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使用biopython查询NCBI数据库

欢迎关注”生信修炼手册”!NCBI网站是最常用的生物信息数据库之一,集成了pubmed,genebank等子数据库。最简便的用法当然是直接在网站上检索,为了方便检索,NCBI提供了自己的...

#数据库#编程语言#数据分析 +2
COSMIC数据库简介

欢迎关注"生信修炼手册"!COSMIC是癌症相关体细胞突变位点的最大的数据库之一,网址如下:https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/最新版本...

OMIM数据库简介

欢迎关注"生信修炼手册"!OMIM 全称叫做Online Mendelian Inheritance in Man, 是一个不断更新的人类孟德尔遗传病的数据库。这个数据库...

DANN:利用神经网络算法评估变异位点的有害程度

欢迎关注"生信修炼手册"!之前的文章中我们介绍了CADD软件,通过计算变异位点的打分值,来评估变异位点的有害程度。今天介绍的DANN软件,可以看作是CADD的改进版本,改...

3DIV:染色质空间互作数据库

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HiGlass:高度定制的Hi-C数据可视化应用

欢迎关注”生信修炼手册”!HiGlass是一个hi-C数据可视化的web应用,参考UCSC基因组浏览器和juicebox中数据的展示形式,运用D3.js等流行的可视化框架对数据进行展示,...

突变检测数据分析专题

欢迎关注”生信修炼手册”!随着NGS测序技术的发展,以WES, WGS, 靶向捕获测序为主的高通量数据分析广泛应用,本文整理了以SNP位点为主的突变检测数据分析资料。首先是snp cal...

#数据分析#人工智能#编程语言 +1
基因组组装数据分析专题

欢迎关注”生信修炼手册”!得到一个物种的参考基因组是开展后续结构和功能基因挖掘的前提,通过高通量测序可以快速的拼接得到基因组,本文整理了基因组组装相关的数据分析资料。二代测序的基因组组装...

ENCODE转录因子靶基因数据库

欢迎关注”生信修炼手册”!ENCODE数据库中包含了许多转录因子的chip-seq数据,通过对chip-seq数据进行分析,可以预测得到该转录因子对应的靶基因数据。通过整合多个转录因子的...

#数据库#大数据#数据可视化 +2
HLA数据分析专题

欢迎关注”生信修炼手册”!HLA 全称human leukocyte antigen, 表示人类白细胞抗原,是编码主要组织相容性复合体(MHC)的基因,位于6p21.31的区域,包含了一...

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