pytorch并没有一套属于自己的数据结构以及数据读取算法,dataloader个人感觉其实就是类似于tf中的feed,并没有任何速度以及性能上的提升。先总结一下遇到的坑:1.没有高效的数据存储,cv.imread在网络训练过程中效率低解决方案:

当时看到了一个还不错的github链接,https://github.com/Lyken17/Efficient-PyTorch主要是讲如何使用lmdb,h5py,pth,lmdb,n5等数据存储方式皆可以。个人的感受是,h5在数据调用上比较快,但是如果要使用多线程读写,就尽量不要使用h5,因为h5的多线程读写好像比较麻烦。http://docs.h5py.org/en/stable/mpi.html这里贴一下h5数据的读写代码(主要需要注意的是字符串的读写需要encode,decode,最好用create_dataset,直接写的话读的时候会报错):

写:
    imagenametotal_.append(os.path.join('images', imagenametotal).encode())
with h5py.File(outfile) as f:
        f.create_dataset('imagename', data=imagenametotal_)
        f['part'] = parts_
        f['S'] = Ss_
        f['image'] = cvimgs
读:
with h5py.File(outfile) as f:
    imagename = [x.decode() for x in f['imagename']]
    kp2ds = np.array(f['part'])
    kp3ds = np.array(f['S'])
    cvimgs = np.array(f['image'])

2.gpu imbalance张航学长Hang Zhang (张航)提了一个开源的gpu balance的工具--PyTorch-Encoding。使用方法还是比较便捷的,如下所示:

from balanced_parallel import DataParallelModel, DataParallelCriterionmodel = DataParallelModel(model, device_ids=gpus).cuda()criterion = loss_fn().cuda()

这里其实有2个注意点,第一,测试的时候需要手动将gpu合并,代码如下:

from torch.nn.parallel.scatter_gather import gather
preds = gather(preds, 0)

第二,当loss函数有多个组成的时候,比如 loss = loss1 + loss2 + loss3那么需要把这三个loss写到一个class中,然后再forward里面将其加起来。其次,我们还可以用另外一个函数distributedDataParallel来解决gpu imbalance的问题.使用方法如下:(注:此方法好像无法和h5数据同时使用)

from torch.utils.data.distributed import DistributedSampler
from torch.nn.parallel import DistributedDataParallel

torch.distributed.init_process_group(backend="nccl")
# 配置每个进程的gpu
local_rank = torch.distributed.get_rank()
torch.cuda.set_device(local_rank)
device = torch.device("cuda", local_rank)

#封装之前要把模型移到对应的gpu
model.to(device)
model = torch.nn.parallel.DistributedDataParallel(model,device_ids=[local_rank],
                                                   output_device=local_rank)

#原有的dataloader上面加一个数据sample
train_loader = torch.utils.data.DataLoader(
        train_dataset,
        sampler=DistributedSampler(train_dataset)
    )

3.gpu利用率不高,+gpu现存占用浪费常用配置:1主函数前面加:(这个会牺牲一点点现存提高模型精度)

cudnn.benchmark = True
torch.backends.cudnn.deterministic = False
torch.backends.cudnn.enabled = True

2训练时,epoch前面加:(定期清空模型,效果感觉不明显)

torch.cuda.empty_cache()

3无用变量前面加:(同上,效果某些操作上还挺明显的)

del xxx(变量名)

4dataloader的长度_len_设置:(dataloader会间歇式出现卡顿,设置成这样会避免不少)

def __len__(self):
return self.images.shape[0]

5dataloader的预加载设置:(会在模型训练的时候加载数据,提高一点点gpu利用率)

train_loader = torch.utils.data.DataLoader(
        train_dataset,
        pin_memory=True,
    )

6网络设计很重要,外加不要初始化任何用不到的变量,因为pyroch的初始化和forward是分开的,他不会因为你不去使用,而不去初始化。

全文阅读链接:【建议收藏】Pytorch常见坑详解icon-default.png?t=M666https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMTczMDMwMw==&mid=2247501002&idx=1&sn=ab11ebfdbe830f03464106158faee203&chksm=fabc9edacdcb17cca284daee64facc49194b933380e4a42bbd11e376fcfa6f3e49d52500fb73&token=1940394883&lang=zh_CN#rd

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