推荐大家购买最新的教程，若是已经购买以前WGNCA教程的同学，可以在对应教程留言，即可获得最新的教程。（注：此教程也仅基于自己理解，不仅局限于此，难免有不恰当地方，请结合自己需求，进行改动。psRobot_mir旨在从高通量测序数据中为一批输入序列寻找具有茎环前体的小RNA（如miRNA或shRNA）psRobot_map 用于在较长的参考序列中找到短序列（小于 40bp）的所有完美匹配位置；

Deepseek这久很火，在年后就说要本地部署Deepseek。但一直苦于没有时间，昨晚太累了，早早就下班，在下班前，将R1的模块在电脑中下载，我安装的R1-7B，差不多也就是4G+。因此，大家若是要部署自己本地，小杜也建议你在晚上下载R1模型。

本文介绍了基于R语言的Mime机器学习框架，用于构建和可视化临床特征预测模型。该框架支持上百种机器学习算法，可用于预后预测和特征选择。文章提供了详细的安装指南（包括Bioconductor和GitHub依赖包）及使用示例，展示了如何利用基因表达数据和临床信息构建预后模型。通过ML.Dev.Prog.Sig函数可筛选最优算法组合，并可视化模型性能（如C-index）和生存曲线分析。该工具特别适用于1

国家水稻数据中心是中国水稻研究所创建的一个以水稻为核心，服务于育种需求的大型数据库，数据包含种质、突变体、分子标记、基因、QTL、文献资源等。，主要发表或收录生物信息学的教程，以及基于R的分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；Oryzabase是一个综合性水稻科学数据库，该数据库最初旨在收集尽可能多的信息.水稻基因组注释项目数据库（RGAP），主要提供水稻基因组序列和注释数据。**5. 水稻遗

在11月中旬，我的M.2的硬盘突然间崩掉了，就是的那种莫名其妙的。但是，在11月份某一天，此盘的某两个文件夹无法访问（PS：以为是自己电脑的问题），但在第二天，全部磁盘文件无法访问。我基本全部的重要的数据都是放在这个盘里面，此外，我是基本没有做备份。但是，随着数据的不断增加，容量成了很大的问题，现在我需要扩容，以及将raid 1转为raid 5,涉及到以前套件也需要转移（PS:我的套件是安装在容池

在11月中旬，我的M.2的硬盘突然间崩掉了，就是的那种莫名其妙的。但是，在11月份某一天，此盘的某两个文件夹无法访问（PS：以为是自己电脑的问题），但在第二天，全部磁盘文件无法访问。我基本全部的重要的数据都是放在这个盘里面，此外，我是基本没有做备份。但是，随着数据的不断增加，容量成了很大的问题，现在我需要扩容，以及将raid 1转为raid 5,涉及到以前套件也需要转移（PS:我的套件是安装在容池

featureCounts是subread中脚本，可以使用subread流程进行定量，在这里直接使用前面mapped的bam文件进行转录本定量。，主要发表或收录生物信息学的教程，以及基于R的分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；因此，个人建议仍是获得count值，后再进一步的分析，这样的方法更利于下游分析。是stringtie软件中自带的获得转录本丰度的脚本，6.1中的。文件进行转录本表达量的

通俗讲，把比对到的某个基因的Fragment数目，除以基因的长度，其比值再除以所有基因的总长度。TPM的全称为Transcripts per million，Transcripts Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千个碱基的转录每百万映射读取的Transcripts)。自己也是这样的，一个人的时间和精力是有限的，我们不可能

此图也是实用性很强，80%的同学应该可以用得到，今天分享的只是学习笔记的一部分，后面会逐渐完善。既然是学习笔记，那么我们也有参考的教程，我们也会再文末附上参考的教程，大家也可以直接到对应教程中学习。，主要发表或收录生物信息学的教程，以及基于R的分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；有时候，我们在绘制火山图时，会出现X或Y轴坐标较大的现象，对火山图整体美观性较差，那么适当限制基因调整图形美观.在

给定一个排序的基因表L和一个预先定义的基因集S (比如编码某个代谢通路的产物的基因, 基因组上物理位置相近的基因，或同一GO注释下的基因)，GSEA的目的是判断S里面的成员s在L里面是随机分布还是主要聚集在L的顶部或底部。这些基因排序的依据是其在不同表型状态下的表达差异，若研究的基因集S的成员显著聚集在L的顶部或底部，则说明此基因集成员对表型的差异有贡献，也是我们关注的基因集。GSEA用来评估一个