整协变量的人群归因分数（PAF）？
DatabaseImmuneCellExpressionData由来自同名项目的分选细胞群体的bulk RNA-seq样本组成。NovershternHematopoieticData由来自GSE24759的经分类的造血细胞群体的微阵列数据集组成。利用R语言的singleR包进行自动注释，singleR自带的7个参考数据集，其中5个是人类数据，2个是小鼠的数据。MonacoImmuneData来自
R语言|KEGG通路分析图绘制|GO通路分析图绘制|按大小排列|David数据库|生物信息
Charls的数据量不大，但是变量挺多的，非常详尽，特别是一些社科类的数据，又经过多年的随访，挺适合做重复测量数据的，因为表格众多，所以涉及到数据的合并、拼接和清洗，这是一个重要的内容，下一节继续介绍。申请账号以后进入到主页面，需要哪一年的数据都要进行申请，一般都成功，大概3个工作日通过，通过上面的内可以得知2011年是数据的基线表，后面的是随访分析，所以2011年是一定要下载的。比如怎么收集都数
NHANES挖掘培训班来啦，就在4.20-21！郑老师团队2024年NHANES公共数据库挖掘培训班，由浅入深，零基础可学，欢迎报名！近年来，使用美国营养健康（NHANES）数据的文章中，有一类统计学方法异军突起，我称之为回归三板斧，即在统计学设计上同时建立广义线性回归，加权位数和回归以及贝叶斯核机回归三种模型，对比结果比较优劣，再进行综合的分析讨论，得出较为严谨详实的结果。回归三板斧 | 三种回
临床公共数据库是指由政府机构、学术机构、医院或其他组织收集并公开发布的临床数据集合。这些数据库通常包含了大量的患者信息、医疗记录、实验数据等，供研究者免费下载或付费使用。临床公共数据库的出现具有以下几方面的意义。
作者指出甘油三酯葡萄糖指数被认为是胰岛素抵抗的替代物，研究TYG指数与中国中年和老年人患糖尿病的风险之间的关系，作者做了cox回归，分位数回归、多模型比较、限制性立方样条和亚组分析，咱们在后面将会一一进行介绍，咱们先看看作者是怎么获取数据的，主要看流程图。CHARLS数据最麻烦的就是整理数据了，因为没有成熟的查对系统，一边整理一边查找变量，我整理了这份数据也花了2天时间，整理数据内容比较多，光代码
利用GEOquery进行数据下载遇到的超时问题
注释：本文章是本人学习 B站 生信技能树-jimmy 课程 整理所得，如有错误，请见谅；
[Zer0pts2020]easy strcmp前话：这题要用到ida64位远程调试先记录一下配置方法，因为本人使用的是ida7.6版本差异可能导致问题。application与input file填linux路径下的题目文件路径dictionary填linu下题目文件所在文件夹的路径（即题目文件的父级）Paramater不填Hostname用ifconfig填自己的ip，Port端口固定Pass
1.背景介绍地理信息系统(Geographic Information System，GIS)是一种利用数字技术和空间科学的方法，用于收集、存储、处理、分析和展示地理空间信息的系统。随着人工智能、大数据和云计算等技术的发展，地理信息系统逐渐成为了人类社会中不可或缺的一部分。R语言是一种用于统计计算和数据分析的编程语言。在过去的几年里，R语言在地理信息系统领域也逐渐成为了主流。这篇文章将介绍...
首先是一个知识清单：（对于现在的Android及移动互联网来说，我们需要掌握的技术）泛型原理丶反射原理丶Java虚拟机原理丶线程池原理丶注解原理丶注解原理丶序列化Activity知识体系（Activity的生命周期丶Activity的任务栈丶Activity的启动模式丶View源码丶Fragment内核相关丶service原理等）代码框架结构优化（数据结构丶排序算法丶设计模式）APP性能优化（用户
Rserve(远程通信模式) 在这种通信模式下，最大的优点是javaWeb项目不需要去维护R的运行，通过TCP/IP协议直接进行通讯，但是有一个很大的缺点是它对中文的支持很弱，尤其是在windows的环境中。基本是不支持中文的，在linux环境下，似乎对中文的支持稍微好些。JRI（嵌入式模式）我体会到最大的优点是它对中文的支持较好，但是使用JRI模式下很容易造成整个系统的崩溃，比如在java调用R
一般情况下VMware Workstation Pro可以通过桥接模式直接复制网络连接状态，但为了让宿主机访问虚拟机我们选择nat模式为主要网络连接模式。然后我们点击编辑，点击虚拟网络编辑器，点击更改设置，将桥接模式删除，然后点击nat模式，更改nat设置添加如图所示两个端口便于以后宿主机访问虚拟机。以上方法为我们通过主机终端访问虚拟机提供了重要通道接下来就需要在虚拟机中下载工具包。二、想要安装r
随着教育部公布2017年度普通高等学校本科专业备案和审批结果的通知，目前申请获批数据科学与大数据技术专业（专业代码：080910T）的高校已增至278所。在获批高校越来越多的同时，如何在专业建设过程中选择适用教材，却逐渐成为了各大高校面临的一大难题。而早在2016年，清华大学博士、南京大数据研究院院长刘鹏教授就联合国内多所高校从事一线教学科研任务的专业师资，开始编写大数据系列教材。目前，《云计算》
转成因子后，下面开始建立抽样调查函数svydesign，ids表示集群的意思，这里填入抽样单元SDMVPSU（PSU），如果没有的话填入1，strata = ~ SDMVSTRA，strata这里是分层的意思，这里填入SDMVSTRA，weights是权重的意思，参照别的大佬的意思，如WTINT2YR,WTMEC2YR,这两个权重就填入WTMEC2YR，data填入你的数据就可以了。主要是使用su
1 Google Earth Engine平台简介Google Earth Engine,又称谷歌地球引擎,是基于云计算的地理信息处理平台。谷歌地球引擎是世界上最先进的、专门处理卫星图像和其他地球观测数据的云端运算平台,由谷歌、卡内基梅隆大学、美国地质调查局联合开发。该平台存储了公开可用的全球尺度上的长时间序列的遥感影像(Landsat、MODIS、Sentinel等)和其他数据的PB级存档，并且
转载自:debian启动缓慢：Gaveupwaitingforsuspend/resumedevice_走钢丝_新浪博客http://blog.sina.com.cn/s/blog_47642c6e0102yt7b.html在 VirtualBox 中创建 debian 9 虚拟机，制作一些东西。完事儿后压缩各个分区，包括 swap 分区。重启后发现 swap 分区不能用了就重建了一个磁盘并建立
更新软件包：及时更新已安装的软件包，以获得最新的功能和修复bug安装R语言和相关软件包时，确保虚拟机内存和CPU能够支撑运行。
在学校服务器上运行R最近由于导师的要求，需要在学校的服务器上去跑R，但是由于没有管理员权限，安装起来异常的麻烦。终于在昨天协商好，可以用管理员的账号配置相关环境，所以先在自己的虚拟机上去配置一下，以防万一。sudo apt install r-base报错apt时出现如下问题：Could not get lock /var/lib/dpkg/lock-frontend - open说明之前使用ap
RStudio 是一个功能强大的 R 语言开发环境，适用于数据分析、可视化和报告生成。通过本文的详细步骤，相信你已经成功下载并安装了 RStudio。在使用过程中，可以根据需求自定义环境，提升工作效率。希望这篇文章能帮助你顺利上手 RStudio，享受数据科学的乐趣！
R for Windows是一个免费的用于统计计算和统计制图的优秀工具，是R语言开发工具。它拥有数据存储和处理系统、数组运算工具（其向量、矩阵运算方面功能尤其强大）、完整连贯的统计分析工具、优秀的统计制图等功能。提供的图形界面，可以在其中访问控制台、创建脚本或安装其他软件包。
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