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【数据库】SRA数据库介绍及数据下载

NCBI - SRA(Sequence ReadArchive)数据库是NCBI用于存储二代测序的原始数据,包括 454,Illumina,SOLiD,IonTorrent等,这个数据库是可以免费无限制下载的。当然,也可以到EBI - ENA数据库直接下载fastq .gz文件。

#big data#数据库
Linux awk命令详解

awk是行处理器: 相比较屏幕处理的优点,在处理庞大文件时不会出现内存溢出或处理缓慢的问题,常用来格式化文本信息。awk处理过程: 依次对每一行进行处理,然后输出。

【概念】等位基因相关概念辨析

常见allele相关名词的辨析。

#其他
plink格式文件的介绍及相互转换

Plink常用的文件格式有两套:map/ped 和 bim/fam/bed。两组文件均没有列名,且每一列表示的意思是一定的。几种格式之间可以相互转换。推荐使用BED/BIM/FAM这种格式,读取速度快。

#其他
【交互作用】01. 加法交互 & 乘法交互(R包 epiR)

在不同B因素水平,A因素的效应有统计学差异;同理,在不同A因素水平,B因素的效应也有差异。交互作用就是看二者合在一起的效应,与二者单独效应之和(相加)/之乘(相乘),相等还是不相等。不相等,那就是有交互。Mediation是解释暴露因素how导致的结局,而interaction是说明who是高风险目标人群。

#big data#其他#回归
EndNote技巧 | Endnote导出文献

Q1:EndNote怎么导出文献,发给老板?Q2:我用EndNote X9 版本,但是我老板用EndNote X8版本,我导给他的库打不开怎么办呢?

#其他
到底了