这是2020的春节，实在是闲的无聊，写个贴子吧。这篇文章主要是一个类似于综述性质的文章，里面会讲一下细胞核分割的图像，算法，当然也会给出引用的文献。细胞核分割是个很久远的课题了。细胞核的分割在应用上有着很广泛的应用，比如说在溶液中统计单位体积的细胞数量可以统计细胞的密度和总数目，在病理图片中对细胞进行分割是计算机进行肿瘤精准分析的前提，对以后的计算机辅助病理分析有着很重要的影响。这里会介绍一些..

病理图像的读写

这篇文章说一下怎么分析医学影像图像，并利用统计学和机器学习建模，实现预后等回归学习。这篇文章会不断的修改，因为我也会不断的学习，不断的添加和改正文章中的内容。医学影像已经是非常火的一个方向了，对于医学图像的处理有很多不同的领域，也有很多不同的方法。随着人工智能的发展，很多的人工智能算法已经在医学图像的处理中取得非常不错的进展。比如说深度学习中，Unet对HE染色和IHC染色图像的细胞核分割，CT.

这里记录一下 R语言mRMRe包实现mRMR算法进行特征降维的操作。下面是R代码library('mRMRe')mrmr_feature<-train_featuremrmr_feature$y <-train_label#筛选的数据要加上Y值target_indices = which(names(mrmr_feature)=='y')#因为读取csv文件的时候，Y（l...

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maks-r-cnn在小数据集中性能较差。120训练集，40测试集（256乘以256）的数据集上面测试，效果很差只能勉强分清个轮廓，很多细胞都没有被识别到。mask-r-cnn的分割能力有待在更大的数据集上面进行测试。unet的分割能力是出奇的强，在很小的训练集上面都有很不错的表现（35乘以512乘以512）轮廓比较明显，挨得很近的细胞也能分出大概的轮廓unet++的分割能力会比une...

与现有的专注于预先训练功能强大的特征提取器或设计复杂的实例聚合器的工作不同，R2T 专门用于在线重新嵌入实例特征。然而，这会导致偏向于易于分类的实例，而忽略难以分类的实例。通过在实例层面应用这种想法，我们详细阐述了一种新型的 MIL 框架，该框架采用带有一致性约束的连体结构（教师-学生）来挖掘潜在的硬实例（MHIM-MIL）。MHIM-MIL 采用基于注意力分数的多种实例掩蔽策略，利用一个模数教师

AJI（Aggregated Jaccard Index ）是在2017年提出的概念。论文出处：A Dataset and a Technique for Generalized Nuclear Segmentation for Computational Pathology这个是MICCAI18 细胞分割数据集的论文。AJI可以说是增强版的IOU，但是相比于IOU，他有着对实力分割效果更加...

病理图像的读写

这是2020的春节，实在是闲的无聊，写个贴子吧。这篇文章主要是一个类似于综述性质的文章，里面会讲一下细胞核分割的图像，算法，当然也会给出引用的文献。细胞核分割是个很久远的课题了。细胞核的分割在应用上有着很广泛的应用，比如说在溶液中统计单位体积的细胞数量可以统计细胞的密度和总数目，在病理图片中对细胞进行分割是计算机进行肿瘤精准分析的前提，对以后的计算机辅助病理分析有着很重要的影响。这里会介绍一些..