前一段时间忙着转录组数据分析，说好的群落结构差异分析结果解读，严重拖更。期间微生信生物公众号发布了微生物群落分析的详细流程。感觉写的详细，跟我这种已经转了1年半行的确实不一样。虽然.......

RCS在科学研究中，我们经常构建回归模型来分析自变量和因变量之间的关系。大多数的回归模型有一个重要的假设就是自变量和因变量呈线性关联。当自变量和因变量之间为非线性关系时，可以将连续型变量转化为分类变量，但是分类变量的类别数目以及节点位置的选择一般会带有主观性并且分类变量会损失部分信息；也可以直接拟合自变量和因变量之间的非线性关系，但是直接构建多项式回归可能存在过度拟合、共线性等问题。因此，一个更好

if-else语句在R中，if-else语句的语法是:if(condition){Expr1}else{Expr2}210516_1例如，想检查变量qu...

本期R包：survival和survminer，survival建立生存函数，survminer内置ggplot2，ggpubrg等包，美化曲线。一行代码配一个图，逐步讲解代码含义。喜欢的...

R实战|Nomogram(诺莫图/列线图)及其Calibration校准曲线绘制Nomogram，中文常称为诺莫图或者列线图。简单的说是将Logistic回归或Cox回归的结果进行可视化呈...

volcano2.0今天我们复现一幅前两天发表在Cell上的火山图。DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.02.027之前复现过火山图：跟着CELL学作图|1.火山图答疑| ggplot 绘制火山图并添加文字标签跟着Cell学作图 | 双曲线火山图cell原图读图和普通的火山图相比有几个地方不同：散点大小根据表达量匹配散点的边框与...

顶刊发表助力学员发表Nature、Science、Cell等正刊及子刊杂志！（在生信分析的新技术加持下，用更少的经费，发更高质量的文章）科研背景01机器学习单细胞分析：细胞生物学的相关研究一直受限于数据的完整性和表型的完整性，对应激状态和稳态下的细胞区别观察不够充分。过去五年中，计算机视觉和语音识别领域通过对大量的无标签数据进行学习、建模，很好的解决了数据不足的问题。同样在最近的研究中，机器学习.

Cytoscape网络可视化 | 以WGCNA结果的网络可视化为例Cytoscape是一个开源的软件平台，用于可视化分子相互作用网络和生物路径，并将这些网络与注释、基因表达谱和其他状态数据进行整合。虽然Cytoscape最初是为生物研究设计的，但现在它是一个复杂网络分析和可视化的通用平台。Cytoscape核心版提供了一套基本的数据整合、分析和可视化功能。额外的功能...

ggpubr的基础用法指南ggpubr是由Alboukadel Kassambara创建的，基于ggplot2的可视化包。主要用于绘制符合出版要求的图形。本文代码领取：后台回复 ggpubr。安装与加载从CRAN安装：install.packages("ggpubr")或者从GitHub上安装最新版本：# Installif(!require(devtools)) install.packages

7.富集分析(Metascape数据库)“实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。”2021.4.12_1DOI: 10.1016/j.cell.2020.05.032这...