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R语言&Python GEO DataSets多个Series进行差异基因表达分析以及导入Excel到R的问题

引入GEO DataSets上,某些Series是由多个series组成的,比如GSE6834,由六个Series组成:This SuperSeries is composed of the following SubSeries:Less… Less…GSE6771Temporal Cortex Control (mesial temporal lobe epilepsy contr...

#r语言#python#开发语言
R语言 使用getGEO()直接进行差异表达分析并显示Entrez_id和Symbol_id

引入平常我们利用GEODatasets的表达量数据进行基因表达分析的时候,常常是下载表达矩阵,利用limma包进行分析,如果能找到注释包,那就把探针注释成Entrez_id或者是Symbol_id,如果找不到,那就下载对应GPL提供的注释文件,但是很可能还是不好注释,比如今天拿来做例子的GSE15222对应的GPL2700:我们看到这个GPL只提供了GB_ACC也就是Genebank的一个号码..

Hadoop HDFS追加文件内容appendToFile/append报错解决方案

Linux下Hadoop HDFS中追加文件内容使用appendToFile(Shell)或fs.append()(Java),遇到的几种报错情况,分别给出自己使用并成功的解决方案:Shell中报错:appendToFile: Not supported这种情况在网上几乎搜不到,直到换了伪分布式配置才不报这个错,之前是单点式配置状态。所以怀疑是单点式配置不能使用appendToFile操作。...

#hadoop#java#linux +2
到底了