点击蓝字 关注我们从机理到应用：几何深度学习解密光控反硝化微生物组iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.162●2024年1月6日，清华大学刘锐平团队在iMeta在线联合发表了题为 “From mechanism to application: Decryptinglight‐reg..

植物与微生物互作过程中，发生着复杂而精妙的化学交流。综述系统总结了植物根系分泌物和微生物代谢物的分类、组成及其影响因素，强调构建并完善植物和微生物代谢物数据库可为全方位洞悉植物-微生物互作机制提供基础。最后，综述展望了耦合多组学技术与人工智能方法（如机器学习）的应用前景，以深入解析微生物间及植物-微生物间的代谢信号网络和关键调控基因。该论文系统梳理了近年来植物根系分泌物和微生物代谢物在植物-微生物

点击蓝字 关注我们基于深度学习的CRISPR/Cas12a检测体系crRNA智能设计iMeta主页：http://www.imeta.science方法论文● 期刊：iMeta [IF 23.7]●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.214●2024年6月15日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所王鑫杰、军事科学院军事医学研究院生物信息中心王升启团队在i..

大语言模型改善病毒蛋白注释Large language models improve annotation of prokaryotic viral proteinsResearch Article，2024-1-29，Nature Microbiology， [IF 28.3]原文链接：https://www.nature.com/articles/s41564-023-01584-8第一作者.

文章目录可重复、可交互、适用范围广和可扩展的微生物组数据科学——QIIME 2作者名单作者单位热心肠导读正文附图1. QIIME 2系统的示意图图1. QIIME 2提供多种交互式可视化工具图2. 迭代记录数据来源确保分析可重复附图2. QIIME2的各种使用界面数据可用代码可用额外信息附图3. QIIME2文档类型qza/qzv和结构在线方法提取QIIME2的存档内容Reference猜你喜欢写

2019年5月25日，我应邀参加在人民大学召开的R语言大会。《5月24-26日，第12届中国R会议（北京）可视化专场》作题为《R语言在宏基因组数据统计分析及可视化中的应用》。虽然报告时间是早点8点半，但现场坐无虚席，后面过道都站满了人。现在80多位朋友也通过面对面建群的方式获得了课件。后来有朋友联系我索要报告PPT，还告诉了我报告有在线视频。现将报告的PPT和现场转播的视频分享给大家。...

文章目录antiSMASH数据库第2版：次级代谢产物生物合成基因簇的综合资源划重点摘要背景材料与方法基因组数据的选择antiSMASH注释和数据导入结果与讨论表1. antiSMASH数据库基因簇统计与第一版比较表2. antiSMASH数据库第1/2版各类基因簇数量和增加幅度图1. 数据库的统计摘要结论数据和代码参考文献猜你喜欢写在后面之前我们介绍过《antiSMASH：微生物次生代谢物基因..

文章目录QIIME2：可重复、可交互、适用范围广和可扩展的微生物组数据科学摘要正文图1. 交互式可视化工具图2. 迭代记录数据来源确保分析可重复代码可用在线方法提取QIIME2的存档内容附图附图1. QIIME2原理图附图2. QIIME2界面各类附图3. QIIME2文档类型和结构作者列表单位列表Reference猜你喜欢写在后面2010年发表于Nature Methods的QIIME[发音同.

文章目录简介文章简介主要功能模块16S多样性分析展示数据上传及格式要求数据完整性检查数据过滤数据标准化分析主界面可视化堆叠柱状图交互饼形图Alpha多样性Beta多样性核心微生物组热图聚类聚类树图相关分析模式搜索单变量分metagenomeSeqRNAseq方法LEfse分析随机森林功能预测结果导出总结猜你喜欢写在后面陕西省微生物研究所 常帆主要研究方向为土壤微生态，同时负责服务器维护和相关流..

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