bedgraph文件转bigwig文件
在linux下直接安装bedgraphtobigwig,fetchchromsizes,bedclip,由于对环境变量理解不够清楚,总是出错,主要我不知道这些软件的安装位置,使用which,whereis也没有找到,搞了非常久,最后决定先用conda安装conda create -n ucsc -c bioconda ucsc-bedgraphtobigwigconda activate ucsc
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在linux下直接安装bedgraphtobigwig,fetchchromsizes,bedclip,由于对环境变量理解不够清楚,总是出错,主要我不知道这些软件的安装位置,使用which,whereis也没有找到,搞了非常久,最后决定先用conda安装
conda create -n ucsc -c bioconda ucsc-bedgraphtobigwig
conda activate ucsc
conda install -c bioconda ucsc-bedgraphtobigwig
conda install -c bioconda ucsc-fetchchromsizes
conda install -c bioconda ucsc-bedclip
conda install -c bioconda bedtools
以下这个帖子讲了bedgraphtobigwig的使用,但是配置路径,我真不会:_:
https://www.jianshu.com/p/216d788e1ece
这个视频讲了环境变量的基础知识,但一看就会,一用就废,等有时间请教同学后再分享直接在linux下安装的方法
https://www.bilibili.com/video/BV1eL4y187zB?from=search&seid=15134730233435412650&spm_id_from=333.337.0.0
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