一、问题描述

在日常操作维护 Kubernetes 过程中我们会经常遇到很多问题,其中经常收到的告警信息就是节点磁盘压力,即 DiskPressure 警告。当出现该警告不久后 Pod 会被驱逐,甚至节点机器的 Docker 镜像也被清理。在生产中这些情况是不能忍受的,我们探究一下是什么原因导致的这些,以及如何提前预防并解决相关问题。

二、问题分析

首先提出几个问题,然后分别查找相关资料,对具体的疑问一一查找答案。只有了解这些问题如何产生,才能找到具体解决办法。

提出的问题如下:

① Kubernetes 依靠什么组件对节点磁盘进行监控

根据 Kubernetes 官方文档描述,在 Kubernetes 集群中,节点磁盘使用量的监控是交给 Kubelet 组件完成的,它会对节点资源使用情况进行分析,等达到一定条件后会执行发出内存、磁盘、pid 资源压力警告。

② Kubelet 监控节点的哪些文件系统

在 Kubernetes 节点组件 Kubelet 目前只支持监控两种文件系统分区,分别为:

  • nodefs: kubelet 相关的文件系统,里面存储了 Pod 挂载的卷、守护程序日志等。

  • imagefs: 容器文件系统,里面存储了容器运行时用于保存镜像和容器可写层。

Kubelet 监控文件系统是通过 Google 的 cAdvisor 组件完成的,该组件专用于监控容器运行环境,当监控到上面列出的文件系统达到一定量后将会发出 DiskPressure 告警,等达到指定阈值,将会对容器及无用镜像相关资源进行清理。

③ Kubelet 根据什么指标对 Pod 执行驱逐的

这个信息在 Kubernetes 官方文档中,Kubelet 会根据以下指标判断是否对 Pod 驱逐进行驱逐:

  • nodefs.available: kubelet 相关的文件系统剩余可用存储空间比例。

  • nodefs.inodesFree: kubelet 相关文件节点表 inodes 剩余可用存储空间比例。

  • imagefs.available: 容器运行时文件系统可用存储空间比例。

  • imagefs.inodesFree: 容器运行时 inodes 剩余可用存储空间比例。

④ Kubelet 根据指标达到什么条件才会执行 Pod 驱逐

经过 Kubernetes 文档的介绍,Kubelet 会对下面指标进行判断,当到达设置的条件后,会执行强制驱逐 Pod:

  • memory.available<100Mi: 当内存下降到 100Mi 时 kubelet 开始驱逐 Pod 及其容器来释放磁盘空间。

  • nodefs.available<10%: 当 kubelet 相关存储可用的存储不足 10% 时开始驱逐 Pod 及其容器来释放磁盘空间。

  • imagefs.available<15%: 当容器运行时文件系统可用存储空间不足 15% 时开始驱逐 Pod,并且删除没有被使用的镜像来释放空间。

  • nodefs.inodesFree<5%: (仅 Linux 系统): 当容器运行时 inodes 可用存储空间不足 5% 时开始驱逐 Pod 及其容器来释放磁盘空间。

⑤ Kubernetes 触发 DiskPressure 时造成的影响

当触发 DiskPressure 告警时,会产生如下的影响:

  • 驱逐 Pod

  • 删除未使用的容器

  • 阻止新创建的 Pod 调度到该节点中

⑥ 什么原因导致经常出现 DiskPressure 警告

推测经常出现这个警告的原因可能是:

  • 默认情况下 docker 会将自己的持久化文件存储到 /var/lib/docker 目录下,这个目录占用空间比较大,导致 /var 目录挂载的磁盘非常容易被占满。 

  • 默认情况下 kubelet 会将自身的 Pod 运行时相关数据存储在 /var/lib/kubelet 目录下,这个目录空间比较大,导致 /var 目录挂载的磁盘非常容易被占满。 

  • 默认情况下 Docker、Kubernetes 和系统等相关日志默认都会存储到 /var/log 目录下,日志相关文件占用空间非常大,导致 /var 目录挂载的磁盘非常容易被占满。 

上面三个默认配置,一个是 kubelet,一个是 docker 的,还有就是相关日志配置的,并且发现 var 目录一般分配的空间不是很大,所以 /var 目录挂载的磁盘空间非常容易被日志文件占满。

除此之外,还有一种可能,那就是当发生 DiskPressure 告警时,此时磁盘其实可用存储空间还很充足,例如 1TB 存储空间,使用率 80% 提示 DiskPressure 告警,这时候其实还有 200GB 可用存储空间。所以,这个磁盘告警比例需要根据节点磁盘的真实情况进行调整。

三、解决问题

注意: 下面的操作最好在集群搭建初期修改,如果已经在现网环境文档运行,修改请谨慎!

更改 Docker 存储目录

既然 Docker 目录默认在 /var/lib/docker 目录下,且这个目录所挂载的磁盘容易被占满,所以我们修改 Docker 配置,将存储的数据单独存放到挂载其它大磁盘的目录中。

(1) 查看 Docker 状态,根据显示的信息定位 Docker 存储配置文件的位置

$ systemctl status -l docker

显示如下信息:

● docker.service - Docker Application Container Engine
   Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/docker.service; enabled; vendor preset: disabled)
   Active: active (running) since  2021-06-15 10:40:07 CST; 3h 20min ago
     Docs: https://docs.docker.com
 Main PID: 1676 (dockerd)
......

可以看到配置文件所在目录是 /usr/lib/systemd/system/,配置文件是 docker.service

(2) 设置 Docker 数据存储目录

打开 Docker 配置文件

$ vi /usr/lib/systemd/system/docker.service

找到 ExecStartExecStart=/usr/bin/docker 这行,在后台添加 --graph <Docker数据存储目录>,例如这里目录为 /apps/data/docker 则可以按如下配置:

...
ExecStart=/usr/bin/docker --graph /apps/data/docker
...

更改 kubelet 存储目录与告警阈值

既然 Kubelet 目录默认在 /var/lib/kubelet 目录下,且这个目录所挂载的磁盘容易被占满,所以我们修改 Kubelet 配置,将存储的数据单独存放到挂载其它大磁盘的目录中。并且根据磁盘真实大小,调整 Kubelet 触发 DisPress 告警的比例。

(1) 查看 kubelet 状态,根据显示的信息定位 kubelet 存储配置文件的位置

输入下面命令查看 kubelet 状态信息:

$ systemctl status -l kubelet

显示如下信息:

● kubelet.service - kubelet: The Kubernetes Node Agent
   Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/kubelet.service; enabled; vendor preset: disabled)
  Drop-In: /usr/lib/systemd/system/kubelet.service.d
           └─10-kubeadm.conf
   Active: active (running) since  2021-06-15 10:40:03 CST; 1h 57min ago
......

可以观察到配置文件目录所在位置是 /usr/lib/systemd/system/kubelet.service.d/,配置文件是 10-kubeadm.conf

(2) 查看 EnvironmentFile 配置文件所在位置

打开 kubelet 配置,查看 kubelet 配置文件:

$ cat /usr/lib/systemd/system/kubelet.service.d/10-kubeadm.conf

可以看到如下内容:

[Service]
Environment="KUBELET_KUBECONFIG_ARGS=--bootstrap-kubeconfig=/etc/kubernetes/bootstrap-kubelet.conf --kubeconfig=/etc/kubernetes/kubelet.conf"
Environment="KUBELET_CONFIG_ARGS=--config=/var/lib/kubelet/config.yaml"
EnvironmentFile=-/var/lib/kubelet/kubeadm-flags.env
EnvironmentFile=-/etc/sysconfig/kubelet
ExecStart=
ExecStart=/usr/bin/kubelet $KUBELET_KUBECONFIG_ARGS $KUBELET_CONFIG_ARGS $KUBELET_KUBEADM_ARGS $KUBELET_EXTRA_ARGS

可以看到 EnvironmentFile=-/var/lib/kubelet/kubeadm-flags.env 和 EnvironmentFile=-/etc/sysconfig/kubelet 俩行配置,其中 /var/lib/kubelet/kubeadm-flags.env 是 "kubeadm init" 和 "kubeadm join" 在运行时生成的文件,我们不需要管理该文件。而 /etc/sysconfig/kubelet 文件则是供我们用户添加自定义参数的,所以我们需要在这个配置文件中添加我们自定义配置参数。

(3) 编辑 /etc/sysconfig/kubelet 配置文件

$ vi /etc/sysconfig/kubelet

然后在 KUBELET_EXTRA_ARGS= 后面添加参数 -root-dir=<新的kubelet存储目录>:

KUBELET_EXTRA_ARGS=--root-dir=/apps/data/kubelet --eviction-hard=nodefs.available<5% --eviction-hard=imagefs.available<5% 
  • --root-dir=/apps/data/kubelet: 设置 kubelet 数据存储在 /apps/data/kubelet 目录下。

  • --eviction-hard=nodefs.available<5%: 设置当 kubelet 相关存储可用的存储不足 5% 时开始驱逐 Pod。

  • --eviction-hard=imagefs.available<5%: 当容器运行时文件系统可用存储空间不足 15% 时开始驱逐 Pod。

上面的大小限制也可以改成具体的数值,例如 --eviction-hard=imagefs.available<10Gi,则表示容器运行时存储小于 10Gi 时进行驱逐。

(5) 重启 daemon-reload 和 kubelet

$ systemctl daemon-reload && systemctl restart kubelet

(6) 再次查看 kubelet 状态,观察上面配置是否生效

再次支持下面命令查看 kubelet 状态:

$ systemctl status -l kubelet

观察显示的 kubelet 参数是是否存在上面我们配置的参数:

● kubelet.service - kubelet: The Kubernetes Node Agent
   Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/kubelet.service; enabled; vendor preset: disabled)
  Drop-In: /usr/lib/systemd/system/kubelet.service.d
           └─10-kubeadm.conf
   Active: active (running) since 二 2021-06-15 13:55:29 CST; 1s ago
     Docs: https://kubernetes.io/docs/
 Main PID: 130986 (kubelet)
    Tasks: 14
   Memory: 26.1M
   CGroup: /system.slice/kubelet.service
           └─130986 /usr/bin/kubelet 
           --bootstrap-kubeconfig=/etc/kubernetes/bootstrap-kubelet.conf 
           --kubeconfig=/etc/kubernetes/kubelet.conf 
           --config=/var/lib/kubelet/config.yaml 
           --network-plugin=cni 
           --pod-infra-container-image=registry.aliyuncs.com/google_containers/pause:3.2 
           --root-dir=/apps/data/kubelet 
           --eviction-hard=nodefs.available<5% 
           --eviction-hard=imagefs.available<5%

可以观察到上面信息中已经加载了 root-dir--eviction-hard 参数,说明配置已经生效。

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