可视化从根状态到终末状态的概率路径，路径的谱系可能性越高，表示该细胞向目标终末状态分化的潜力越大。此分析可以在单细胞层面进行可视化，也可以与 Atlas View 结合，展示细胞间的连接性和路径。在这里，我们使用sc.pl.embedding自动为每个簇着色，如果需要指定自己的颜色，可以指定调色板参数。VIA是一种单细胞轨迹推理方法，可提供拓扑结构，伪时间，自动终末状态预测和沿谱系的时间基因动力学

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前一章，介绍了文件的准备，然后接下来要做的是跑流程的了。由于这些bam比对的是hg19的参考文件，所以使用GRCh37的内容。由于上一章给的都是男性样本，缺少女性样本，所以在额外加三个样本，里面包含一个女性样本。