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医学深度学习与机器学习融合的随想

将深度学习和机器学习放在一起比较,深度学习的优势在于产生数据,目前用深度学习来重复人类的工作,显然是大才小用,应该利用深度学习算法提取人类所认识不到的特征,而机器学习的优势在于使用数据,而目前局限于医学临床数据特异性和准确性的不足,机器学习算法无法准确地诊断疾病和预后预测, 两者的融合互补,将为人工智能在医学中的应用带来新的契机。而在深度学习与机器学习融合的模式中,深度学习的变为特征提取工具,其主

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#深度学习#机器学习#人工智能
构建一个快速数据分析(boruta+shap+rcs)的shiny APP

立方样条回归(RCS)用的是独立变量及其SHAP值之间的单因素回归,但是因为SHAP值计算的时候是多因素lightgbm计算出来的,所以最终结果中含有多因素的成份,与普通的两个变量之间的直接RCS拟合不同。1.筛选, 使用boruta算法对变量实现快速的筛选,后续分析只针对感兴趣的变量,因而提高了分析的效率。这一步耗费的时间比较长。但是运行起来比较耗费资源,主要是第二步导致部署在网路上的APP运行

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#数据分析#数据挖掘
贝叶斯统计结合机器学习在术后院内感染危险因素分析中的应用

本研究创新性地结合贝叶斯统计和机器学习方法,对术后院内感染危险因素进行系统分析。通过Boruta算法筛选出住院时长(LOS)和上臂肌肉面积(AMA)两个核心因素,采用贝叶斯逻辑回归量化关联强度,发现LOS每增加1单位感染风险升高42%。结合SHAP分析和立方样条回归,确定LOS超过6天为感染风险临界值,AMA在36.4-58cm²区间时感染风险最低。该研究为临床术后感染预防提供了科学依据,并建立了

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#机器学习#人工智能
双Docker Oracle XE 跨库查询操作文档

本文介绍了在同一宿主机上部署两个Oracle XE 21c容器(db1和db2),通过Docker内网和Oracle DBLINK实现跨库联合查询的方法。主要步骤包括:创建Docker自定义网络连接两个容器;查询db2容器内网IP;在db1中创建DBLINK连接db2;执行跨库查询(示例为血脂相关数据查询)。文章还提供了常见问题解决方案,如网络连接问题、账号锁定、容量限制等注意事项,并说明查询结果

#docker#oracle#容器
双Docker Oracle XE 跨库查询操作文档

本文介绍了在同一宿主机上部署两个Oracle XE 21c容器(db1和db2),通过Docker内网和Oracle DBLINK实现跨库联合查询的方法。主要步骤包括:创建Docker自定义网络连接两个容器;查询db2容器内网IP;在db1中创建DBLINK连接db2;执行跨库查询(示例为血脂相关数据查询)。文章还提供了常见问题解决方案,如网络连接问题、账号锁定、容量限制等注意事项,并说明查询结果

#docker#oracle#容器
医生视角下转录组学的生物信息学分析

转录组学的生物信息学分析是医生解决临床与科研问题的有力工具。这里罗列医学转录组学相关的几个概念,从使用者(医生)的角度看待理解相关技术,为后续使用该技术说明临床和科研问题奠定基础。

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#人工智能#算法
Python绘制数据分析中经典的图形--列线图

列线图是数据分析中的经典图形,通过背后精妙的算法设计,展示线性模型(logistic regression 和Cox)中各个变量对于预测结果的总体贡献(线段长短),另外,线段上有刻度,使得列线图兼具实用功能:在实际操作中,可以将某套待预测的变量值通过列线图转变为一个个得分,最终相加得到总得分,而总得分对应的概率轴上的刻度,就是这套变量通过预测模型得到的风险概率。

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#python#数据分析#开发语言
部署深度学习APP的经历(docker,streamlit cloud,nuitka)

最近,接到一个部署深度学习APP的需求,这个APP使用torch、monai和pydicom等库构建了一个识别CT图像中皮下脂肪、内脏脂肪和骨骼肌,输入是CT图像,输出是识别的图像和相关数据。接手的时候,核心的算法已经制作完成,仅是需要我构建GUI并将其部署到某种途径上,实现其应用。

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#深度学习#docker#人工智能
给数据库构建一个展示界面

这是“构建个人小型医学数据库”系列文章的最后一部分。通过之前的工作我们确定了所要收集的各类变量并将其录入到mySQL数据库中。为了展示MySQL中存储的数据,通过摸索我们最终使用appML、PHP和JavaScript开发一个展示页面。这些技术可以协同工作,以创建一个有用的用户界面,显示相关的数据。构建展示页面的必要性在于,让用户可以方便地浏览MySQL数据库中的数据。展示页面可以帮助用户更好地理

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#数据库#php#javascript
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