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【代码已开源】从QuPath标注到WSI组织分割

WSI Segmenter 是一个基于轻量化分割网络DeepLab v3架构的病理切片肿瘤区域分割工具,可实现切片中 ROI(感兴趣区域)的分割,支持 QuPath 软件(版本 >= 0.4.2);该工具使用预训练的 ResNet 作为骨干网络,通过深度学习算法实现肿瘤区域分割。

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#pytorch#人工智能#python +1
【代码已开源】基于Python的全切片(WSI)染色归一化工具/库,实现了reinhard, macenko, vahadane共三种方法,支持GPU加速,可通过pip安装

为了应对数字病理切片受到不同中心、不同扫描设备的影响,先后有不同的研究提出了针对病理图像的染色归一化(stain normalization)方法。本仓库对三种染色归一化方式进行了封装,针对常见的病理图片处理流程实现了染色归一化工具。

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#python#图像处理
【西瓜书/机器学习·周志华】西瓜书思维导图 - PRML Mind Map

提供了与examcoo上作业题相同的知识点范围(由粗体加粗),第一到九章的思维导图。

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#人工智能
【代码已开源】基于Python的全切片(WSI)染色归一化工具/库,实现了reinhard, macenko, vahadane共三种方法,支持GPU加速,可通过pip安装

为了应对数字病理切片受到不同中心、不同扫描设备的影响,先后有不同的研究提出了针对病理图像的染色归一化(stain normalization)方法。本仓库对三种染色归一化方式进行了封装,针对常见的病理图片处理流程实现了染色归一化工具。

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#python#图像处理
【代码已开源】从QuPath标注到WSI组织分割

WSI Segmenter 是一个基于轻量化分割网络DeepLab v3架构的病理切片肿瘤区域分割工具,可实现切片中 ROI(感兴趣区域)的分割,支持 QuPath 软件(版本 >= 0.4.2);该工具使用预训练的 ResNet 作为骨干网络,通过深度学习算法实现肿瘤区域分割。

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#pytorch#人工智能#python +1
【代码已开源】基于Python的全切片(WSI)染色归一化工具/库,实现了reinhard, macenko, vahadane共三种方法,支持GPU加速,可通过pip安装

为了应对数字病理切片受到不同中心、不同扫描设备的影响,先后有不同的研究提出了针对病理图像的染色归一化(stain normalization)方法。本仓库对三种染色归一化方式进行了封装,针对常见的病理图片处理流程实现了染色归一化工具。

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#python#图像处理
【CutMix实现/MixUp实现】TorchVision 0.16发布,一行代码实现CutMix/Mixup

使用最新的torchvision.transforms.v2调用CutMix和MixUp

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#pytorch
【西瓜书/机器学习·周志华】西瓜书思维导图 - PRML Mind Map

提供了与examcoo上作业题相同的知识点范围(由粗体加粗),第一到九章的思维导图。

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#人工智能
【WSI/QuPath】如何使用QuPath导出切片(patch/tile)

Qupath是病理领域常用的阅片和标注软件,本教程通过演示一个简单的QuPath支持的Groovy脚本,展示如何将高分辨率全视野切片(WSI,whole slide images)导出为不同分辨倍率下的patch(或称Tile),同时单张slide的导出平均耗时在15s以内。

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#图像处理
【ANTs】医学影像处理工具ANTs安装教程 - 快速安装,即插即用,无需编译

在这篇博客介绍了ANTs的一种简单的安装教程,它基于官方的Releases,只需要几步便可以完成。

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#linux#图像处理
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