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Interoperability between single-cell object formats

Interoperability between single-cell object formatsCompiled: 2021-08-30Source: vignettes/conversion_vignette.RmdIn this vignette, we demonstrate the ability to convert between Seurat objects, SingleCe

#r语言
duqiang_1分析GEO数据库差异基因(GSE150910),将差异基因与泛素化酶相关基因取交集。 这个差异分析ipf chp control

但是当我使用以下代码读取时候,发现不太对读取出来的格式好像有问题 注意:观察到逗号,是不是csv的分隔符为逗号呢?3但是下载文章阅读之后 发现差异分析deseg2的时候 是需要meta信息 消除批次 年龄 实验方法这些因素影响的。莫非是因为显示的问题?在r中8-10行没有数据所以sublime或者excel查看时候,直接跳过了NA行。我知道作者为什么行名这么长了因为 有很多类型的基因都检测到了:假

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#数据库
msigdbr hallmarks gsea broad研究所

【代码】msigdbr hallmarks gsea broad研究所。

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#windows
cellmarkergene 细胞注释 tumor 肿瘤各种细胞annotation

Epithelial/Tumor: EPCAM,Keratin genes (KRT7, KRT8, KRT17), SPRR3;T cells: CD3E, CD3D, TRBC1/2, TRAC;Myeloid cells: LYZ, CD86, CD68, FCGR3A;B cells and plasma cells: CD79A/B, JCHAIN, IGKC,IGHG3;Endothe

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windows安装conda小环境 windows安装anaconda python jupyter anaconda

然后回到anaconda界面版本,就可以可以在小环境里面安装jupyterlab,然后就可以使用jupyterlab啦。如果你是在base小环境,因为base环境预装了jupyter,可以直接打开。因为实在cmd里面,所有使用del命令删除然后就可以安装自己的小环境了。如果想体验在线版的jupyter,可以访问anaconda在。针对所有用户安装,没选only me选项。可以看到注册好的stlea

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#python#windows#conda
ubuntu 中的git 如何下载具体的reposotory github desktop桌面应用

https://blog.csdn.net/beishanyingluo/article/details/107451921#sudo git clone https://github.com/velocyto-team/velocyto.R下载下来的东西在velocyto.r文件夹下

#git
使用aspera下载SRA数据速度高达 下载中国gsa数据? ascp 密钥位置

问:ascp: failed to authenticate, exiting. Session Stop (Error: failed to authenticate) 怎么回事?链接:https://www.jianshu.com/p/2987843d97e3。问:既然断点续传对fasta/q序列文件的完整性有影响,那我不加k1可以嘛?商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。问:断点

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#linux#https#数据库
使用aspera下载SRA数据速度高达 下载中国gsa数据? ascp 密钥位置

问:ascp: failed to authenticate, exiting. Session Stop (Error: failed to authenticate) 怎么回事?链接:https://www.jianshu.com/p/2987843d97e3。问:既然断点续传对fasta/q序列文件的完整性有影响,那我不加k1可以嘛?商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。问:断点

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#linux#https#数据库
msigdbr hallmarks gsea broad研究所

【代码】msigdbr hallmarks gsea broad研究所。

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#windows
cellmarkergene 细胞注释 tumor 肿瘤各种细胞annotation

Epithelial/Tumor: EPCAM,Keratin genes (KRT7, KRT8, KRT17), SPRR3;T cells: CD3E, CD3D, TRBC1/2, TRAC;Myeloid cells: LYZ, CD86, CD68, FCGR3A;B cells and plasma cells: CD79A/B, JCHAIN, IGKC,IGHG3;Endothe

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