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学计算机离不开 Linux 系统,当然,更离不开Windows。但是,二者从操作到核心的不同,貌似让鱼和熊掌不可兼得。但是!微软已经拿出了一款让鱼和熊掌兼得的方案 WSL (Windows Subsystem for Linux),也就是 Windows 系统中自带 Linux 子系统。这比其他方案的优势在于:不会产生传统虚拟机或双启动设置开销实现 Windows 系统与 Linux 系统磁盘资源
一、介绍生信流程搭建一般有 Shell,Python,Galaxy等流派,为了去尽可能的了解生信流程的搭建过程及压榨计算机性能。我这里使用 Nextflow 作为流程搭建工具,它有着很多强大的功能:简化数据密集型pipelines的编写胶水特性:只要可以在Linux系统中运行的程序或不同的编程语言脚本,都可以放在流程中支持并行计算环境支持集群可重用性高二、安装使用conda 安装安装 conda
主角为 `sort(sortby)`参数 `sortby` 是一个比较函数,该函数要比较两个值(a,b),返回值用来描述两个值的大小,具体规则为:- a < b,返回负值,排序后, a 在 b 之前- a = b,返回 0- a > b,返回正值,排序后, a 在 b 之后
一、命令格式:scp 文件/目录路径名 root@ip地址:文件/目录路径名1、从远程服务器复制文件到本地scp root@183.175.59.73:/home/data ./data/2、从本地文件复制到远程服务器scp ./data/ root@183.175.59.73:/home/data3、从远程服务器复制目录到本地scp -r root@183.175.59.73:/home/dat
Linux 挂载大硬盘1. 先做引导和分区2TB以上的使用 parted 命令# parted /dev/sda(parted) mklabel gptWarning: The existing disk label on /dev/sda will be destroyed and all data on this diskwill be lost. Do yo...
1. 下载官网下载:http://downloads.asperasoft.com/en/downloads/8?listcsdn下载:https://download.csdn.net/download/u011262253/104022592. 安装$ tar -zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz$ ./aspera-...
学计算机离不开 Linux 系统,当然,更离不开Windows。但是,二者从操作到核心的不同,貌似让鱼和熊掌不可兼得。但是!微软已经拿出了一款让鱼和熊掌兼得的方案 WSL (Windows Subsystem for Linux),也就是 Windows 系统中自带 Linux 子系统。这比其他方案的优势在于:不会产生传统虚拟机或双启动设置开销实现 Windows 系统与 Linux 系统磁盘资源
一、 序列数据的下载在开始了解序列的处理流程时,我们先要知道序列下载网址。其中一个知名的网站就是NCBI (National Center for Biotechnology Information)美国国立生物技术信息中心。1、通过如下的网站进入 NCBI ,可以看到它包含许多的子库,其中 Gene 就是我们一般下载基因序列的库,接下来,在后面的输入框输入 oct4 并点击 Search。...
1. 介绍2. 安装2.1下载2.2 解压2.3 设置环境变量3. 使用3.1 命令3.1.1 必需参数3.1.2 可选参数(常用)3.2 构建索引3.2.1 官方索引3.2.2 自建索引3.3 例子3.3.1 例子:M. musculus, UCSC mm101. 介绍Bowtie2 是将测序reads与长参考序列比对工具。适...
1、登录或注册用户网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/2、进入SRA网址:https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/向下滚动,找到Sequence Read Archive (SRA)工具,点击Submit2、新建提交3、按要求填写信息4、使用ascpascp -i /mnt/h/work/aspera.openssh -QT -l