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QIIME 2教程. 27参考数据库DataResources(2024.2)

数据资源 Data resourceshttps://docs.qiime2.org/2024.2/data-resources/q2-feature-classifie使用的分类学分类器Taxonomy classifiers for use with q2-feature-classifier严重警告: 可与q2-feature-classifier一起使用的预训练分类器目前存在安全风险。如果

ARGfams: 一种适用于环境样本抗生素抗性基因快速注释与新基因发现的工具与数据库资源...

点击蓝字关注我们标题:ARGfams: 一种适用于环境样本抗生素抗性基因快速注释与新基因发现的工具与数据库资源作者:鞠峰(研究员)、黄昕瑜(博士生)作者单位:西湖大学环境微生物组与生物技术实验室抗生素和其他抗菌药物是现代医药成功发挥疗效的关键所在,它们显著改善了人类和动物的健康。然而,抗生素过度使用和误用导致疗效降低。目前抗生素耐药性已成为了全球卫生、食品安全和发展的最大威胁之一(世界卫生组织WH

#数据库
中国核酸数据库GSA数据提交指南

文章目录中国核酸数据库GSAGSA 数据模型数据触发机制说明发布策略和免责声明如何提交数据到GSA?第一步: 注册账户第二步:进入GSA数据库创建GSA1. 创建项目(BioProject)2. 创建样本(BioSample)3. 构建GSA数据集数据追踪引用格式附录计算MD5值官方推荐不同平台使用的工具压缩fq文件提交数据文件如何命名?ftp提交数据猜你喜欢写在后面中国核酸数据库GSAhtt..

一个 R 包带你挖掘宏基因组公共数据库

本文转自“生信菜鸟团”,已获授权背景介绍目前虽然已经有越来越多的宏基因组数据被上传到公共数据库,但由于种种原因(比如,需要消耗更多计算资源,不同研究之间的表型信息定义或格式不同等等),导...

扩增子分析QIIME2(2018.6). 1简介和安装

扩增子分析QIIME2. 1简介和安装QIIME2版本 2018.6简介优点学习思路什么是QIIME 2?核心概念安装原生安装QIIME2虚拟机安装使用VirtualBox方式安装亚马逊云安装使用Docker方式安装QIIME 2 2018.6版本核心插件附1. 核心概念数据文件: QIIME 2文件数据文件:可视化语义类型插件方法和可视化下...

QIIME1.9.1-1虚拟机安装配置及挂载外部目录

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Windows不用虚拟机或双系统,轻松实现linux shell环境:gitforwindows

windows缺少shell命令支持用过Linux服务器分析数据的小伙伴,一定对Linux强大Shell命令所折服,经常会感觉windows缺少这些命令而感觉不方便。还有想学习Linux Shell命令的小伙伴,一直没有一个很好的学习环境。双系统安装涉及分区改变对硬盘数据不安全,虚拟机效率太低,服务器也是不每个人都会买的。现在方便了,Github推出了一款软件 gitforwind...

Windows10安装Linux子系统Ubuntu 20.04LTS,轻松使用生信软件,效率秒杀虚拟机

很多优秀的生物信息学软件,如QIIME、QIIME 2、LEfSe等没有Windows版,而使用VirutalBox虚拟机不仅效率低,而且挂载外部硬盘和使用中也经常遇到各种问题,配置和使...

QIIME 2用户文档. 1简介和安装(2018.11)

文章目录写在前面QIIME 2优势入门指南什么是QIIME 2?核心概念安装原生安装QIIME 2虚拟机安装使用VirtualBox方式安装亚马逊云安装使用Docker方式安装QIIME 2 2018.11版本核心插件附1. 核心概念数据文件: QIIME 2文件数据文件:可视化语义类型插件方法和可视化下一步附录2. 名词解释Glossary附录3. 常用的语义类型semantic types为什

Docker的基本使用-Ubuntu18.04

Docker简介与安装Docker简介Docker安装启动和关闭Docker服务Dokcer使用Docker基本命令ASaiM微生物组分析框架Reference猜你喜欢写在后面Docker简介与安装Docker简介Docker是一种轻松级虚拟机,在生物信息数据分析中,布置分析流程、解决软件依赖关系中应用广泛。本文以最新的Ubuntu ...

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