【代码】【deepseek】辅助思考生物学问题：ICImapping构建遗传图谱gap较大。

GCTAPlink6.1 利用plink计算pca-----直接出结果结果文件具体内容6.2 利用GCTA计算pca-----分2步；先计算亲缘关系矩阵---再计算PCA。

特别提示：基于该方法软件提示输入需要是基因型 fa格式文件，故其它格式，如plink需要转换为 fa格式step1: 基于windows输出.mao文件----输出保存即可step2:准备 fa 格式文件，进行进化树构建---生成 .nwk 文件step1: windows输入.fa文件选择nostep3: 可以直接看见进化树了----导出nwk文件导出NWK。