logo
publist
写文章

简介

该用户还未填写简介

擅长的技术栈

可提供的服务

暂无可提供的服务

KEGG Pathway通路二级分类汇总,轻松找到感兴趣的通路

做完通路富集分析,拿到几十条富集通路后,我们经常会寻找与“某关键词”相关的通路。例如与癌症相关的通路,与免疫相关的通路,与代谢相关的通路等等。单纯从名字来看,面对几十甚至上百个英文通路名,一时半会还真分不清。今天,给大家带来一款实用的KEGG Pathway通路汇总小工具。使用这款工具,我们可以快速找到感兴趣的通路,例如癌症相关通路,免疫相关通路等,并最终汇总成一张美图。

文章图片
数据为什么要进行log2转化,倍数变化(fold change)为什么要求个log2FC?

今天是2022年10月24日,首先祝所有程序员们(会写、会看代码的都算)节日快乐!1024是2的十次方,二进制计数的基本计量单位之一。做生信分析的小伙伴就像是一个个1024,用最低调、最踏实、最核心的功能模块将计算机程序应用到生命科学中,促进科学发展。1G=1024M,而1G与1级谐音,做生信分析的小伙伴都是一级棒的!

文章图片
#数据分析
冬日送暖:美美的火山图,带基因标注哦

寒冷的冬季,一张美美的火山图,让你的心暖暖的!什么是火山图火山图(Volcano Plot)是我们做芯片,RNA-seq等分析时常用的一种图,它能够清晰地展示显著上调和下调的基因,因作出来的图形如火山喷发(从0点开始往上,往两边扩散),故名。例如图中,X轴一般表示log2的倍数变化(Cancer vs Normal),Y轴一般表示-log10(p-value),不同颜色的点表示满足不同条件的基因,

文章图片
#数据分析
科研绘图-配色指南

好的图形展示方式能够简明扼要地表达数据,而好的配色一方面能够突出数据的重点,另一方面能够使所有的数据和谐共存。好的配色是图的二次进化,能够赋予图片“生命”。1,日常生活中使用的颜色日常生活中,我们经常提到各种颜色,例如赤橙黄绿青蓝紫,中国红,香蕉黄等,一般用来定性描述物体的颜色属性,不够精确,例如,红色,是红绿灯的红色,还是苹果的红色?所以一般不在科技论文中使用。2,RGB配色方案最常用的颜色方案

文章图片
#图论#图形渲染#图像处理 +1
    共 11 条
  • 1
  • 2
  • 请选择