如何正确绘制networkx图
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回答问题
我得到了这段代码,它允许我绘制如下图所示的图表
import networkx as nx
import pylab as plt
from networkx.drawing.nx_agraph import graphviz_layout
G = nx.DiGraph()
G.add_node(1,level=1)
G.add_node(2,level=2)
G.add_node(3,level=2)
G.add_node(4,level=3)
G.add_edge(1,2)
G.add_edge(1,3)
G.add_edge(2,4)
nx.draw(G, pos=graphviz_layout(G), node_size=1600, cmap=plt.cm.Blues,
node_color=range(len(G)),
prog='dot')
plt.show()

问题是,我如何绘制带有节点的图形:
-
使用白色背景色
-
里面有标签
-
有向箭头
-
箭头可选地显示一定的重量
-
自动或手动排列都很好
类似于下图的东西

正如您在该图像中看到的那样,节点对齐得非常好
Answers
由于您拥有 Graphviz,您可以使用它来制作精美的绘图并控制绘图的元素。 “点”布局引擎在定位有向图方面做得很好,就像你的例子中的那样。例如
import networkx as nx
import pylab as plt
from networkx.drawing.nx_agraph import graphviz_layout, to_agraph
import pygraphviz as pgv
G = nx.DiGraph()
G.add_node("A",rank=0)
G.add_nodes_from(['B','C','D'],style='filled',fillcolor='red')
G.add_nodes_from(['D','F','G'])
G.add_nodes_from(['H'],label='target')
G.add_edge('A','B',arrowsize=2.0)
G.add_edge('A','C',penwidth=2.0)
G.add_edge('A','D')
G.add_edges_from([('B','E'),('B','F')],color='blue')
G.add_edges_from([('C','E'),('C','G')])
G.add_edges_from([('D','F'),('D','G')])
G.add_edges_from([('E','H'),('F','H'),('G','H')])
# set defaults
G.graph['graph']={'rankdir':'TD'}
G.graph['node']={'shape':'circle'}
G.graph['edges']={'arrowsize':'4.0'}
A = to_agraph(G)
print(A)
A.layout('dot')
A.draw('abcd.png')
产生输出
strict digraph {
graph [rankdir=TD];
node [label="\N",
shape=circle
];
A [rank=0];
C [fillcolor=red,
style=filled];
A -> C [penwidth=2.0];
B [fillcolor=red,
style=filled];
A -> B [arrowsize=2.0];
D [fillcolor=red,
style=filled];
A -> D;
C -> E;
C -> G;
B -> E [color=blue];
B -> F [color=blue];
D -> G;
D -> F;
H [label=target];
E -> H;
G -> H;
F -> H;
}
由 dot 呈现为

您可以在http://www.graphviz.org/doc/info/attrs.html阅读有关可调绘图参数的信息
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