麻黄-甘草药对可改善发热、咳嗽、排痰及肺部炎症症状；药对呈现协同抗炎作用，对白细胞介素-1β（IL-1β的抑制效果优于单味药；：通过四种相应小鼠模型，评估麻黄、甘草及麻黄 - 甘草药对的抗炎、解热、镇咳及祛痰作用，并采用 Bliss 独立模型定量分析协同效应；本文主要通过scRNA-seq、网络药理学结合实验验证，揭示了麻黄-甘草药对（麻甘药对，EGP）在小鼠呼吸系统症状和多（I：C）诱发肺炎模型

摘要：2022年《Nature Biotechnology》发表的Numbat算法通过整合单倍型信息、等位基因信号和表达信号，显著提升了从单细胞RNA测序数据中检测体细胞拷贝数变异(CNV)的准确性。该创新方法采用单倍型感知的隐马尔可夫模型，能够识别传统方法难以检测的微弱CNV信号，并精确推断等位基因特异性拷贝数状态。在多发性骨髓瘤、乳腺癌等肿瘤样本测试中，Numbat展现出优于现有工具的检测性能

摘要：ContrastiveVI是一种基于scvi-tools的自编码器生成模型，用于从单细胞RNA测序数据中分离目标细胞特有的变异因素。该教程详细介绍了ContrastiveVI在急性白血病、肠道感染和阿尔兹海默症三种疾病数据中的应用流程，包括环境配置、数据预处理、模型训练和差异分析。通过对比健康与疾病样本，ContrastiveVI能有效识别疾病特异性变异，并进行细胞亚群聚类和差异基因表达分析

在病理生理层面，病毒侵入远端气道激活先天免疫传感器和趋化因子程序，招募单核细胞/巨噬细胞和中性粒细胞，并扩增细胞因子如白介素-1β（IL-1β）、白介素-6（IL-6）和肿瘤坏死因子-α（TNF-α）。和博士研究生马亚洁为本文共一作者，余伯阳教授和张媛媛副教授为本文共同通讯作者）通过scRNA-seq、网络药理学结合实验验证，揭示了麻黄-甘草药对（麻甘药对，EGP）在小鼠呼吸系统症状和多（I：C）

摘要：ContrastiveVI是一种基于scvi-tools的自编码器生成模型，用于从单细胞RNA测序数据中分离目标细胞特有的变异因素。该教程详细介绍了ContrastiveVI在急性白血病、肠道感染和阿尔兹海默症三种疾病数据中的应用流程，包括环境配置、数据预处理、模型训练和差异分析。通过对比健康与疾病样本，ContrastiveVI能有效识别疾病特异性变异，并进行细胞亚群聚类和差异基因表达分析

OpenClaw是一款开源AI代理框架，可通过企业微信等平台控制，调用多种大模型执行任务。本文介绍了在云服务器上部署OpenClaw的完整流程，包括服务器获取、环境配置、企业微信接入和Skills插件安装。教程重点演示了如何通过OpenClaw完成GEO数据库转录组分析（GSE130437），包括文献检索、差异基因分析和可视化等生信任务。部署过程中解决了CMake版本冲突等技术问题，并详细说明了企

《Science》最新研究揭示，鼻内黏膜疫苗GLA-3M-052-LS通过TLR4/7/8激动剂联合模型抗原，在小鼠中诱导出广谱呼吸道保护作用。该疫苗不仅对SARS-CoV-2、流感病毒及细菌感染提供持久防护，还能预防过敏性哮喘。研究发现其机制涉及：1）建立抗原特异性组织驻留记忆T细胞；2）通过表观遗传重编程增强肺泡巨噬细胞功能；3）促进三级淋巴结构形成。单细胞和空间转录组分析显示，这种&quot

JSON是一种轻量级数据交互格式，可以按照JSON指定的格式去组织和封装数据。其本质是一个带有特定格式的字符串，其可以在各个编程语言中进行流通、传递、交互。而Python中的数据格式(列表、字典)可以做到与JSON的无缝切换。注：当JSON是列表时，需要列表中嵌套的是字典。

这有助于用户识别特定的观测值或异常值，并进一步分析其对回归模型的影响。在上述代码中，cutoff是通过公式计算得到的阈值，它的计算方式是 4 / (nrow(states) - length(coefficients(fit)) - 1)。par(mfrow=c(2, 2))函数被调用后，后续的4个plot()函数调用将会自动按照2行2列的布局排列在绘图设备中，每个图形占据一个绘图区域。例如前面用

R语言中基础的机器学习主要有：分类、聚类、降维、回归(预测，自变量和因变量)这积累问题。拿到数据和问题首先要会判定是这4类中的哪一种。此前我们也用专门的教程介绍过在。