当今世界,人工智能计算工具的快速发展,势必快速重塑各个学科领域研究及其产业应用的格局。合成生物学由于其在信息“设计”和数据“学习”方面的基本逻辑,必将迅速从中获益。为快速把握这一科学发展趋势,推动这一学科领域发展及应用,在中国生物信息学学会(筹)及一批院士、杰青专家学者共同推动下,2023年8月25日,由中国生物信息学学会(筹)主办,中国生物信息学学会(筹)计算合成生物学专业委员会、中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所、深圳合成生物学创新研究院、广东省生物信息学学会、广东省合成基因组学重点实验室、深圳合成基因组学重点实验室承办的第一届计算合生物学研讨会暨中国生物信息学学会(筹)计算合成生物学专委会成立大会在深圳成功召开。

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会议邀请了美国医学与生物工程院院士、深圳理工大学计算机科学与控制工程院院长、讲席教授潘毅教授,美国医学与生物工程院院士、深圳理工大学合成生物学院院长、讲席教授张先恩教授,中国生物信息学学会(筹)核心组成员陈铭教授等在内的一批国内该领域的顶尖专家学者,吸引了包括香港科技大学、北京大学、清华大学、浙江大学、西湖大学、复旦大学、上海交通大学、东南大学、吉林大学、江南大学、天津大学、电子科技大学、中山大学、南方科技大学、西北工业大学等全国各地近60个单位的200余名参会者。参会代表讨论积极,会议全程座无虚席,与会专家对于计算合成生物学未来发展表现出了高度的热情和信心。

本次会议主要聚焦蛋白设计和智能计算、DNA信息存储与关键使能技术、合成生物学大数据与应用等计算合成生物学相关领域,深度探讨计算合成生物学领域研究和产业热点,大力支持产业发展切实推进生物信息计算和合成生物学深度融合,进一步推动学术和企业共同成长和发展。

大会共计两天(8月25日-8月26日),在会议第一天上午首先举行了中国生物信息学学会(筹)计算合成生物学专委会成立大会,并邀请陈铭、潘毅和张先恩三位教授分别致辞,三位教授不仅谈到了合成生物学的发展现状,尤其讨论了人工智能如ChatGPT等大模型对计算合成生物学的指导作用,并指明了计算合成生物学的发展方向。

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紧接着,陈铭宣布了中国生物信息学学会(筹)计算合成生物学专委会的批复函,并在与会专家共同见证下,隆重举行了揭牌仪式。随后,陈铭代表中国生物信息学会(筹)为该委员会的主任以及各位委员颁发了相关证书。最后,计算合成生物专委会主任委员戴俊彪发表了感谢致辞,标志着中国生物信息学学会(筹)计算合成生物学专委会正式成立。

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在短暂的茶歇之后,第一届计算合成生物学研讨会拉开了帷幕。首场的报告由浙江大学王宝俊教授、云南师范大学尚轶教授、清华大学汪小我教授、清华大学刘凯教授、上海交通大学左小磊研究员、中科院杭州医学所韩达研究员进行分享。王宝俊教授展示了他在基因线路方面的研究成果,并利用基因线路进行生物计算方面的研究,报告内容丰富,研究前沿。尚轶教授为我们带来了他在植物酶改造方面的研究成果,他们团队具有完整的P450酶改良技术能够提高多种植物代谢产物的合成生产。汪小我教授报告了其提出的神经网络解释方法用于归纳和解释基因调控编码规则。刘凯教授向我们介绍了其在DNA存储方面的研究和开发特种材料的实际应用。左小磊研究员则报告了其对多维生物标志物分子的构建,及其开发了框架核酸传感器平台,用于疾病分型的分类器研制。韩达研究员分享了他们对DNA分子计算方法的研究,并能实现基于DNA分子计算的肿瘤早期诊断。在各位专家教授的精彩报告下,引起了在场其他专家学者的兴趣,与会者踊跃发言,热情讨论,为现场增添了一抹热烈的色彩。

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25日下午中科院先进技术研究院周佳海研究员、中国科学院微生物研究所吴边研究员、西湖大学卢培龙研究员、天津大学齐浩教授、华中科技大学刘士勇副教授、中国科学院武汉病毒研究所刘翟研究员、中国科学院天津工业生物技术研究所江会锋研究员、北京大学钱珑助理研究员围绕酶学机制的研究、蛋白质稳定性预测、跨膜蛋白的计算设计、遗传密码改造的无细胞蛋白设计合成和RNA-蛋白质互作的结构模型、DNA存储相关技术和方法展开了报告。

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在经历了前一天的会议后,与会人员热情依旧不减,会议进行到第二天,会场依旧座无虚席,大家积极交流,展现出持续的热烈投入和参与意愿。在上半场中有上海交通大学杨广宇研究员带来的基于微液滴的单细胞超高通量筛选和生物医药特种酶的高效创制的报告,中山大学巫瑞波教授介绍了他们团队构建的萜类数据库和基于量子力学-分子力学(QM/MM)模拟的酶催化机制解析与萜烯合酶重设计的内容,中国农科院基因组所刘永鑫研究员分享了他们团队对宏基因分析流程的搭建和宏基因组学技术的分享传播以及iMeta期刊的推广等一系列工作,浙江大学良渚实验室龚亮研究员介绍了纳米孔测序技术及其在医学基因组学中的应用。下半场由中国科学院天津工业生物技术研究所马红武研究员、北京大学林一瀚研究员、复旦大学李春贺副教授、清华大学张翀教授带来的精彩报告。会议内容涉及细胞工厂构建、合成基因线路、生物网络随机方法和机器学习在合成生物学DBTL中的灵活应用。

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最后,中国生物信息学学会(筹)计算合成生物学专委会主任戴俊彪教授对所有的与会专家和代表表达了感谢。他认为,随着人工智能技术的发展,计算合成生物学一定会在未来展现出更多的发展机遇。他同时呼吁未来更多的学者和专家参与到计算合成生物学这一领域的发展建设中来,积极组织讨论,为计算合成生物学研究及其产业应用贡献力量。

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经过两天的紧张而充实的交流,本次会议圆满结束。会议期间,各位专家学者、老师同学和研究者们积极参与,共同分享了各自的见解和研究成果,为会议增添了浓厚的学术氛围。与会者们就课题的前沿和难点进行了深入的讨论,不仅激发了思想的碰撞,也促进了学术观点的交流与碰撞。演讲嘉宾的精彩演讲为我们提供了新的思考方向,与会者的提问和互动更是为会议锦上添花。本次会议聚焦于行业的创新与发展,涵盖了广泛的领域,从技术前沿到实际应用,从学术理论到产业趋势。

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本次会议的成功召开对于促进生物信息计算和合成生物学的深度融合,推动计算合成生物学的未来发展与产业应用具有重要意义,将为中国生物经济的发展提供又一新的战略方向。

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期刊简介

“iMeta” 是由威立、肠菌分会和本领域数百位华人科学家合作出版的开放获取期刊,主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表原创研究、方法和综述以促进宏基因组学、微生物组和生物信息学发展。目标是发表前10%(IF > 15)的高影响力论文。期刊特色包括视频投稿、可重复分析、图片打磨、青年编委、前3年免出版费、50万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊发行!

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