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手把手教你如何进行代谢组学数据挖掘
火山图中的每一个点表示一种代谢物,其中蓝色的点代表下调差异代谢物,红色的点代表上调差异代谢物,灰色的点代表检测到但差异不显著的代谢物。可视化层面,通常借助差异代谢物聚类热图、差异代谢物K-Means图,系统、直观地呈现代谢物间的表达趋势。图中最外层为差异代谢物名称,点的大小代表对应差异代谢物的log2FC值的大小,不同分类的差异代谢物用不同颜色表示;差异代谢物条形图中横坐标为差异代谢物的log2F

邻近标记技术
在活细胞或特定条件下激活酶的活性,使其催化标记底物(如生物素Biotin)共价结合到邻近的内源蛋白上,最后通过亲和素磁珠富集带有标记的蛋白并进行质谱(MS)鉴定,分析目的蛋白的互作或邻近的蛋白信息。除上述邻近标记酶之外,近些年科学家们也陆续优化并开发出了许多其他的邻近标记酶及标记技术,例如BioID系列的优化酶BioID2、AirID、BASU等,以及小范围使用的邻近标记技术如HRP、EXCELL

【文献速递】把基因“剪”成环:minigene如何揭开circRNA生成的秘密?
2017年12月,Molecular Cell上线了一篇来自宾夕法尼亚大学Wilusz团队的研究,用minigene技术,首次系统揭示了“当pre-mRNA剪接机器掉链子时,细胞会把更多基因输出转向circRNA”。把E1-Intron1-E2-Intron2-E3克隆到铜诱导pMT启动子下,E2内插入XmaI位点作身份标记,两侧反向DNAREP1_DM重复碱基配对拉近空间距离,迫使剪接机器在“正

到底了







