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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(七)-导入10X和SmartSeq2数据Tabula Muris

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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四)

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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(九)- Scater包单细胞过滤

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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三)

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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一)

在别人的电子书,你的电子书,都在bookdown一文中推荐过这一篇教程(https://hemberg-lab.github.io/scRNA.seq.course),从2016年一直更新到2018年,是入门单细胞分析的十分适合的文档。为了进一步促进学习,生信宝典申请并组织翻译这篇教程,将在公众号陆续推出。最后会有整合版以网页和PDF格式发布于易生信平台。关于课程采用高通量测序技术获取单细胞水..

典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - 数据获取到标准化

GEO是当今最大、最全的公共基因数据资源库,包括基因的表达、突变、修饰等信息,涵盖几乎所有的疾病,且单个实验检测样品数目较多,是我们分析、学习的很好资源。实验设计原始文章对14个溃疡性结肠炎病人 (Ulcerative colitis, UC)和15个克罗恩病病人 (Crohn’s disease, CD)的发炎组织和未发炎组织活检采样,用Affy芯片检测基因表达谱,研究发炎组织和未发炎组织的..

GEO TCGA公共数据挖掘培训

GEO是当今最大、最全的公共基因数据资源库,包括基因的表达、突变、修饰等信息,涵盖几乎所有的疾病,且单个实验检测样品数目较多。TCGA数据库包含11,000个病人的33种肿瘤的7个不同层面的基因数据 (包括基因表达、CNV,SNP,DNA甲基化,miRNA,外显子组等)和临床数据,意在解析癌症发生的分子机制、肿瘤的亚型和治疗靶点等。这两个来源的数据都是对外公开的,是学习、研究和应用的一个资源宝库.

iMetaOmics | 2025年8月数据分析报告:全文下载量超9万次

2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!iMetaOmics发行以来,147个国家或地区共下载了相关文章,其中中国(包括香港、台湾和澳门)下载量达45,029次,位居第一;” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响

2025 年5月 | 家系、肿瘤临床基因组/外显子组数据分析实战

为满足广大读者进一步学习的需求,易生信课程开发团队 (现运营《生信宝典》和《聊生信》两个公众号)经长期规划,筹备和专家研讨,现组织和开展临床基因组学专题培训课程,以便进一步普及和交流临床基因组学分析技术,手把手带您快速入门,节约宝贵的时间,助力科研成果早日产出。使用R语言等统计与可视化工具,绘制常用生信相关图形,包括:热图 (变异水平),maftools图 (基因水平),基因的结构、变异位置及结构

#数据分析#数据挖掘
Pathview包:整合表达谱数据可视化KEGG通路

是系统分析基因功能、基因组信息的数据库。它有助于研究者把基因及表达信息作为一个整体网络进行研究。KEGG将基因组信息和基因功能信息有机地结合起来,通过对细胞内已知生物学过程进行计算机化处理和将现有的基因功能解释标准化,对基因的功能进行系统化的分析。KEGG的另一个用途是将基因组中的一系列基因用一个细胞内的分子相互作用网络连接起来,如一个通路或是一个复合物,通过它们来展现更高一级的生物学功能。为什么

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