为评估方法的特异性，作者使用Spatial-Mux-seq 技术对小鼠胚胎组织中的组蛋白修饰（H3K27me3 和 H3K27ac）进行分析，经过无监督聚类分析，H3K27me3 被分为 19 个簇（标记为 An），H3K27ac 被分为 16 个簇（标记为 Bn）(Fig. 1b)。在从径向胶质细胞向分化神经元的转变过程中，作者发现双价性在动态变化，径向胶质细胞在H3K4me3定义的启动子处的H

R语言拥有丰富的数据处理、统计分析和机器学习工具包，涵盖了从简单的描述统计到复杂的模型建立的各个方面。再加上数据的处理可以完美的衔接后续的可视化，这使得它成为处理各种类型和规模的数据集的理想选择。

摘要： 《Nature》最新研究揭示膳食脂质代谢通过调控T细胞铁死亡影响免疫功能。研究发现不同标准饲料（SF-NIH31、SF00-100、AIN93G）通过改变膳食脂肪酸（DEFs）比例，显著调节T细胞对铁死亡的敏感性：低PUFA/MUFA饮食（如AIN93G）可降低脂质ROS水平，增强滤泡辅助性T细胞（TFH）存活及CD8+T细胞抗肿瘤功能。机制上，ACSL4介导的PUFA磷脂合成是关键调控节

UNAGI是一种用于分析时间序列单细胞转录组数据的深度生成神经网络工具。它能捕捉疾病进展中的细胞动态变化，增强药物扰动建模和筛查能力。文章展示了UNAGI在特发性肺纤维化患者数据分析中的应用，包括模型安装、数据处理、训练参数设置及可视化分析流程。测试表明UNAGI能有效识别潜在治疗药物，并通过蛋白质组学验证其预测准确性。工具还支持其他疾病如新冠的研究，具有广泛的应用潜力。文章提供了详细的安装指南、

西柚云推出AI无缝接入Rstudio方案，支持直接调用AI进行代码修改和数据分析。系统采用CLAUDE.md和AGENTS.md作为配置文件，通过分层设计实现个性化设置：用户级、项目级和目录级配置按优先级生效，支持代码风格、数据处理等规范的自定义。同时提供轻量级Memory系统记录临时偏好，可通过#前缀快速保存个人习惯。该方案结合Codex插件实现AI辅助编程，覆盖本地与远程场景，显著提升生信工作

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该研究基于对70余例B细胞淋巴瘤的基因组、转录组、空间单细胞转录组和空间单细胞蛋白组学分析，揭示了B细胞淋巴瘤中存在的七种不同微环境空间生态位，并系统描绘了微环境空间生态位与淋巴瘤关键临床特征之间的关联。这项大规模的多组学整合研究发现了KACs细胞在早期KRAS突变的肺腺癌中的重要作用，并使用转基因工程小鼠模型系统性地验证了KACs为来源于2型肺泡细胞的中间状态细胞，在2型肺泡细胞参与肺损伤修复，

例如有文章借助UKB的蛋白组学数据，首次构建了一个覆盖数万人的系统性“血浆蛋白组图谱”资源库，既展示了健康状态下蛋白表达的参考范围，也描绘了其在不同疾病中的变化轨迹。看到这里，大家有没有越来越了解UKB，其丰富的纵向数据以及与健康记录的链接，为深入探究疾病机制其丰富的纵向数据以及与健康记录的链接，为深入探究疾病机制、风险因素及潜在治疗靶点提供了极具价值的参考，大家快去试试吧。UK Biobank的

第三讲。

JSON是一种轻量级数据交互格式，可以按照JSON指定的格式去组织和封装数据。其本质是一个带有特定格式的字符串，其可以在各个编程语言中进行流通、传递、交互。而Python中的数据格式(列表、字典)可以做到与JSON的无缝切换。注：当JSON是列表时，需要列表中嵌套的是字典。