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在linux中安装R包
提供了3种在linux种安装R包的方法,希望对你有帮助!

DeepSEA-用深度学习预测非编码变异的效应
从原始序列中预测非编码变异的效应,基于深度学习模型,预测不同的染色质特征,以及预测单核苷酸改变后的染色质效应。可以利用该方法改进功能变异的优先级排序(包括eQTL和疾病相关变异)

ACC、AUC、auPR
1. test acc:模型正确预测的样本占总样本的比例。如果该样本中零值大概是73%的比例,test acc高而auc低说明模型没学到有用的信息,将所有样本都判断为0都有73%的正确率,更何况随机猜测(auc=0.5),因此准确率会稍高于73%2. AUC:ROC曲线下的面积,ROC曲线是真阳率(True Positive Rate, TPR)对假阳率(False Positive Rate,

h5文件的读取(h5py、scanpy)
HDF:hierarchical data format 层次数据格式- h5文件中有两个核心概念:group 和 datasets-- group 包含了其它groups和datasets,像字典一样工作(类似目录)-- dataset 即numpy.ndarray,像numpy数组一样工作(类似文件)

到底了







