在学习1中粗略地运行了一下软件的例子文件，但其中的很多东西都未能理解。该文中主要是对helper模块中代码的初步注释及学习以求能够熟练使用该软件。

可以看到，所有序列都存在一个“GTGTCAAATACTTATTTTCCCCGCTGTA”的前导序列，这可能是接头序列之类的，我们使用cutadapt工具将其去除。（注意：在使用samtools对bam文件进行索引之前必须对bam文件进行排序，否则会报错）不行，还是太大了，文件超过了三千万行，远超过了excel的处理能力，寻找其他方法进行统计。这是经公司使用fastp质控后的数据，我们先挑选部分数据

PennCNV学习

在学习1中粗略地运行了一下软件的例子文件，但其中的很多东西都未能理解。该文中主要是对helper模块中代码的初步注释及学习以求能够熟练使用该软件。

我们将介绍加载模型和预测突变影响的基本函数。

这个文章是学习与踩坑记录，包括一些处理流程以及遇到的坑的解决方法。

个体的杂合率偏差表明样品可能受到污染以及可能存在近亲繁殖。

再点进去之后就是每个芯片的分型数据，芯片的分型数据包含两个文件，即以Grn.idat和Red.idat结尾的原始分型文件， 即红光和绿光所在位置的测序文件。这个区域展示了SNP的信息，包括每个位点的染色体号，物理位置以及关键的每个个体在该位点识别的基因型。接着选择要分析的芯片的原始数据文件，注意这里只需要选择之前提到的以iDats结尾的文件夹即可。红框选择芯片对应的支持文件，这个文件可以在illu

第一步：进入DAVID网站后先择start analysis。1.选择upload2.在框框里粘贴要分析的目的基因集（也可以在下面以文件的形式上传）3.在Step 2:Select Identifier中选择与你上传的基因集的格式4.在Step 3：List Type中点第一个（就是要富集分析的基因集，第二个是支持自己上传背景基因集）5.在step4：Submit List中点击Submit Li