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单细胞测序数据下载和预处理

配置ascp代理高速下载sra数据wget http://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.7.4/aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gztar zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz#安装bash aspera-connect...

遗传图谱构建及QTL定位的基础知识详解

遗传图谱构建及QTL定位的基础知识点基因定位最有效且最常用的方法就是构建遗传连锁图谱进行基因定位,该方法对于数量性状和质量性状的基因定位都适用。今天,小编简单讲解一下遗传图谱构建及QTL定位的一些基本知识点。质量性状:指能观察但不能测量的性状,同一种性状的不同表现型之间不存在连续性的数量变化,而呈现质的中断性变化。多由一对或少数几对基因控制。比如,花药的有无、芒的有无、血型、子粒的颜色等。其杂交后

#知识图谱
重测序群体遗传进化分析之进化树构建

重测序大家都不陌生,它是检测样本基因组变异(SNP,indel,SV,CNV)的主要手段之一,有了这些变异信息,后续可以做很多分析工作,例如: 遗传群体可以进行遗传图谱构建、BSA分析等;大样本量自然群体,可以进行群体遗传进化分析等。今天,小编先给大家群体遗传进化分析内容中的进化树构建;教您如何利用重测序获得的SNP数据构建系统进化树,关于进化树的构建原理见:进化树构建原理。构建进化树的软件。

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#知识图谱
一文搞懂R(相关系数)与R^2(决定系数)

R与R^2没有关系,就如同标准差与标准误差没有关系一样。相关系数(R)定义:变量之间线性相关的度量。分三种, pearson(有秩),spearman(无秩), kendall。公式:公式解释:自变量X和因变量Y的协方差/标准差的乘积。协方差:两个变量变化是同方向的还是异方向的。X高Y也高,协方差就是正,相反,则是负。为什么要除标准差:标准化。即消除了X和Y自身变化的影响,只讨论两者之间关系。因此

#线性代数
生物信息学python必备包和库

**1.pysam :处理基因组序列工具,计算比对过滤 汇总**2.biopython:可处理多种生物信息学问题,计算分子生物学和生物信息学工具包**3.Dash_bio:开源 Python 库,用于生物信息学和药物开发应用。...

GWAS分析之绘制 SNP 密度图

绘制 SNP 密度图一般使用 CMplot 绘制SNP密度图:包链接:https://github.com/YinLiLin/R-CMplot要绘制 SNP 密度图,仅仅需要三列即可:a. 第一列是 SNP 名称b. 第二列是染色体c. 第三列是 SNP 的位置d. 第四列开始为不同性状的P值示例数据:SNP Chromosome Positiontrait1...

nodejs为什么express,get的res.sendFile返回的是html纯文本?

第一个你设置了headerres.header(“Content-Type”, “application/json;charset=utf-8”);浏览器就会按照json解析没设置,默认就是Content-Type:text/html; charset=utf-8自然就按照 html解析

#html#前端#javascript
flex布局解决align-items失效,无法居中问题

1.flex布局#main{display: flex;justify-content: center;align-items: center;}#content{width: 100px;height: 100px;background-color: #1890FF;}上面的布局会出现无法垂直居中的问题这是因为main缺少高度,100%的高度仍然不起作用,最好使用100vh来设置,这样就可以解决

#css3#css#html
js数组切片

const arrChunk = (arr,size) =>{if(arr.length === 0){return [];}const tempArr = [];const chunkLen = Math.ceil(arr.length / size);let last = 0;for(let i = 0;i<chunkLen;i++){if(size * i >= arr.l

#javascript
在div里如何让图片居中(4种方法)

方法一:  思路:利用text-align属性将图片水平居中,然后设置padding-top的值使其垂直居中。结构如下:  <div>  <img src="images/tt.gif" width="150" height="100" />  </div>CSS样式如下:  div {width:300px; height:150px; background-

#html#css3#css
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