前言FlareFEP是一个高度集成且用户界面友好的自由能微扰（Free Energy Perturbation，FEP）计算工具，它由Cresset和英国爱丁堡大学的Julien Michel博士合作开发而来1。Flare FEP健壮、用户友好、经过充分验证2，使用“炼金术”转化来预测同系物的相对结合亲和力变化。FEP计算有两个步骤非常耗费计算资源：一个是小分子的力场参数化，另一个是炼金术法过程.

1。计算机的峰值为主频x4。2。计算机读取数组时，一次会读入一行，要最大限度的利用已读入的数据，减少频繁读写的次数。3。多线程内存共享，多进程需要消息传递来交换变量。4。利用管道在不同程序之间传递内容（可以是管道符｜或mkfifo mypipe）5。平均不同节点的计算量，尽量做到负载平衡。6。数据分块是每块大小尽可能为cache的1/3。7。MPI_CHAR 为一个字符，但不一定是一个字节。8。在

一之前，出了一期画图专辑：好色之旅-画图三字经简洁明快地总结了生信宝典推出的一系列画图相关文章，包括多种形式的热图、线图、柱状图、箱线图、泡泡图、韦恩图、进化树、火山图、生存分析等(点上面的链接还有美女相赠)，这些都是基于R代码或简便封装的R脚本，便于学习和使用。另外还有Cytoscape和其它作图工具以及图形排版的介绍，是在家作图、出门收藏的必备良品。代码很简单，封装很方便，但在使用时还是有不少

已有研究表明，肠道微生物群的不平衡即“菌群失调”，会导致各种人类疾病的出现。目前，微生物标志物的开发主要基于二元分类器法。新的研究结果显示，多数健康状况表现出重叠的肠道微生物组特征，单一疾病诊断模型可能会被不相关的疾病混淆，进而导致错误的分类。虽然人们开始尝试开发多类诊断模型，但先前依赖公共数据集进行分析的工作所涉及的异质性、技术偏差和批次效应限制了模型的准确性。近日，香港中文大学黄秀娟教授团队在

细胞色素P450酶(Cytochrome P450酶，简称P450酶)是世界上公认的用途最广泛的催化剂，在生物代谢和生物合成过程中发挥着重要作用。尽管数据库中有大量的P450基因(超过30万个)，但只有一小部分(不到0.2%)进行了功能表征。为了提供一个方便的平台，提供丰富的p450及其相应反应的信息，作者引入了P450Rdb数据库，这是一个人工整理的资源，汇集了p450催化反应的文献。Highl

为推动我国生物信息学的学科发展和创新研究，充分展示和宣传我国生物信息学领域的重大研究成果，《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB）组织评选了2018年度、2019年度、2020年度和2021年度“中国生物信息学十大进展”。在此基础上，GPB继续组织2022年度评选活动，经过推荐、初选和复选程序，现公布202

生信宝典公众号是中科院遗传所2015年生物信息博士毕业生陈同创建，致力于传播生信知识，帮助生信入门和生信分析，近来也在做生信培训广受好评。生信的作用越来越大，想学的人越来越多，不管是为了以后发展，还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情，也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作，却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作，但不懂得背后的..

复杂热图可视化https://doi.org/10.1002/imt2.43PROTOCOL●2022年8月，德国癌症研究中心顾祖光在iMeta在线发表了题为“Complex heatmap visualization”的方法类文章。● 该研究系统性地介绍了 ComplexHeatmap R包在复杂热图可视化方面的特性和功能。●第一/通讯作者：顾祖光 (z.gu@dkfz.de)文章上线仅3个月，

MANOVA的前提假设 https://www.real-statistics.com/multivariate-statistics/multivariate-analysis-of-variance-manova/manova-assumptions/https://www.statology.org/manova-assumptions/它的计算方式是不同组样品之间的距离（或距离的排序）平方

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