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识别和控制混杂(一)控制混杂的必要性和原理混杂是一种由于暴露因素对某疾病的作用与其他病因对同一疾病的作用在同一个研究里交织在一起所引起的在暴露效应估计上的误差。混杂是一种偏倚,一种在暴露与结局关系上的偏倚,混杂因素必须同时具备一下三个条件(图2):一、是疾病确定的病因或危险因素,即图2里性别必须是肺癌的真正病因或危险因素;二、不是暴露和疾病关系之间的中间因素,如性别不可能是吸烟和肺癌之间的中间因素

目前组学的数据越来越多。其中代谢组学也是其中一个热点。关于代谢组学的相关分析目前用的最多的还是MetaboAnalyst。之前这个数据库一直都是4.0版本。最近刚刚更新了5.0的版本。趁着刚刚更新,我们也就来顺带的介绍这个数据库吧。PS: 从18到现在被引次数就到了1700。可见这个数据库的权威以及研究代谢的人多呀关于MetaboAnalyst。其主要是基于作者开放的一个R语言包MetaboAna
近几年,单细胞的研究蔚然成风,受到很多科研人员的青睐。小编为大家整理了迄今为止,最全的单细胞线上数据库,可以帮助你更准确地进行细胞注释和分析,也可以用作研究前期的数据探索。单细胞数据库分类Human Cell Landscape (HCL)Human Cell Atlas (HCA )Human Protein Atlas (HPA)SC2diseaseCell BLASTCellMarkerP.
KOBAS(KEGG Orthology Based Annotation System),,是由北京大学魏文丽课题组开发的数据库,主要功能是用于基因/蛋白质功能注释和功能富集。随着数据量不断增加,KOBAS至今为止共经历了3次升级,除了1.0版本的KEGG代谢通路之外,2.0版本增加了PID Curated,PID BioCarta,PID Reactome,BioCyc,Reactome和Pa
GEPIA (Gene Expression Profiling Interactive Analysis) web服务器是2017年推出的,是基于TCGA和GTEx数据库中肿瘤和正常样本进行基因表达分析的一个资源。今天向大家介绍一下更新和增强的GEPIA2版本,提供了更高的resolution和更多的功能。数据库介绍GEPIA2具有198 619种isoforms(功能上相似的蛋白质,具有相似但
被称为传统中药百科全书的ETCM网站是2018年上线的中草药的数据库。数据库中收录了402种中草药、3959个药方、7284种有效成分,此外还收录了中草药有效成分可能靶向的基因靶标2266个,及相对应的4323种疾病。同时,数据库提供了系统分析的方法和结果,方便你对中药进行深入了解。那么问题来了,我们能用这个数据库做什么?1、找草药点击Herbs,首先看到的就是三个饼图,数据库分别根据草药的类型、
数据挖掘技术可以从大量数据中寻找潜在有价值的信息,主要分为数据准备、数据挖掘、以及结果表达和分析。数据库技术是研究、管理和应用数据库的一门软件科学。通过研究数据库的结构、存储、设计、管理和应用的基本理论和实现方法,对数据库中的数据进行处理和分析。本文我们将介绍几种数据库和数据挖掘技术,帮助临床研究人员更好地理解和应用数据库技术。目 录1. 前言2. 医疗公共数据库概述2.1 SEER数据库2.2
分类:数据库使用指南阅读()收藏▌数据库概览THANATOS数据库(THeAutophagy,Necrosis,ApopTosisOrchestratorS)收录细胞凋亡、自噬和程序性坏死调控相关蛋白及其翻译后修饰信息。基于PubMed文献报道中4,237个实验鉴定的自噬和细胞死亡调控相关蛋白质信息,其中3,882个蛋白质来自于8个模式生物,即H. sapiens(Homo sapien, 人),

SEER 数据库是由美国国立癌症研究所于 1973 年建立,是美国常用的癌症数据库,里面包括各式各样的肿瘤类型,如肺癌、乳腺癌、胃癌、结直肠癌、前列腺癌等等。主要提供了各式各样的临床资料,如性别、年龄、TNM 分期等,收集过临床数据的小伙伴都懂得收集数据是一件多么费时且痛苦的事。以下是官网地址:见文末在详细介绍之前,放上一组数据让大家直观感受下 SEER 数据库的魅力:图片来源:网页截图图片来源:
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