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NCBI GEO数据库（Gene Expression Omnibus）是一个全球最大的生物医学领域的公共数据库平台，用于存储基因组学数据，包括基因表达数据、染色质状态和基因组变异等。研究人员可以在该平台上查找、下载和分析各种基因表达数据集，以便进行生物信息学和生物医学研究。NCBI GEO数据库提供了丰富的数据资源和分析工具，是生命科学领域的重要研究工具之一。大量生物医学领域发表的论文使用的公共
生信碱移TCMNP 包，一路打通网络药理学数据库与可视化分析。最近，小编冲浪的时候看到一个今年发表的网络药理学 R 包 TCMNP，据说整合了多个数据库以及多种可视化分析函数，一眼看下来确实够顶。具体来说，TCMNP 整合了几大类型的数据库：① 三大药物成分及靶点数据库TCMSP、DrugBank、ETCM；② 疾病基因数据库 DisGeNET 与 OMIM；③ 转录因子及其对应靶基因数据库 TR
先下载。
Gephi是一款开源免费的多平台网络分析软件，在Windows、Linux和Mac os上均可以运行，像他们官网所说的，他们致力于创造像Photoshop一样的图表绘制软件。
1:南大通用天津南大通用数据技术股份有限公司成立于2004年，是国家规划布局内重点软件企业，专注于数据库领域，公司以“软件发掘数据价值”为愿景，以为用户提供好用的数据库产品和优质的技术服务为使命，从成立之日起一直坚持国产数据库的研发和推广。公司已为为金融、电信、政务、国防、企事业等领域上万家用户提供服务数据安全等细分市场提供具有国际先进技术水平的数据库产品。南大通用已经形成了在大规模、高性能、分布
单细胞测序数据分析-seurat使用的一些背景知识
R语言入门指南：从安装到数据可视化 R语言是一种专为统计计算和图形设计的开源编程语言，广泛应用于数据分析领域。本文介绍了R语言的基本概念、安装步骤和核心功能。首先需要安装R语言和RStudio开发环境，文章详细说明了安装过程。在基础知识部分，涵盖了变量赋值、数据类型（数值型、字符型、逻辑型等）和数据结构（向量、矩阵、数据框、列表）。同时介绍了基本运算、条件语句、循环和自定义函数的使用方法。针对实际
SCENIC (Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering) 是从单细胞RNA数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具。原作者将SCENIC应用于肿瘤和小鼠大脑单细胞图谱数据，证明了顺式调控网络分析能够有助于深入挖掘细胞异质性背后的生物学意义，并为疾病的诊断、治疗以及发育分化的研究提供有价值的线索。SCENIC在2017年首先发
新版TCGA转录组数据整理——R语言（傻瓜式代码）
R 安装sparklyr，ggplot2等包出现如下warningpackage ‘＊＊＊＊’ is not available (for R version 3.0.2)系统环境 ubuntu14.04上述问题纠结了我很久，尝试过自己安装packages.zip包，出现了版本不对的报错this R is version 3.0.2, package 'ggplo...
CC共富集到93个通路，富集的top5通路分别为：呼吸链复合体（respiratory chain complex）、线粒体呼吸体（mitochondrial respirasome）、线粒体呼吸链复合体I（mitochondrial respiratory chain complex I）、NADH脱氢酶复合体（NADH dehydrogenase complex）和呼吸链复合体I（respir
Rust Analyzer采用增量编译和查询驱动的架构设计。与传统编译器不同，它需要在代码编辑过程中持续提供反馈，这意味着性能与准确性之间存在微妙平衡。配置不当会导致IDE响应迟缓、内存占用过高，甚至出现误报或漏报。理解其工作原理是优化配置的前提：Rust Analyzer维护了一个内存中的项目模型，通过Salsa框架实现查询缓存和依赖追踪。每次代码变更都会触发增量重新分析，配置参数直接影响这个过
Rust Analyzer的配置不是一次性工作，而是随项目演进持续优化的过程。深入理解每个配置项的技术原理和适用场景，才能真正发挥语言服务器的价值。未来，随着Rust生态的成熟和Rust Analyzer自身的进化，配置系统可能会引入更多智能化特性，如基于项目特征的自动配置推荐。作为开发者，保持对工具链的持续学习和实践探索，是提升生产力的关键所在。
大型语言模型（LLM）的浪潮已经席卷了自然语言处理、计算机视觉甚至代码生成等多个领域，展现出作为强大通用骨干的惊人潜力。答案是肯定的。本文将深入探讨一种名为的前沿方法，它巧妙地将LLM“重编程”，使其能够在不进行任何微调的情况下，理解并预测时间序列数据。我们将通过理论解析与实践案例，为你揭示这一跨界融合的奥秘。
报错信息FAILURE: Build failed with an exception.* What went wrong:Execution failed for task ':app:transformClassesWithDesugarForDebug'.> com.android.build.api.transform.TransformException: java.lang.Il
缺少xml2：apt-get install libxml2-dev
查找以readxl为例子Rstudio代码操作install.packets("readxl") # " "引号内输入包名library() #查阅当前的库内有哪些的已安装的包安装成功3. Rstudio自带的包：标准包说明statsR语言的统计函数graphics基于base图形的R函数grDevices基于base和grid图形的图形设备utilsR语言常用工具函数databases基本R语言
今天用R爬取外网数据一直报错，就是没办法获取网页，返回错误：Error in curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) :Failed to connect to www.etsy.com port 443: Timed out看到这个链接里也有人出现相同的问题：Getting connection timed out error while Ge
引入GEO DataSets上，某些Series是由多个series组成的，比如GSE6834,由六个Series组成：This SuperSeries is composed of the following SubSeries:Less… Less…GSE6771Temporal Cortex Control (mesial temporal lobe epilepsy contr...
R语言获取软件包里的所有数据集例如：输入print(data(package="mlbench"))输出Data sets in package ‘mlbench’:BostonHousingBoston Housing DataBostonHousing2Boston Housing DataBrea...
R包的安装R语言的特点就是有众多的第三方扩展包，扩展包涉及到各行各业的数据分析内容。包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合，包括R程序，运行该程序的其他语言(例如C语言)，解释这个程序功能、方法的帮助文档，例子、测试数据等。R自带了一系列默认包，包括base、datasets、utils、graDevices、graphics、stats以及methods。这些包提供了很多的默
说明：要考虑的因素为：美国的中国移动每日收盘价，美国标普500指数收盘价，港股中国移动收盘价， 数据日期从2000年10月19日到2016年10月13日。 在中间处理数据的时候，删除了部分因为美国市场和港股市场不同期开盘的数据。1、获取数据，找到相应的数据。R语言代码为：#获取数据getSymbols('CHL',from='2000
Interoperability between single-cell object formatsCompiled: 2021-08-30Source: vignettes/conversion_vignette.RmdIn this vignette, we demonstrate the ability to convert between Seurat objects, SingleCe
本文主要学习使用R语言中的klaR包与e1071包中的朴素贝叶斯分类函数，数据使用的仍是上篇文章中从UCI上下载的bank数据下载地址：http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Bank+Marketingbank <- read.csv("D:/data/MachineLearning/bank/bank.csv",header=T,sep=";"
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