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空间转录组分析流程(使用Seurat对空间数据集进行分析)

使用Seurat对空间数据集进行分析,可视化和集成1、介绍本教程演示了如何使用Seurat(> = 3.2)分析空间分布的RNA-seq数据。尽管分析流程类似于单细胞RNA序列分析的Seurat工作流程,但我们引入了更新的交互作用和可视化工具,特别着重于空间和分子信息的整合。本教程将涵盖以下任务,我们认为这些任务在许多空间分析中都是常见的:Normalization标准化Dimensiona

#r语言
报错:ERROR: lazy loading failed for package

ERROR: lazy loading failed for package常用的服务器崩了 只能换台服务器,新的服务器好多R包都没有安装,今天安装DESeq2居然报错了各种R包,如果不在R语言官网上,那它极有可能在Bioconductor或者Github上我是用的以下安装方法,然后报错BiocManager::install('DESeq2')然后我使用Github(https://github

#r语言
SeuratData安装得用devtools安装

报错:或者用Bioconductor下载也会出现上图的报错解决方法:先下载devtools包然后通过devtools下载:library("devtools")devtools::install_github('satijalab/seurat-data')就可以下载成功啦!

#r语言
Error in h(simpleError(msg, call)) : error in evaluating the argument ‘con‘ in selecting a method

报错Error in h(simpleError(msg, call)) :error in evaluating the argument 'con' in selecting a method for function 'import': invalid class “GFF2File” object: undefined class for slot "resource" ("charact

#经验分享
到底了