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在下图中,节点代表细胞,节点的特征则是细胞的基因表达特征。在下图中,左上角图展示了每个细胞在实际组织中的空间位置,其中一个点代表一个细胞,颜色表示细胞类型,这是基于基因表达生成的 UMAP 图。然而,这类方法存在一个问题,即在实际数据分析中,两个不同批次中的细胞类型可能并不完全一致,可能只有几个细胞类型是共同的,剩下的则是批次特异性的。可以看到,虽然这 2 个批次中有相似的细胞类型,但由于批次效应

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