【代码】编译报错：PKIX path building failed: sun.security.provider.certpath.SunCertPathBuilder。

基于kuberay的rayjob中集群启动时间测试

代码：hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/code$ cat a.sh#!/bin/bash#SRR003161h20t1#samtools view -h -S SRR003161h20t1.sam >SRR003161h20t1.bam#samtools sort -o SRR003161h20t1.sorted.bam SRR003161h20t

指令：head filename |grep -n string运行记录：hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310/GCA_000001405.15_GRCh38$ cat GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna |grep -n chr 1:>chr1  AC:CM

FastQC是评价基因数据质量的软件。1.下载：http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/download.html#fastqc2.解压配置：unzip配置：ln -s /path/to/FastQC/fastqc /usr/local/bin/fastqc参考【1】3.运行：xubo@xubo:~/cloud/FastQC$

1.查看进程号，有很多中方式：比如：top下图PID即为进程号或者：hadoop@Mcnode4:~$ ps -aux| grep bwahadoop93944.5 78.4 5722420 4786516 pts/27 Sl+3月2777:35 bwa mem GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_

一般a.sh等脚本文件可以很容易的将a.sh的echo等数据输出到文本文件，如：./a.sh >1.txt但是无法将脚本文件调用函数的输出值输出到文件可以使用%>:hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310/test$ ./a.sh %> 1.txta.sh代码：hadoop@Mcnode1:~/clou

1.基本：ctrl +Z回导致正在运行的程序方法哦后台运行fg可以在前台运行bg后台2.查看进程id：查看当前进行idjobs -l3.关闭：kill -9 pidhadoop@Master:~/xubo/tools/mango$ jobs[1]+Stoppedmvn clean package -DskipTestshadoop@Master:~

1.run as->maven build,在goals输入package，别选择select，我的卡死了运行记录：[INFO] Scanning for projects...[INFO][INFO] -------------------