1. KEGG现在自己用到的KEGG数据库主要是功能注释，下面谈一下我再用KEGG 时候的经验吧。首先在kaas上传数据做基因的注释。我们用的是prokka注释过后的faa文件：是蛋白序列。当然基因序列也可以。kaas 比对网站https://www.genome.jp/tools/kaas/得到的结果会在kaas的网站：上面图片的text文件是下面的内容：打开html之后内容就是：代谢通路图（k

blastblast包含核酸序列比对，蛋白序列比对等。主要有两个步骤：建库 （makeblastdb）比对 （blast）mdkebalstdb和blast的参数makeblastdb-in input_file-input_type type#输入的文件类型：String, `asn1_bin', `asn1_txt', `blastdb', `fasta'-dbtype molecule_ty