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1. OTU(Operational Taxonomic Units)操作分类单元:是在是在系统发生学研究或群体遗传学研究中,为了便于进行分析,人为给某一个分类单元(品系,种,属,分组等)设置的同一标志。在生物信息分析中,一般来说,测序得到的每一条序列来自一个菌。要了解一个样品测序结果中的菌种、菌属等数目信息,就需要对序列进行归类操作(cluster)。通过归类操作,将序列按照彼此的相似性分归为许
从Endnote导出时,选择xml,并将原来的PDF文件夹和xml放在一起。.xml文件记事本打开,替换internal-pdf://成/文件名.Data/PDF/导入Zotero并选择拷贝文件到Zotero储存文件夹随后删掉多余笔记
文章来源:https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/12597907.html1. mixOmics应该是在多组学领域知名度最高的一个R包,有专门的团队,做了十余年了,引用量也比较高。官网:http://mixomics.org/文章:mixOmics: An R package for ‘omics feature selection and multiple da
来源国家基因库大数据平台在过去的几十年里,先进的宏基因组测序技术使得对人类微生物组的研究能够发现细菌组成与功能、疾病之间的病理关系。然而相关分析工具在诊断和治疗方面的应用仍需提高其准确性。近日,《Scientific reports》发表了一个新工具:MDL4Microbiome,其通过使用宏基因组序列的各种特征和多模态深度学习模型,在预测疾病状态方面表现出很高的准确性。MDL4Microbiom
import mathdef abs_value1():a = float(input('1.请输入一个数字:'))if a >= 0:a = aelse:a = -aprint('绝对值为:%f' % a)def abs_value2():a = float(input('2.请输入一个数字:'...
来源国家基因库大数据平台在过去的几十年里,先进的宏基因组测序技术使得对人类微生物组的研究能够发现细菌组成与功能、疾病之间的病理关系。然而相关分析工具在诊断和治疗方面的应用仍需提高其准确性。近日,《Scientific reports》发表了一个新工具:MDL4Microbiome,其通过使用宏基因组序列的各种特征和多模态深度学习模型,在预测疾病状态方面表现出很高的准确性。MDL4Microbiom
数据处理中经常会有这样的情况,需要合并多个数据(按行或者按列合并),常规的merge或者rbind只能两个两个合并,操作繁琐。可以使用自写函数或do.call()函数进行数据库的拼接或合并,具体操作如下:按列合并mypath<-"C:/Users/18896/Desktop/example1"multmerge = function(mypath){filenames=list.files(
其实有些时候,我们将SEM想的过于复杂了,其实操作起来还是较容易上手的,不过建模过程中需要我们根据自己试验设计等自行建立一个因子间的关系模型,然后对这个模型进行反复调试,直至达到自己满意的结果为止,这就是SEM的难点,因为构建这个关系模型需要丰富的经验,但是有没有什么入门比较快的法门呢,当然是有的——借鉴前人的文献!!!一般建模前,我们会通过一些相关性分析、VIF、CCA/RDA等筛选一下用于建模
原文链接:https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/51636011一般统计模型中的横截面回归模型中大致可以分为两个方向:一个是交互效应方向(调节、中介效应)、一个是随机性方向(固定效应、随机效应)。两个方向的选择需要根据业务需求:交互效应较多探究的是变量之间的网络关系,可能会有很多变量,多变量之间的关系;而随机性探究的...
Chapter 3 - Linear Growth ModelOverviewThis tutorial walks through the fitting of linear growth modeling in several different frameworks (e.g., multilevel modeling framework, structural equation model







