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git clone时可以用镜像站

就是将github.com换成kkgithub.com。

#git
DeepSEA-用深度学习预测非编码变异的效应

从原始序列中预测非编码变异的效应,基于深度学习模型,预测不同的染色质特征,以及预测单核苷酸改变后的染色质效应。可以利用该方法改进功能变异的优先级排序(包括eQTL和疾病相关变异)

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#深度学习#人工智能
用docker安装rstudio-server

属于别的用户,容器里写不了,就会导致 R 会话启动失败。如果想删除当前容器重新构建容器,这里是不影响下载的rstudio-server镜像的。每次只用打开网页就行web:http://服务器网址:8787。这样服务器重启后,RStudio 会自动起来,你直接打开网页就能进。密码就是这里设置的PASSWORD,我这里是123456。run会生成一个容器,名称为yuan_rstudio,了(再 run

#docker#容器#运维
在服务器上配置git,以及将代码push到github上

需要先在命令行中生成SSH密钥打印id_rsa的内容,填写到github上,即SSH key然后就可以从服务器中链接到github上正确输出× 若实际输出是这种情况说明程序自动首先启用的是系统config,也就是etc下ssh的设置,且该文件报错了,需要管理员权限才能修改内容,不可行!因此需要自己构建一个home下的ssh config文件,并让SSH客户端能正确 读取用户级配置(`~/.ssh/

#服务器#git#github +1
DeepSEA-用深度学习预测非编码变异的效应

从原始序列中预测非编码变异的效应,基于深度学习模型,预测不同的染色质特征,以及预测单核苷酸改变后的染色质效应。可以利用该方法改进功能变异的优先级排序(包括eQTL和疾病相关变异)

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#深度学习#人工智能
在linux中安装R包

提供了3种在linux种安装R包的方法,希望对你有帮助!

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#r语言
DeepSEA-用深度学习预测非编码变异的效应

从原始序列中预测非编码变异的效应,基于深度学习模型,预测不同的染色质特征,以及预测单核苷酸改变后的染色质效应。可以利用该方法改进功能变异的优先级排序(包括eQTL和疾病相关变异)

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#深度学习#人工智能
ACC、AUC、auPR

1. test acc:模型正确预测的样本占总样本的比例。如果该样本中零值大概是73%的比例,test acc高而auc低说明模型没学到有用的信息,将所有样本都判断为0都有73%的正确率,更何况随机猜测(auc=0.5),因此准确率会稍高于73%2. AUC:ROC曲线下的面积,ROC曲线是真阳率(True Positive Rate, TPR)对假阳率(False Positive Rate,

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#机器学习#人工智能
h5文件的读取(h5py、scanpy)

HDF:hierarchical data format 层次数据格式- h5文件中有两个核心概念:group 和 datasets-- group 包含了其它groups和datasets,像字典一样工作(类似目录)-- dataset 即numpy.ndarray,像numpy数组一样工作(类似文件)

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#python
到底了