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MicrobiomeStatPlot | 稀疏偏最小二乘回归分析教程sPLS

稀疏偏最小二乘法简介最小二乘法,又称最小平方法,是一种数学优化建模方法。它通过最小化误差的平方和寻找数据的最佳函数匹配。利用最小二乘法可以简便的求得未知的数据,并使得求得的数据与实际数据之间误差的平方和为最小。偏最小二乘(PLS)最大化潜在变量之间的协方差,而不是相关性,它能够同时对多个响应变量进行建模,并处理嘈杂的相关变量,但在对高维数据进行操作时,其可解释性受到影响。sPLS(稀疏偏最小二乘法

#回归#kotlin#数据挖掘 +2
Nature Microbiology | 房刚组-长读长宏基因组学用于粪菌移植后的菌株追踪

研究论文● 期刊: Nature Microbiology(IF 19.4)● 原文链接: https://www.nature.com/articles/s41564-025-02164-8● DOI: https://doi.org/10.1038/s41564-025-02164-8●第一作者:范宇 ●通讯作者:房刚(gang.fang@mssm.edu)●主要单位:纽约西奈山伊坎医学院 (

Nature Microbiology | 昆士兰郭建华组综述短链气态烷烃的微生物氧化

然而, Halobacteriota的其他类群,如Archaeoglobi、Hadesarchaea和Methanoliparia,所含的酶与典型的MCR不同,但在系统发育上与厌氧SCGAs氧化菌的ACR相关。,如乙烷、丙烷和丁烷,是天然气的主要成分,作为间接的温室气体,它们的排放对全球空气质量及对流层化学有着重要的影响。本文综述了近年来在好氧和厌氧烷烃氧化微生物研究中的新发现,强调了其对气候的影

MicrobiomeStatPlot | 物种组成整体比较堆叠柱状图

物种组成整体比较堆叠柱状图简介在微生物组分析中,常进行组间物种不同分类级别组成比较,同时每个组内又有多个样本,为了比较分组之间的整体微生物组成变化,会将分组内的所有样本的微生物相对丰度求平均值,用堆叠柱状图进行展示,这样能够从整体上观察组间微生物组成变化。进一步可以用统计检验(比如wilcox检验)检验组间差异是否显著。标签:#微生物组数据分析 #MicrobiomeStatPlot #物种组..

Nature Microbiology | Segata组-两万人的纯素食、素食和杂食饮食的肠道微生物的特征及相关的健康结果...

研究论文●期刊:Nature Microbiology(IF:20.5)● DOI:https://doi.org/10.1038/s41564-024-01870-z●原文链接:https://www.nature.com/articles/s41564-024-01870-z● 第一作者:Gloria Fackelmann●通讯作者:Nicola Segata(nicola.segat...

Nature Microbiology | 种子携带细菌通过生态位分化和促生机制驱动小麦根际微生物群的组装

研究论文● 期刊:Nature Microbiology(IF:20.5)● DOI:https://doi.org/10.1038/s41564-025-01973-1● 原文链接:https://www.nature.com/articles/s41564-025-01973-1● 第一作者:Daniel Garrido-Sanz● 通讯作者:Daniel Garrido-Sanz(danie

MicrobiomeStatPlot | 矩形树图教程Block Treemap tutorial

矩形树图简介矩形树图由一组矩形组成,这些矩形代表数据中的不同类别,其大小由与各自类别相关的数值定义。例如,一幅树状地图可以显示地球上的大陆,根据它们的人口大小。为了进行更深入的分析,树图可以包括嵌套的矩形,即类别中的类别。在我们的示例中,在每个大陆矩形中,新的矩形可以代表国家及其人口。树状图(treemap)将分层数据显示为一组嵌套矩形。每组由一个矩形表示,该矩形的面积与其数值值成正比。树状图的主

Nature Reviews Microbiology | 早期地球环境与微生物生命的共同进化

综述论文●期刊:Nature Reviews Microbiology(IF:69.2)● DOI:10.1038/s41579-024-01044-y●原文链接: https://www.nature.com/articles/s41579-024-01044-y● 第一作者:Timothy W. Lyons & Christopher J. Tino●通讯作者:Timothy ...

Microbiome | 中国农科院植保所刘文德团队揭示核心微生物菌群通过诱导宿主代谢提升玉米抗病能力...

芽孢杆菌是诱导抗病玉米品种代谢以抵抗茎基腐病的核心菌群Article,2024-08-23,Microbiome,[IF 13.8]DOI:https://doi.org/10.1186/s40168-024-01887-w原文链接:https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-024-01887-w第一作者

Microbiome|中科院深圳先进院马迎飞团队通过宏基因组分析揭示了三种哺乳动物模型中的肠道病毒的多样性

点击蓝字↑↑↑“微生态”,轻松关注不迷路生科云网址:https://www.bioincloud.tech编译:微科盟 洒脱点,编辑:微科盟居居、江舜尧。微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源《微生态》公众号。导读背景:肠道病毒组在塑造宿主微生物群中起着关键作用。然而,不同哺乳动物模型中的肠道病毒及其与人类肠道微生物群的联系在很大程度上仍是未知。结果:研究者从宏基因组中分别鉴定小鼠(hcMG

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