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作者 | 董靖鑫审稿 | 程玉今天给大家介绍的是来自蒙特利尔算法研究所、克莱姆森大学等联合发表在ICML2020上的文章。在本文中,作者针对目前新型化学结构的生成方法不能确保所提出的分子...
分水岭算法进行图像分割分水岭分割方法,是一种基于拓扑理论的数学形态学的分割方法,其基本思想是把图像看作是测地学上的拓扑地貌,图像中每一点像素的灰度值表示该点的海拔高度,每一个局部极小值及其影响区域称为集水盆,而集水盆的边界则形成分水岭。分水岭的概念和形成可以通过模拟浸入过程来说明。在每一个局部极小值表面,刺穿一个小孔,然后把整个模型慢慢浸入水中,随着浸入的加深,每一个局部极小值...
作者建立了一个树搜索,每个步骤中都在不断增长的链的N端或C端添加一个短的蛋白质片段。给定单体中螺旋的长度和数量以及总体组装体的大小的规格,作者从一个短的螺旋片段开始,在指定的上限距离内随机放置,随机取向,初始化了数百万条MCTS轨迹,并为每个轨迹执行了10,000次迭代,以生成大量多样化的结构。MCTS方法在理论测试中生成了紧密填充的二十面体组装体,这些组装体跨越了与天然和先前的新生二十面体不同的

本文介绍的是由荷兰莱顿药物研究学术中心、西安交通大学电子与信息工程学院和莱顿高级计算机科学研究所联合发表在Journal of Cheminformatics上的研究成果。作者在之前的一项研究中提出了一种名为DrugEx的药物分子生成方法,将探索策略集成到基于RNN的强化学习中,以提高生成分子的多样性。在本文中,作者通过多目标优化扩展DrugEx算法,以生成针对多个靶标或一个特定靶标的类药物分子,
今天为大家带来斯坦福大学Jure Leskovec教授课题组发表在NeuIPS上的一篇论文。本文引入了一个框架GQE,以便在不完整的知识图谱上有效地对合取逻辑查询进行预测。在本文的方法中,作者在低维空间中对图节点进行嵌入,并在这个嵌入空间中将逻辑运算符表示为学习过的几何运算(例如平移、旋转)。本文通过在低维嵌入空间中执行逻辑运算,实现了线性时间复杂度的变量查询。1介绍各种各样的异构数据可以自然地表
数据分析工具Pandas(1):Pandas的数据结构数据分析工具Pandas(2):Pandas的索引操作数据分析工具Pandas(3):Pandas的对齐运算Pandas的函数应用apply 和 applymap1. 可直接使用NumPy的函数# Numpy ufunc 函数df = pd.DataFrame(np.random.randn(5,4)...
《柳叶刀》| AI(知识图谱)助力新冠病毒药物研发AI对抗冠状病毒爆发的11种方式BenevolentAI借助生物医学知识图谱确定了一种可能的药物“ Baricitinib”,可以抑制...
今天给大家介绍的是耶鲁大学医学信息学中心主任Brandt教授实验室和爱丁堡大学的博士生联合发表在ACL-BioNLP 2020发表的文章“Benchmark and Best Practices for Biomedical Knowledge Graph Embeddings”。作者将五个KGE模型应用到SNOMED-CT知识图谱中,提供了与现有方法的比较基准并深入讨论目前的最佳实践应用,并说明
数据分析工具Pandas(1):Pandas的数据结构数据分析工具Pandas(2):Pandas的索引操作数据分析工具Pandas(3):Pandas的对齐运算数据分析工具Pandas(4):Pandas的函数应用层级索引(hierarchical indexing)下面创建一个Series, 在输入索引Index时,输入了由两个子list组成的list,第一个子li...
作者 | 李芬审稿 | 涂心琪今天给大家介绍发表在AAAI 2020上的文章“K-BERT: Enabling Language Representation with Knowledg...