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Li‘s 核磁共振影像数据处理-22-FSL常用工具命令介绍 fslutils

讲解视频内容请移步Bilibili:https://space.bilibili.com/542601735入群讨论请加v hochzeitstorte请注明“核磁共振学习”公众号:美好事物中转站今日代码查看影像基本信息fslinfo MNI152_T1_2mm_brain.nii.gz查看影像更加详细的信息fslhd MNI152_T1_2mm_brain.nii.gz选填参数 -x,以XML格

#python#bash#机器学习 +2
Li‘s 核磁共振影像数据处理-12-ANTS医学影像配准

讲解视频内容请移步Bilibili:https://space.bilibili.com/542601735入群讨论请加v hochzeitstorte请注明“核磁共振学习”ANTS配准Advanced Normalization ToolsIf you want a decent, fast registration you might run something like this:antsR

#python#编程语言#神经网络 +2
Li‘s 核磁共振影像数据处理-15-MRIcroGL三维核磁共振影像重建

讲解视频内容请移步Bilibili:https://space.bilibili.com/542601735入群讨论请加v hochzeitstorte请注明“核磁共振学习”公众号:美好事物中转站载入三维核磁共振影像后,从Display菜单选择Render,即为三维模式。再通过将不同的感兴趣区展现成不同的颜色,可以更好地进行展示。另外可通过View菜单下的Smooth选项,增加平滑度,提升视觉效果

#人工智能#python#编程语言 +2
Li‘s 核磁共振影像数据处理-10-通过mrtrix3进行概率纤维追踪

讲解视频内容请移步Bilibili:https://space.bilibili.com/542601735入群讨论请加v hochzeitstorte请注明“核磁共振学习”通过mrtrix3进行概率纤维追踪https://mrtrix.readthedocs.io/今日代码dwigradcheck input [ options ]功能:Check the orientation of the

#python#人工智能#编程语言 +2
Li‘s 核磁共振影像数据处理-16-MRtrix3实现脑连接组connectome

讲解视频内容请移步Bilibili:https://space.bilibili.com/542601735入群讨论请加v hochzeitstorte请注明“核磁共振学习”公众号:美好事物中转站今日代码tck2connectome [ options ] tracks_in nodes_in connectome_outExample:tck2connectome wmcsf_10Msift1M

#python#人工智能#编程语言 +2
Li‘s 核磁共振影像数据处理-5-基于mrtrix3代码计算DTI的(FA、ADC等)

讲解视频内容请移步Bilibili:https://space.bilibili.com/542601735今日代码tensor2metric [ options ]tensorGenerate maps of tensor-derived parameters.tensor: the input tensor image.可用options-adc image compute the mean

#编程语言#python#人工智能 +2
Li‘s 核磁共振影像数据处理-26-ITK-SNAP半自动勾画病灶

讲解视频内容请移步Bilibili:https://space.bilibili.com/542601735入群讨论请加v hochzeitstorte请注明“核磁共振学习”公众号:美好事物中转站公众号回复“itksnap”获取测试文件。Itk-snap半自动勾画病灶测试用影像使用了itk-snap官方提供文件,公众号“美好事物中转站”回复“itknsap”可获取。载入影像。用鼠标将影像文件或文件

Li‘s 核磁共振影像数据处理-1(上)-个人简介和系列内容介绍

视频内容请移步Bilibili:https://space.bilibili.com/542601735缘起和简介自我介绍浙江大学 医学院 神经生物学 博士后中国科学院大学 微电子学与固体电子学 博士擅长进行以数据为驱动的医学研究。研究内容涉及人工智能在临床医学中的应用、脑卒中神经生物机制与预后、帕金森的影像学鉴别等。暂别影像组学,开启新篇章。辗转于化学、光电、物理、医学的历程,与未达成的北大梦。

#python#神经网络#数据挖掘 +2
Li‘s 核磁共振影像数据处理-8-纤维追踪成像理论

讲解视频内容请移步Bilibili:https://space.bilibili.com/542601735入群讨论请加v hochzeitstorte请注明“核磁共振学习”纤维追踪理论DTI成像优点:1、速度快2、可量化3、旋转不变:弥散张量三个本征值不随弥散方向和人的体位、方向变化4、可得到白质轨迹DTI缺陷:1、部分容积效应:一个体素内包含不同组织成分2、平均效应:一个体素内包含不止一个纤维

#深度学习#机器学习#人工智能 +2
Li‘s 核磁共振影像数据处理-番外篇-医学影像阅读/分析软件FSLeyes安装避坑

讲解视频内容请移步Bilibili:https://space.bilibili.com/542601735入群讨论请加v hochzeitstorte请注明“核磁共振学习”笔者在MacOS或Linux系统安装FSL系列软件时,多次遇到FSL附属的医学影像阅读软件FSLeyes无法正常工作的问题。查阅过大量然人头大的资料、帖子,尝试各种方法,比如修改OpenGL相关文件,下载独立的FSLeyes使

#python#linux#数据挖掘 +2
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