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初探生物信息数据库——生信原理第一次实验报告(华农)

水稻抗病基因Xa21有多少条序列具有全长CDS,分别由多少碱基构成?编码多少个氨基酸?选择修改时间最早的一条序列,指出该基因exon和intron的位置。该基因编码的蛋白质有多少个氨基酸残基?该蛋白质可能位于细胞中哪个位置?是否有三维结构信息?

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AnnData:单细胞和空间组学分析的数据基石

今天我们来系统学习一下单细胞分析的标准数据类型——AnnData!AnnData就是有注释的数据,全称是Annotated Data。

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#python
【生信】初探蛋白质性质和结构分析

对蛋白质的一级、二级和三级结构进行分析和预测、蛋白质的跨膜结构、翻译后修饰、亚细胞定位等进行分析和预测

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深入浅出原核基因表达调控(乳糖操纵子、色氨酸操纵子)

自然界里,能量时有时无,各种生命为了让自己能够活下去,需要适应环境,在不同的环境合成不同的蛋白质。原核生物体内有很多细胞,细胞里面有很多蛋白质,但是这些蛋白质在这些细胞里的个数(拷贝数)因细胞而异。有的蛋白质的数量在不同的细胞中都相差不大,而有一些则波动很大。我们把变化不大的蛋白质叫做**组成型(constitutive)合成蛋白质**,其合成速率不受环境变化或代谢状态的影响。为什么叫组成?大家想

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【GNN2】PyG完成图分类任务,新手入门,保姆级教程

我们一起来学习如何调用多种GNN架构完成图分类,此外我们还将学习如何让单个的图组成batch,从而更好地利用GPU,以及如何应用readout layer从node embedding中得到graph embedding。

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#分类#人工智能#pytorch +1
打包conda环境的两种方法:conda env export和Conda-Pack

搭建项目环境可能是整个开发过程中最让人头疼的部分了。如何把我们辛辛苦苦搭建的环境打包起来,万一环境崩了还能迅速恢复,或者让别人能轻松地复制同样的设置呢?今天,我们就来看看在Linux上如何使用`condaenv export`和`Conda-Pack`来打包Conda环境,顺便看看这两种方法有什么优缺点。

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#conda
数据结构--循环队列的c语言实现(超详细注释/实验报告)

队列(Queue)是另一种限定性的线性表,它只允许再表的一端插入元素,而再另一端删除元素,多以队列具有先进先出(First In First Out,FIFO)的特性。这与我们日常生活中的排队是一样的,最早进入队列的人最早离开,新来的人总是加入到队尾。在队列中,允许插入的一端称队尾(Rear),允许删除的一端则称为队头(Front)。队列在程序设计中也经常出现。一个最典型的例子就是操作系统中的作业

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#数据结构#c语言
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