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摘要背景深度学习是一种模仿大脑神经元构造的算法,近年来具有较高的热度,尤其是在自然语言领域、视觉领域等等。我们一般的学习过程是从机器学习算法,进阶到深度学习算法,但在后者中,常常会因为方法结果讨论...
【代码】mricrogl画图代码模板。

回归问题常用的就是线性回归。在R中用的是lm(),而python中都封装在scikit-learn里。一、数据准备用的是书上的housing数据,如下图:这个数据包含10个变量,一共有20640行,当然里面也有一些NA值。假如我们现在要研究median house value与哪些因素有关,并预测其值。对于这个问题,由于median house value是一个数值型变量,所以最适合用线性回归。分
最近在学习Nilearn包的使用,现将学习笔记和思考发布在这里,供大家参考。以下训练的数据均来自于官网的练习数据 haxby2001的数据一、导入核磁数据这个没啥特别的,指定图像地址就好了,唯一要注意的是,需要是4D的nii.gz文件格式,这个可以通过其他软件转换。#导入数据就是命名nii.gz的数据地址file_name = r'D:\jupyter\nilearn\haxby2001\subj

ubuntu最近更新到了20.04长期版,挺感兴趣,就自己重装了这个系统,然后安装了MRtrix3,准备研究下这个软件,下面把安装过程及我遇到的坑讲述一下,提供参考。我的系统:双系统,其中ubuntu 20.04,电脑型号:联想Y7000P先说下ubuntu的安装,我的电脑有独显,所以安装ubuntu的过程不太顺利,因为Linux与N卡有冲突。坑:用U盘作引导安装,刚开始就碰到了进不去安装界面,一
即:假设某个节点变化,它其实是多维度同步变化的,例如连接它的白质纤维束减少,它的皮层厚度就会降低(突触减少,神经元萎缩),并且它的功能bold信号也会有变化(当然不一定是降低,functional network没办法评估功能活动度降低)。Aaron Alexander-Bloch在他的文献中指出了,建议纳入age和gender去做结构协方差网络,因为皮层厚度与性别和年龄的关系最大(其中年龄为主要

from nilearn import datasetsdataset = datasets.fetch_atlas_harvard_oxford('cort-maxprob-thr25-2mm')atlas_filename = dataset.mapslabels = dataset.labelsprint('Atlas ROIs are located in nifti image (4D)
fMRIPrep是融合了FSL, AFNI, freesurfer,ants的pipeline。DPABISurf就是调用了fMRIPrep的workflow,基本可以这么说,DPABISurf的预处理都是fMRIPrep工作的。fMRIPrep的安装,可以看官网,https://fmriprep.org/en/stable/index.html也可以看看下面博主写的内容:https://zhua
最近几天没碰编程,浑身难受,日子过的浑浑噩噩,还是得每天接触下编程。相较于核磁分析,我感觉统计建模更对我的胃口。今天写卡方检验(χ2检验,chi-square test)。医学中最最常见的就是四格表的卡方检验,spss教材上计算四格表资料的卡方检验结果值有:Pearson chi-square 、Continuity correction 、Likelihood ratio 、 Fisher’s.