logo
publist
写文章

简介

该用户还未填写简介

擅长的技术栈

可提供的服务

暂无可提供的服务

生物信息中的Python 03 | 自动化操作NCBI

相信大家在上一文中下载fasta的时候还没有感觉到下载是多么复杂,但是对于分析比对多个序列文件时,这个工作量说多了都是泪。比如,老板让你比对自己测定序列与 NCBI 库中序列,并构建相应的进化树,而这个序列需要大于100条。我想你的心情不会和下载一条序列时那么平静,那么,接下来通过BioPython提供的接口来实现快速的自动化序列下载。一、Entrez 库1.1 Entrez 介绍Entr...

保姆级 IGV 基因组浏览器使用指南(图文详解)

一、软件下载http://software.broadinstitute.org/software/igv/download这里以下载 Windows 版本为例,下载带有 Java 的版本,方便安装。由于大部分数据是通过服务器跑出的结果,所以也有小伙伴有在 Linux 服务器端使用的需求。这里推荐几种方式:配合远程控制软件来使用,国产推荐 Todesk,向日葵话说目前有部分单位禁止远程软件,推荐结

文章图片
最新最全 VSCODE 插件推荐(2026版)

文章目录一、主题及图标GitHub ThemeMaterial ThemeMaterial Icon Themevscode-icons二、功能强化settings syncwakatimePolacodeChinese (Simplified) Language Pack for Visual Studio Code三、Git 集成插件GitHub Pull requestsGit GraphC

文章图片
#vscode#前端#python +1
基因组注释文件(GFF,GTF)下载的五种方法

文章目录NCBIEnsemblUCSCGeneCodeNCBINcbi 里包含现在最全的参考基因组数据,可以进入FTP站点查看:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/这里的文件夹名为物种的拉丁名,这里以 Human(Homo_sapiens) 为例,下载方法如下:wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/Homo_sa...

Mysql报错:1030 Got error 28 from storage engine

原因磁盘临时存储不够解决方法一:清空/tmprm -rf /tmp/*方法二:修改my.cnf中的tmpdir参数,指向具有新的暂存目录

一文读懂 Agent Skill 编写和使用

Skill 可以理解为专业技能的一系列文本表示。比如一个程序员,就需要具备设计架构,编写代码,调试 bug 的配套技能。提示词和 SKILL 分不清楚,为什么要这么多事?—— 像你去餐厅点菜:“我要一份番茄牛肉面,少辣,多加葱。—— 像餐厅后厨的一整套出餐流程:“接单 → 准备食材 → 煮面 → 炒汤底 → 控制火候 → 摆盘 → 检查口味 → 出餐。Prompt 是“这次怎么做”;Skill 是

文章图片
生物信息学数据库及在线工具汇总 (更新)

文章目录核酸数据库非编码RNA数据库1.非编码小RNA数据库2.长非编码RNA数据库:3.非编码RNA家族数据库4.非编码RNA序列数据库蛋白质数据库0.蛋白质信息1.蛋白序列数据库2.蛋白质结构数据库3.蛋白组数据库4.蛋白质功能域数据库5.蛋白互作数据库代谢数据库1.代谢途径数据库2.代谢组学常用数据库3.表型数据库序列比对1.序列与数据库比对2.多序列间比对3.序列进化树分析基因分析0.基因

#数据库
生物信息之多序列比对,进化树分析,保守位点分析

序列下载与整理网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene下载fasta格式序列输入你想查找的序列,比如Syp基因 进入基因详细信息页面 点击Genbank 如图所示可以下载到fasta格式的序列,注意这里下载的是基因或者蛋白质的全序列 假如你希望得到promoter的基因,可以在如图所示的位置输入起始位点和终止位点一般promoter的位点不确定,可以通过将起

一步一步带你安装并解构 Hermes Agent (图文详解)

如果把 DeepSeek,ChatGPT 比作“江湖百晓生”,那简而言之就是:“Hermes Agent 是一个让 AI 不只会聊天,还能真正帮你“办事”的智能代理框架。有意思的事,Hermes 指的就是希腊神话中的赫尔墨斯,玩过战神游戏,看过奥林匹斯星传的老铁应该不陌生。他是希腊众神中速度最快的神,有“快速传递信息、连接不同系统、执行任务”的含义。这也是作者使用 Hermes 命名的用意。

文章图片
一文读懂 Agent Skill 编写和使用

Skill 可以理解为专业技能的一系列文本表示。比如一个程序员,就需要具备设计架构,编写代码,调试 bug 的配套技能。提示词和 SKILL 分不清楚,为什么要这么多事?—— 像你去餐厅点菜:“我要一份番茄牛肉面,少辣,多加葱。—— 像餐厅后厨的一整套出餐流程:“接单 → 准备食材 → 煮面 → 炒汤底 → 控制火候 → 摆盘 → 检查口味 → 出餐。Prompt 是“这次怎么做”;Skill 是

文章图片
    共 62 条
  • 1
  • 2
  • 3
  • 7
  • 请选择