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使用scDiffusion扩散模型能生成高质量单细胞数据吗?

今天分享scDiffusion扩散模型,使用该模型生成单细胞数据,这是一种将扩散模型和基础模型相结合的生成模型,用于在受控条件下生成高质量的 scRNA-seq 数据。UMAP 图用于在 2D 平面上可视化生成的和真实的表达数据,以提供对生成的数据的主观判断。随机森林评估与 scGAN 的想法相同,它使用具有 1000 棵树和 5 个最大深度的随机森林模型来区分真实细胞和生成细胞,并且这两个细胞越

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#数据分析#r语言#数据挖掘 +1
MSDIAL|让你轻松学会最简单的代谢/蛋白组学数据处理

今天分享一下代谢组学数据处理常用的一个软件—MSDIAL,该软件可以下载后离线使用,目前是已经更新到MSDIAL5版本,可以针对蛋白组学数据进行处理。可以进行代谢组学、外泌体组学、脂质组学、蛋白组学、糖蛋白组学等分析。新版本对数据依赖性采集和数据非依赖性采集的数据都可进行分析,主要包括GC-MS、LC-MS(DDA)、SWATH-MS、AIF-MS、LC-IM-MS(PASEF)、LC-IM-AI

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#数据分析#经验分享#深度学习 +2
Nature methods| 使用scPROTEIN工具让你的单细胞蛋白组学数据分析更上一层楼

首先,对于提供原始肽信号强度的数据集,我们提出了一个多任务异方差回归模型来估计肽定量的不确定性,并以不确定性引导的方式将肽含量聚合到蛋白质水平(图a)。为了提高构建蛋白质丰度数据的精度,建议采用为肽分配不确定性权重的方法来提高蛋白质丰度数据的准确性。其次,由于样品制备过程中的样品损失,并不是所有的组成肽内容都被输送到质谱仪,这对单细胞蛋白质组学来说是一个至关重要的问题。肽注入质谱仪后,在数据依赖型

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#数据分析#数据挖掘#经验分享 +2
MSDIAL|让你轻松学会最简单的代谢/蛋白组学数据处理

今天分享一下代谢组学数据处理常用的一个软件—MSDIAL,该软件可以下载后离线使用,目前是已经更新到MSDIAL5版本,可以针对蛋白组学数据进行处理。可以进行代谢组学、外泌体组学、脂质组学、蛋白组学、糖蛋白组学等分析。新版本对数据依赖性采集和数据非依赖性采集的数据都可进行分析,主要包括GC-MS、LC-MS(DDA)、SWATH-MS、AIF-MS、LC-IM-MS(PASEF)、LC-IM-AI

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到底了