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R数据可视化|使用Scatterplot3d包制作3D散点图

介绍R 中有许多包(RGL、car、lattice、scatterplot3d等)用于创建3D 图形。本教程介绍了如何使用 R 的 scatterplot3d包 在 3D 空间中生成散点图。scaterplot3d 使用起来非常简单,可以通过在已经生成的图形中添加补充点或回归平面来轻松扩展。它可以很容易地安装,因为它只需要一个已安装的 R 版本。安装并加载 scaterplot3dinstall.

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#r语言#3d#机器学习
进化树构建之邻接法(Neighbor-Joining)的介绍

进化树构建进化树构建的问题是推断可能产生给定基因序列数据的进化树的拓扑结构和分支长度。推断树中叶节点的数量应等于给定数据中基因序列的数量。Neighbor-Joining AlgorithmNeighbor-Joining (NJ)树推理方法最初是由 Saitou 和 Nei 于 1987 年编写的。它属于一类基于距离的方法用于构建进化树。 NJ 方法采用给定序列之间的成对进化距离矩阵来构建进化树

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R数据可视化|使用Scatterplot3d包制作3D散点图

介绍R 中有许多包(RGL、car、lattice、scatterplot3d等)用于创建3D 图形。本教程介绍了如何使用 R 的 scatterplot3d包 在 3D 空间中生成散点图。scaterplot3d 使用起来非常简单,可以通过在已经生成的图形中添加补充点或回归平面来轻松扩展。它可以很容易地安装,因为它只需要一个已安装的 R 版本。安装并加载 scaterplot3dinstall.

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#r语言#3d#机器学习
Linux 文件内容大小写转换

一、文件如果是单个文件,用cat file | tr a-z A-Z > newfile可以将文件内容转换为大写。cat file | tr A-Z a-z > newfile可以转换为小写。也可以用awk '{print toupper($1)}' file > newfile二、vim编辑 vim中大小写转化的命令是:gu或者gU,形象一点的解释就是小u意味着转为小写,大U意

#linux#bash#编辑器 +1
转录组分析流程|数据处理与De novo组装(一)

title: 转录组分析流程|数据处理与De novo组装(一)tags:- 转录组组装- 教程- 软件- Trinity- Rcorrector- Trimmomaticcategories: 转录组分析转录组分析流程将分成三部分分别更新,更多内容关注我的个人博客定义转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非

#github#linux
物种内共线性分析——思路以及踩坑总结(二)

物种内共线性分析(MCScanX+BLAST+TBtools)数据要求:做物种内共线性分析的话主要需要的是全基因组序列、cds或pep序列、gff3/gtf序列三者缺一不可。上一节下载好了cds序列以及gff3序列文件,以此为例(数据可在Phyzome下载,也可以在服务器上在线下载)软件要求:MCScanX、blast、TBtools(JCVI)物种内blast物种内blast 使用cds或p..

#数据库#python#java +2
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