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卡方检验的空假设是两独立样本的率相同，即两组有效时间发生率相同，则可以用总的有效事件发生率，即总计所在行的发生率来作为总体率的估计，然后各组人数乘以总体率得到各组的发生有效事件的人数，从而计算出一个理论上的四格表，此时得到的表格中的数据称为理论频数，计算公式如下。该表中79， 745， 166， 712这四个基本数据，习惯上用a, b, c, d来表示，表格中的其他几个数据可以基于这四个基本数据计

一.协方差分析的基本思想和应用条件协变量：影响处理效应而无法人为控制或难以控制的实验因素，称为协变量。协方差分析：协方差分析可以消除协变量对处理效应的影响，将不同处理的处理效应真正地显现出来，它是一种将直线回归和方差分析结合起来的统计学分析方法通过一个示例来理解下协变量和协方差分析在上述例题中，样本分为3个治疗组，每个治疗组所用药物不同，这个分组变量就是想探究的处理因素X,实验效应通过患者治疗..

欢迎关注”生信修炼手册”!检测CNV有多种技术手段，常见的有以下三种aCGH芯片SNP芯片NGS测序本文主要介绍SNP芯片检测CNV的原理，本质是基于染色体区域内的SNP分型结果来判断对...

在芯片分析中，使用探针的信号强度来衡量表达量，但是探针的信号强度会受到噪声的干扰，所以需要去除背景噪声。差异分析的结果是我们最关注的的结果,为了保证差异分析结果的可靠性，除了保证样本处理...

对于如何使用minfi 分析甲基化芯片数据，我们在之前的文章中详细讲解了每一步处理的具体用法。今天主要给出一个piepeline, 包括从文件读取一直到最终的DMP/DMR差异结果。整个...

经过预处理之后的数据，就可以进行差异分析了。对于甲基化芯片而言，有两个方面的差异分析DMP 差异甲基化探针DMR 差异甲基化区域在ChAMP包中，champ.DMP函数用于分析差异甲基化...

欢迎关注"生信修炼手册"！dbSNP是NCBI中专门用于存储物种SNP位点信息的数据库，网址如下http://www.bioinfo.org.cn/relative/db...

欢迎关注”生信修炼手册”!SMART是蛋白结构域的数据库，该数据库最新版本为v8,收录了1300多个蛋白结构域信息，覆盖了来自uniprot, ensembl等多个数据库的蛋白。官网如下...

欢迎关注”生信修炼手册”!Hi-C基于传统的染色质构象捕获技术，在DNA连接时引入生物素标记分子，标记交联的染色质，然后富集带有生物素标记的junction reads, 再结合高通量...