今天为大家介绍的是来自James Zou 团队的一篇论文。公开可用的医学图像缺乏注释，成为计算研究和教育创新的主要障碍。与此同时，许多医生在医学Twitter等公共论坛上分享了匿名化的图像和大量知识。在这里，作者利用这些群体平台来策划OpenPath，这是一个包含208,414张病理图像与自然语言描述配对的大型数据集。通过开发病理语言-图像预训练（PLIP）来展示这个数据资源的价值，这是一个具有图

作者 | 俞琳荟指导 | 曾湘祥教授单位| 湖南大学研究方向 | 药物靶点、深度学习1、研究背景鉴定新的药物-蛋白质相互作用对于药物发现至关重要，基于机器学习的方法利用药物描述符和一维...

数据分析工具Pandas（1）：Pandas的数据结构数据分析工具Pandas（2）：Pandas的索引操作数据分析工具Pandas（3）：Pandas的对齐运算数据分析工具Pandas（4）：Pandas的函数应用数据分析工具Pandas（5）：Pandas的层级索引数据分析工具Pandas（6）：Pandas统计计算和描述数据清洗数据清洗是数据分析关键的一步，直...

分水岭算法进行图像分割分水岭分割方法，是一种基于拓扑理论的数学形态学的分割方法，其基本思想是把图像看作是测地学上的拓扑地貌，图像中每一点像素的灰度值表示该点的海拔高度，每一个局部极小值及其影响区域称为集水盆，而集水盆的边界则形成分水岭。分水岭的概念和形成可以通过模拟浸入过程来说明。在每一个局部极小值表面，刺穿一个小孔，然后把整个模型慢慢浸入水中，随着浸入的加深，每一个局部极小值...

作者 | 董靖鑫审稿 | 程玉今天给大家介绍的是来自蒙特利尔算法研究所、克莱姆森大学等联合发表在ICML2020上的文章。在本文中，作者针对目前新型化学结构的生成方法不能确保所提出的分子...

作者建立了一个树搜索，每个步骤中都在不断增长的链的N端或C端添加一个短的蛋白质片段。给定单体中螺旋的长度和数量以及总体组装体的大小的规格，作者从一个短的螺旋片段开始，在指定的上限距离内随机放置，随机取向，初始化了数百万条MCTS轨迹，并为每个轨迹执行了10,000次迭代，以生成大量多样化的结构。MCTS方法在理论测试中生成了紧密填充的二十面体组装体，这些组装体跨越了与天然和先前的新生二十面体不同的

本文介绍的是由荷兰莱顿药物研究学术中心、西安交通大学电子与信息工程学院和莱顿高级计算机科学研究所联合发表在Journal of Cheminformatics上的研究成果。作者在之前的一项研究中提出了一种名为DrugEx的药物分子生成方法，将探索策略集成到基于RNN的强化学习中，以提高生成分子的多样性。在本文中，作者通过多目标优化扩展DrugEx算法，以生成针对多个靶标或一个特定靶标的类药物分子，

自我监督学习已成为AI社区中令人兴奋的方向。Jitendra Malik: "Supervision is the opium of the AI researcher"Alyosha Efros: "The AI revolution will not be supervised"Yann LeCun: "self-supervised learning is the cake, supervi

今天为大家介绍的是来自Angela Ruohao Wu 和Can Yang团队的一篇论文。空间转录组学（ST）技术正在革新探索组织空间结构的方式。目前，ST数据分析通常局限于单个二维（2D）组织切片，这限制了我们理解在三维（3D）空间中发生的生物过程的能力。在这里，作者介绍了STitch3D，这是一个统一的框架，它整合多个ST切片以重建3D细胞结构。通过联合建模多个切片并将其与单细胞RNA测序数据

长期以来，创造满足各种功能需求的蛋白质一直是生物化学家的目标。这需要彻底了解多肽链序列与所得蛋白质结构之间的关系。近年来，蛋白质设计领域终于达到了一个阶段，可以利用物理和化学原理来指导新...