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【GATK加速】如何用天河2号超级计算机跑基因数据分析,详细使用步骤

本文以广州超算为例,广州超算天河2A为目前全球最大的X86超算中心,X86架构为为目前科学计算和工程计算通用架构,但是随着ARM的崛起,可能会在未来天河3和天河4上有所反应。我们来看下广州超算的生信软件配备:如此众多软件,可以通过Module的功能将这些工具的环境加载到自己账户下,进行提交计算。我们以一款商用NGS组装和比对工具Sentieon来演示整个过程:1、拿到超算发的VPN账户,使用Hil

#vim#编辑器#算法 +2
生信在线讲座:Sentieon--基于机器学习的多组学分析

在二月份 DahShu 免费线上讲座中,我们将聚焦生物信息基因测序领域,邀请了来自硅谷的明星创业公司 – 基因测序数据软件 Sentieon 高级数据科学家胡晋南博士 (Dr. Frank Hu) 同我们分享 Sentieon 如何利用机器学习算法、软件和系统优化,使公司在创业初期就跻身成为业界第一快速、准确的商业机密。讲座嘉宾:Dr Frank Hu,胡晋南博士,Sentieon Senior

#大数据#算法#概率论 +1
毅硕HPC | NVIDIA DGX Spark 万字硬核评测:将AI超级工厂带上桌面

作为全球首款基于NVIDIA Grace Blackwell架构的个人AI超级计算机,DGX Spark将工业级的AI性能带入您的私人工作空间,让您从原型设计到大规模部署,实现真正的无缝衔接。NVIDIA DGX Spark 不仅仅是硬件的升级,更是开发范式的革新。它将数据中心的强大能力浓缩于 1.2 公斤的精致机身中,赋予了每一位 AI 探索者在本地掌控未来的能力。

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#HPC#功能测试#spark
Sentieon | DNAscope Hybrid长短读长混合分析流程详解及评测

在 120 核 456GB 内存的测试服务器上 35X 人类 WGS 数据+10X 的 PB 数据分析仅耗时 85.8 分钟,35X 人类 WGS 数据+10X 的 ONT 数据分析仅耗时 103.7 分钟,极大缩短了分析时间,加快科研成果转化

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NGS技术:如何一小时完成WGS全基因组数据分析

近日,Sentieon Inc.与MGI合作正式推出高通量测序数据分析一体机Zieon。双方团队详细讨论并测试了华大智造MegaBOLT和Sentieon软件模块的性能,采用合适的模块组合推出了Zieon数据分析一体机。数据显示,Zieon在准确率提升的同时可加速46倍左右。Zieon是一套高性能的重测序分析系统,整合了华大智造MegaBOLT以及Sentieon软件这两套加速方案。该方案包含胚系

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#big data
毅硕HPC | NVIDIA DGX Spark 万字硬核评测:将AI超级工厂带上桌面

作为全球首款基于NVIDIA Grace Blackwell架构的个人AI超级计算机,DGX Spark将工业级的AI性能带入您的私人工作空间,让您从原型设计到大规模部署,实现真正的无缝衔接。NVIDIA DGX Spark 不仅仅是硬件的升级,更是开发范式的革新。它将数据中心的强大能力浓缩于 1.2 公斤的精致机身中,赋予了每一位 AI 探索者在本地掌控未来的能力。

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#HPC#功能测试#spark
到底了