Anaconda conda常用命令：从入门到精通

#设置清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
#设置bioconda
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge
#设置搜索时显示通道地址
conda config --set show_channel_urls yes

2.5 更新conda

将conda自身更新到最新版本，it is recommended to always keep conda updated to the latest version.

conda update conda

2.6 更新Anaconda整体

将整个Anaconda都更新到确保稳定性和兼容性的最新版本

conda update Anaconda

2.7 查询某个命令的帮助

conda create --help

3. 管理环境

Conda允许你创建相互隔离的独立环境，这些环境被称之为虚拟环境

（Virtual Environment），这些环境各自包含属于自己的文件、包以及他们的依存关系，并且不会相互干扰。

Anaconda有一个缺省的名为base的环境。但是不建议把程序放在base环境中，应该创建不同的虚拟环境分别管理不同的开发项目。这个涉及到一个根本的问题：为什么我们需要虚拟环境呢？举一个简单的例子，想象一下你有多个项目要开发，每个项目中都有一些包要依赖于某个共同的包，但是各自的所需要的版本不一致，有一些需要低版本的，有些需要高版本的。然后你就陷入了众口难调的困境。为不同的项目创建虚拟环境就可以把不同项目隔离开来，各自使用自己所需要的软件环境。

3.1 创建虚拟环境

使用conda创建虚拟环境的命令格式为:

conda create -n env_name python=3.8

这表示创建python版本为3.8、名字为env_name的虚拟环境。

创建后，env_name文件可以在Anaconda安装目录envs文件下找到。在不指定python版本时，自动创建基于最新python版本的虚拟环境.

3.2 创建虚拟环境的同时安装必要的包

但是并不建议这样做，简化每一条命令的任务在绝大多数时候都是明智的（一个例外是需要反复执行的脚本）

conda create -n env_name numpy matplotlib python=3.8

3.3 查看有哪些虚拟环境

以下三条命令都可以。注意最后一个是”--”，而不是“-”.

conda env list
conda info -e
conda info --envs

所显示的列表中，前面带星号“*“的表示当前活动环境。比如说当前我的环境列表：

星号的位置表示我现在在base环境下工作。注意，也有不是显示base而显示root的，root是因为是以系统管理身份作业（？待确认）

3.4 激活虚拟环境

使用如下命令即可激活创建的虚拟环境。

conda activate env_name

此时使用python --version可以检查当前python版本是否为所想要的（即虚拟环境的python版本）。

在4.6版本以前需要使用如下命令：

Linux: source activate your_env_name

Windows: activate your_env_name

但是为什么要停留在过去（4.6以前的版本）呢？毕竟现在至少已经有4.10版本了，所以如果你不是最新版本，运行一下"conda update conda"吧

3.5 退出虚拟环境

使用如下命令即可退出当前工作的虚拟环境。

conda activate
conda deactivate

有意思的是，以上两条命令只中任一条都会让你回到base environment，它们从不同的角度出发到达了同一个目的地。可以这样理解，activate的缺省值是base，deactivate的缺省值是当前环境，因此它们最终的结果都是回到base

这个只适用于4.6及以后版本。如果你还在4.6以前的话，参见上一条说明。

3.5 删除虚拟环境

执行以下命令可以将该指定虚拟环境及其中所安装的包都删除。

conda remove --name env_name --all

如果只删除虚拟环境中的某个或者某些包则是：

conda remove --name env_name  package_name

3.6 导出环境

很多的软件依赖特定的环境，我们可以导出环境，这样方便自己在需要时恢复环境，也可以提供给别人用于创建完全相同的环境。

#获得环境中的所有配置
conda env export --name myenv > myenv.yml
#重新还原环境
conda env create -f  myenv.yml

4. 包（Package）的管理

4.1 查询包的安装情况

查询看当前环境中安装了哪些包

conda list

查询当前Anaconda repository中是否有你想要安装的包

conda search package_name

当然与互联网的连接是执行这个查询操作乃至后续安装的前提条件.

4.2 查询是否有安装某个包

(2023-08-17 added)

用conda list后跟package名来查找某个指定的包是否已安装，而且支持*通配模糊查找。

conda list pkgname

conda list pkgname*

如下所示：

当然如果你确认是否有某个包的目的是要对其进行更新的话，那就直接执行conda update pkgname即可，如果该包没有安装的话，conda会报告PackageNotInstalledError错误（然后改用conda install即可），比如：

4.3 包的安装和更新

在当前（虚拟）环境中安装一个包：

conda install package_name

当然也可以如上所述在创建虚拟环境的同时安装包，但是并不建议。安装完一个包后可以执行conda list确认现在列表中是否已经包含了新安装的包。

也可以以以下命令安装某个特定版本的包(以下例为安装0.20.3版本的numpy)：

conda install numpy=0.20.3

可以用以下命令将某个包更新到它的最新版本：

conda update numpy

安装包的时候可以指定从哪个channel进行安装，比如说，以下命令表示不是从缺省通道，而是从conda_forge安装某个包。

conda install pkg_name -c conda_forge

4.4 conda卸载包

conda uninstall package_name

这样会将依赖于这个包的所有其它包也同时卸载。

如果不想删除依赖其当前要删除的包的其他包：

conda uninstall package_name --force

但是并不建议用这种方式卸载，因为这样会使得你的环境支离破碎，如以下（conda manual description原文）所述：

一个直观的理解就是，如果一个包A被删除了，而依赖于它的包B、C等却没有删除，但是那些包其实也已经不可用了。另一方面，之后你又安装了A的新版本，而不幸的是，B、C却与新版本的A不兼容因此依然是不可用的。

4.5 清理anaconda缓存

conda clean -p      # 删除没有用的包 --packages
conda clean -t      # 删除tar打包 --tarballs
conda clean -y -all # 删除所有的安装包及cache(索引缓存、锁定文件、未使用过的包和tar包)

关于清除命令的更详细的说明，可以执行以下命令进行查询：

>>conda clean -h

输出结果如下（一部分）：

[2023-05-07]

conda就像个守财奴一样，把每个历史安装包都会好好保存。。。好处是可以很方便地恢复到旧的历史版本，坏处是占内存空间。。。前两天由于安装一个新的包，系统报告“CondaMemoryError: The conda process ran out of memory. Increase system memory and/or try again.”，执行"conda -y -all"清除了约30G的空间！

5. Python版本的管理

除了上面在创建虚环境时可以指定python版本外，Anaconda基环境的python版本也可以根据需要进行更改。

5.1 将版本变更到指定版本

conda install python=3.5

更新完后可以用以下命令查看变更是否符合预期。

python --version

5.2 将python版本更新到最新版本

如果你想将python版本更新到最新版本，可以使用以下命令：

conda update python

6. conda install vs pip install

6.1 有什么区别？

conda可以管理非python包，pip只能管理python包。
conda自己可以用来创建环境，pip不能，需要依赖virtualenv之类的。
conda安装的包是编译好的二进制文件，安装包文件过程中会自动安装依赖包；pip安装的包是wheel或源码，装过程中不会去支持python语言之外的依赖项。
conda安装的包会统一下载到一个目录文件中，当环境B需要下载的包，之前其他环境安装过，就只需要把之间下载的文件复制到环境B中，下载一次多次安装。pip是直接下载到对应环境中。
conda只能在conda管理的环境中使用，例如比如conda所创建的虚环境中使用。pip可以在任何环境中使用，在conda创建的环境中使用pip命令，需要先安装pip（conda install pip ），然后可以环境A 中使用pip 。conda 安装的包，pip可以卸载，但不能卸载依赖包，pip安装的包，只能用pip卸载。

比如说，在某个环境中安装一个包，会出现以下打印信息：

这里“Using cached jupyter ...” 的意思就是jupyter安装包已经（在base环境或者别的环境中）之前安装过了，在缓存中有安装包，所以就不会重新下载，而是直接利用了。

pip和conda在安装软件包时，在依赖关系方面的处理机制不同。pip在递归的串行循环中安装依赖项，不会确保同时满足所有软件包的依赖关系，如果按顺序较早安装的软件包相对于按顺序较晚安装的软件包具有不兼容的依赖项版本，则可能导致环境以微妙的方式被破坏掉；conda使用SAT（satisfiability）solver来验证是否满足环境中安装的所有软件包的所有要求，只要有关依赖项的软件包元数据正确，conda就会按预期产生可用的环境。

6.2 能否混用？

首先，不建议混用。混用容易导致库的依赖关系出现混乱，然后突然哪天环境可能就崩了，安装不了新的包，无法进行conda update之类的。[2023-05-07]刚刚这两天遭遇了一次这样的事件，由于要安装一个新的包，各种各样的稀奇古怪的事情层出不穷，比如说：

>> conda install packagename

....

CondaMemoryError: The conda process ran out of memory. Increase system memory and/or try again.

>> conda update conda
- defaults/win-64::_anaconda_depends==2020.07=py38_0
- defaults/win-64::_ipyw_jlab_nb_ext_conf==0.1.0=py38_0
failed with repodata from current_repodata.json, will retry with next repodata source.
Solving environment: failed with repodata from current_repodata.json, will retry with next repodata
source.
Collecting package metadata (repodata.json): failed

RemoveError: 'requests' is a dependency of conda and cannot be removed from
conda's operating environment.

上天入地各种官方民间偏方的试，搞不定，最后只好卸载重新安装Anaconda完事。。。

其次，由于conda的库确实不如pip的库丰富{很多包只在 pip 有：PYPI有15万可用包，而Anaconda repository中（使用conda命令安装）提供了1,500多个软件包，Anaconda cloud上（使用conda-forge或bioconda命令安装）的几千种其他软件包。}，所以有时候可能迫不得已要使用pip安装。切记，只有在conda install搞不定时才使用pip intall。而且，最后使用虚拟环境进行环境隔离。

6.3 安装在哪里？

conda install xxx：这种方式安装的库都会放在anaconda3/pkgs目录下，这样的好处就是，当在某个环境下已经下载好了某个库，再在另一个环境中还需要这个库时，就可以直接从pkgs目录下将该库复制至新环境而不用重复下载。
pip install xxx：分两种情况，一种情况就是当前conda环境的python是conda安装的，和系统的不一样，那么xxx会被安装到anaconda3/envs/current_env/lib/python3.x/site-packages文件夹中，如果当前conda环境用的是系统的python，那么xxx会通常会被安装到~/.local/lib/python3.x/site-packages文件夹中