MEGA7.0使用NJ法（Neighbor-Joining Algorithm，邻接法）构建系统发育树；IQtree使用ML法（Maximum likelihood，最大似然法）构建系统发育树

figtree是一款用于进化生物学的进化树作图软件，常用于进化树的美化，可以设置颜色、名称、样式等参数

编码同一氨基酸的不同密码子互为同义密码子，不同的同义密码子被使用的频率并不一样