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EST丨南京地湖所王建军-微塑料多样性增强了微生物网络的复杂性和稳定性

点击蓝字↑↑↑“微生态”,轻松关注不迷路生科云网址:https://www.bioincloud.tech编译:微科盟薇薇,编辑:微科盟居居、江舜尧。微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源《微生态》公众号。导读微塑料混合物广泛分布在全球生态系统中,包含各种类型。然而,微塑料多样性如何影响微生物的生物相互作用尚不清楚。本研究进行了600个微宇宙实验,微塑料多样性从1到6种类型不等,并在15°C

跟着iMeta学做图|用ggClusterNet绘制共现网络(Co-occurrence Network)

原始教程链接:https://github.com/iMetaScience/iMetaPlot/tree/main/221120ggClusterNet-occurrence_network如果您使用本代码,请引用: Zeyu Zhang. 2022. Tomato microbiome under long-term organic and conventional farming. iMet

iMeta 讲座9 | 文涛-ggClusterNet在微生物组网络分析中的应用

iMeta典型文章系列讲座九ggClusterNet在微生物组网络分析中的应用01报告人简介文涛南京农业大学文涛,博士毕业于南京农业大学,目前在南京农业大学沈其荣院士课题组任钟山青年研究员。在Nature Communications, ISME J, Microbiome, Protein&Cell, New Phytologist, iMeta, Fundamental Resear.

一文学会网络分析——Co-occurrence网络图在R中的实现

作者:陈亮 单位:中科院微生物所编者按:上个月菌群月坛,在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验,不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识,更使我手上一个关于菌根的课题有极大的启示...

MPB:上海交大肖湘组分享基于基因芯片的海洋微生物转录组学分析技术

为进一步提高《微生物组实验手册》稿件质量,本项目新增大众评审环节。文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见。公众号格式显示略有问题,建议点击文末阅读原...

#数据可视化#人工智能#编程语言 +1
Pathview包:整合表达谱数据可视化KEGG通路

Pathview是一个用于整合表达谱数据并用于可视化KEGG通路的一个R包,其会先下载KEGG官网上的通路图,然后整合输入数据对通路图进行再次渲染,从而对KEGG通路图进行一定程度上的个...

经典入门 | 高级转录组分析和R数据可视化 (2024.4)

福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现安排《高级转录组分析和R数据可视化》于2024年4月19-21线上/线下课程 (线上课是通过腾讯会议实时直播线下课,实时互动,并录制有视频回放,无限期观看)。报名参加线上直播课的老师可在365天内选择参加同课程的一次线下课。期待和大家的线上线下相识。相关课程转录组线上/线下开课时间:2024/04/19-2024/04/21临床基.

#信息可视化#r语言#开发语言
易生信高级转录组分析和数据可视化第9期课程开课啦!!

常规转录组是我们最常接触到的一种高通量测序数据类型,其实验方法成熟,花费较低,以后应该就如做个PCR一样常见。而且分析思路简洁清晰,是入门生信,学习生信分析思路的首选。数据分析是相通的,...

Protein Cell:基于R语言的微生物组数据挖掘最佳流程(大众评审截止14号晚6点)...

Protein & Cell综述:基于R语言的微生物组数据挖掘的最佳流程近日,中国农业科学院刘永鑫组联合南京农业大学袁军组在国际期刊 Protein & Cell (IF = 15.3) 发表了题为”“The best practice for microbiome analysis using R”的综述论文,建立了微生物组分析的R语言代码库EasyMicrobiomeR,助力微

#r语言#数据挖掘#开发语言 +1
iMetaMed | 香港大学袁硕峰组-人工智能革新抗感染药物研发-药物研发

通过系统性地应对上述挑战,即全面提升数据质量、持续增强模型泛化能力、有效提高可解释性以及优化药物研发工作流的集成度,AI有望更为高效地赋能抗感染药物研发的各个关键环节,从而显著提升研发效率与成功率,最终将有力推动整个抗感染领域的重大革新,尤其在应对突发公共卫生事件方面将展现出其无可比拟的巨大潜力。2022年2月正式创刊!人工智能(AI)技术正为抗感染药物研发带来新的突破,面对日益严峻的耐药性挑战,

#人工智能
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