Reload、Safe Mode、Terminate R 都没用！咱不慌！俺带着解决方案来啦！！！

很多小伙伴们遇到了Count数据批次处理后不是整数甚至还出现负值的问题，这就导致无法使用某些包包进行差异分析。那该怎么办呢？ComBat-seq帮你搞定！走！一起看看去！

一般遇到这个问题，各路大神是不是都会告诉你是因为没有安装。$ tree-bash: tree: command not found那确实，没有这个命令，我要是没安装的话确实需要安装一下，哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈！但是，咱们为什么不能用呢？是因为不会安装吗？并不是！网上教程真是一抓一大把，可惜呐，我辜负了大神们的良苦用心！家人们！咱就是说！我不能装！纯纯是因为！莫！得！权！限！「我指的是服务器，

GEO数据库可以说是大家使用频率贼高的数据库啦！那它里面的数据怎么下载大家知道嘛！今天给大家展示一种快速获取它的表达矩阵和临床信息的方法！

前面已经介绍了高级森林图的画法，今天我们就来介绍另一种用于可视化Logistic或Cox回归分析结果的方式 —— 列线图（Alignment Diagram），也称诺莫图（Nomogram）。

经常有小伙伴们会问到，**“我该如何入门生信”、“生信小白该怎么开始上手”、“不知道从哪里开始学”、“可以先不学R语言和Linux吗”**等等问题。其实入门这个问题叭，有点庞大，一句两句还真说不清！今天，咱们就来碎碎念一波！

富集分析可以说是我们的老帮手了！进行富集分析，就不能不提基因集，那基因集我们该去哪里找呢？我们又该如何选择适合自己数据的基因集呢？咱们今天就来浅浅唠一唠！最常见的操作就是去MSigDB数据库找现成的基因集，当然也可以自定义基因集，那既然有现成的，我们为什么还要多此一举去自定义呢？因为呀，总会有新发现的基因集或其它感兴趣的基因的集合对不对，甚至有些物种没有现成的基因集，我们只能自制，所以在之后我会教

在火山图中，我们有时候会想要标注出自己感兴趣的基因，这个时候该怎么嘞！还有还有，在添加标签时，可能会遇到元素过多或位置密集导致标签显示不全，或者虽然显示全了但显得密集杂乱，不易阅读的情况。这可咋整捏！话不多说，直接开干！（本节内容同时适用于其他散点型图表）

前面我们介绍了[看完还不会来揍/找我 | TCGA 与 GTEx 数据库联合分析 | 附完整代码 + 注释](https://mp.weixin.qq.com/s/VUDl2PUtMVz4kO0CBPSTIg)，很多粉丝朋友私信想要我分享一下如何利用得到的混合矩阵进行差异表达分析，那今天我们就一鼓作气！把最最最经典的三个差异分析工具 —— DESeq2, edgeR 和 limma 包，以及如何通

大名鼎鼎的生存分析来咯！今天我就不叭叭叭了，咱们直接开始冲！（字有点多，希望大家不要嫌弃！）