分类：数据库使用指南阅读()收藏▌数据库概览THANATOS数据库（THeAutophagy,Necrosis,ApopTosisOrchestratorS）收录细胞凋亡、自噬和程序性坏死调控相关蛋白及其翻译后修饰信息。基于PubMed文献报道中4,237个实验鉴定的自噬和细胞死亡调控相关蛋白质信息，其中3,882个蛋白质来自于8个模式生物，即H. sapiens（Homo sapien, 人），

SEER 数据库是由美国国立癌症研究所于 1973 年建立，是美国常用的癌症数据库，里面包括各式各样的肿瘤类型，如肺癌、乳腺癌、胃癌、结直肠癌、前列腺癌等等。主要提供了各式各样的临床资料，如性别、年龄、TNM 分期等，收集过临床数据的小伙伴都懂得收集数据是一件多么费时且痛苦的事。以下是官网地址：见文末在详细介绍之前，放上一组数据让大家直观感受下 SEER 数据库的魅力：图片来源：网页截图图片来源：

数据挖掘技术可以从大量数据中寻找潜在有价值的信息，主要分为数据准备、数据挖掘、以及结果表达和分析。数据库技术是研究、管理和应用数据库的一门软件科学。通过研究数据库的结构、存储、设计、管理和应用的基本理论和实现方法，对数据库中的数据进行处理和分析。本文我们将介绍几种数据库和数据挖掘技术，帮助临床研究人员更好地理解和应用数据库技术。目 录1. 前言2. 医疗公共数据库概述2.1 SEER数据库2.2

医学工作者做完医学实验后，少不了要对收集的实验数据进行数据分析。通常来说，常用的数据分析方法有以下六种：聚类分析、因子分析、相关分析、对应分析、回归分析、方差分析。1、聚类分析(Cluster Analysis)聚类分析指将物理或抽象对象的集合分组成为由类似的对象组成的多个类的分析过程。聚类是将数据分类到不同的类或者簇这样的一个过程，所以同一个簇中的对象有很大的相似性，而不同簇间的对象有很大的相异

GetData Graph Digitizer是一款经典的图像数字化工具，能够将图像进行数字化，即从图片中获取原始（x,y）数据，支持TIFF、JPEG、BMP以及PCX四种图像格式，并且可以将获取的数据导出为txt、xls、xml、dxf以及eps格式文件。GetData Graph Digitizer主要特性1、支持的图形格式有TIFF，JPEG，BMP和PCX；2、两种自动数字化算法；3、方

本文主要包含以下内容：1 添加文本2 添加时间和日期3 希腊字母的标注4 带有上标（下标）的标注5 Origin 自带的特殊符号标注6 Origin数据图坐标刻度值特殊标注图片来源：Ren, Y., Zou, Y., Liu, Y. et al. Synthesis of orthogonally assembled 3D cross-stacked metal oxide semiconduct

我们在做qPCR的时候首先需要的就是设计引物。设计引物的软件有很多的。而这次介绍的这两个MRPrimerW2是一个用来设计引物的软件。MFEprimer是一个可以用来评估引物质量的数据库。数据库地址见文末MPRrimerW2MPRrimerW2支持九个物种的引物设计网站。我们可以通过输入基因名/fasta序列格式来设计引物的数据库。另外这个网站可以一下子输入很多的基因，来一次性的设计很多基因的引物

在整个基因转录翻译的过程当中，基因是在细胞核发生转录，然后出核到细胞质当中发生翻译。对lncRNA而言，由于lncRNA的功能主要还是通过影响其它基因来实现的。所以lncRNA在不同的位置影响的功能肯定也是不一样的。如果在细胞核，就是参与转录调控了，经典的方式还是影响ceRNA的方式来进行调控；而如果在细胞质的话，那就参与转录后调控了，比如和mRNA形成互补双链来增加mRNA的稳定性。所以在研究l

KOBAS（KEGG Orthology Based Annotation System），，是由北京大学魏文丽课题组开发的数据库，主要功能是用于基因/蛋白质功能注释和功能富集。随着数据量不断增加，KOBAS至今为止共经历了3次升级，除了1.0版本的KEGG代谢通路之外，2.0版本增加了PID Curated，PID BioCarta，PID Reactome，BioCyc，Reactome和Pa

按照上图的展示，目前的ENCODE通过多种测序数据来反应基因组变化的过程，分别是通过Hi-C 来观察三维基因组ATAC-seq/chip-seq 研究基因的转录调控甲基化芯片来研究甲基化的调控作用RNA-seq 来研究基因表达的变化RIP-seq 研究在转录后调控的信息我们可以通过ENCODE数据库来检索自己想要的数据。类似很多转录调控数据库也是在ENCODE数据库获得目标原始数据后，进行分析后构