写在前面因为我们测定的样本不总是可以匹配上的，但是最少的样本也不能太少，我们测定的三个样本做相关其实还是被质疑，但是测定了5或者6个重复，这个时候直接将样本比较多的样本过滤掉比较少的样本不...

R-loop是由RNA:DNA杂合链和非模板单链DNA构成的三链结构，广泛存在于从细菌到人类等物种的基因组中。R-loop结构主要随细胞转录活动产生，受细胞精细调控而处于高度动态变化当中。...

生物通路数据库简介什么是生物通路?生物通路是细胞内分子之间的一系列相互作用，导致细胞内的某种产物或改变。这种通路可以触发新的分子的组装，比如脂肪或蛋白质。通路也可以开启或关闭基因，或者刺激...

本文转自中国中医药报重要小贴士自2019年10月举办第一期中药整合药理学网络计算平台培训开始，已经走过了近两年的时间，在这期间我们成功举办了八期培训，在此期间，我们一直坚持小班教学，收效甚佳。TCMIP平台已经被188个国家或地区访问，利用平台发表科研论文200余篇c。2020年我们在Frontiers in Pharmacology(IF=5.81)推出了“整合药理学...

OMIM，即在线人类孟德尔遗传（Online Mendelian Inheritance in Man），是一个综合的、权威的研究人类表型和基因型关系的数据库，收录了所有已知的孟德尔疾病，和超过16000个基因的信息（涵盖一大半人类已知的基因）。 OMIM并不是创造了这些数据，而是对已发表的研究结果的非常系统的整理与整合，并每日更新、免费获取。OMIM中的一个常见的...

HelixFold-Single将自然语言处理领域的语言模型，应用在蛋白质上，构建了预训练语言模型，从3亿的无标注蛋白质数据中提取信息，建模蛋白质之间的关系，从而将MSA同源信息隐式的学习在语言模型中，进而有效地替代MSA信息检索模块，极大地提升了结构预测的速度。5个CDR loops倾向于采用通过序列相似性可以有效地进行预测，然而，重链的第3个CDR loop（CDR H3），由于其在序列和长度

‍‍近日，《Nucleic Acids Research》学术期刊在线发表了题为 ”CRAMdb: a comprehensive database for composition and roles of microbiome in animals” 的研究成果。该研究建立了动物宏基因组领域首个跨宿主、跨样本位点和跨表型比较的综合数据库CRAMdb（网址：http://www.ehbio.com

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流...

散点图散点图在生物信息分析中是应用比较广的一个图，常见的差异基因火山图、功能富集分析泡泡图、相关性分析散点图、抖动图、PCA样品分类图(后续推出)等。凡是想展示分布状态的都可以用散点图。...

SIFT 用计算机替代人预测复杂事件的影响，是我们这个时代最令人兴奋的科学进展之一。SIFT就是这样一个应用于基因组学研究的经典工具。 SIFT可预测多种生物体的基因组变异，主要是...