k8s常见报错以及解决方法(一)

现阶段我们使用k8s集群越来越多,随之而来的是一系列的问题,接下来我向大家来介绍一下我遇到的一些问题以及解决方法

一.报错cannot allocate memory或者no space left on device,修复K8S内存泄露问题

问题描述

一.当k8s集群运行日久以后，有的node无法再新建pod，并且出现如下错误，当重启服务器之后，才可以恢复正常使用。查看pod状态的时候会出现以下报错

applying cgroup … caused: mkdir …no space left on device
或者在describe pod的时候出现cannot allocate memory

这时候你的k8s集群可能就存在内存泄露的问题了,当创建的pod越多的时候内存会泄露的越多,越快.

二.具体查看是否存在内存泄露

cat /sys/fs/cgroup/memory/kubepods/memory.kmem.slabinfo
当出现cat: /sys/fs/cgroup/memory/kubepods/memory.kmem.slabinfo: Input/output error则说明不存在内存泄露的情况
如果存在内存泄露会出现
slabinfo - version: 2.1
# name            <active_objs> <num_objs> <objsize> <objperslab> <pagesperslab> : tunables <limit> <batchcount> <sharedfactor> : slabdata <active_slabs> <num_slabs> <sharedavail>

解决方案

一.解决方法思路:关闭runc和kubelet的kmem,因为升级内核的方案改动较大,此处不采用.

二.kmem导致内存泄露的原因:

内核对于每个cgroup子系统的的条目数是有限制的，限制的大小定义在kernel/cgroup.c #L139,当正常在cgroup创建一个group的目录时，条目数就加1 .我们遇到的情况就是因为开启了kmem accounting功能，虽然cgroup的目录删除了，但是条目没有回收。这样后面就无法创建65535个cgroup了。也就是说，在当前内核版本下，开启了kmem accounting功能，会导致memory cgroup的条目泄漏无法回收。

具体实现

一.需要重新编译runc

1. 配置go语言环境

wget https://dl.google.com/go/go1.12.9.linux-amd64.tar.gz
tar xf go1.12.9.linux-amd64.tar.gz -C /usr/local/

写入bashrc
vim ~/.bashrc 
export GOPATH="/data/Documents"
export GOROOT="/usr/local/go"
export PATH="$GOROOT/bin:$GOPATH/bin:$PATH"
export GO111MODULE=off

验证
source ~/.bashrc 
go env

2. 下载runc源码

mkdir -p /data/Documents/src/github.com/opencontainers/
cd /data/Documents/src/github.com/opencontainers/
git clone https://github.com/opencontainers/runc
cd runc/
git checkout v1.0.0-rc9  # 切到v1.0.0-rc9 tag

3. 编译

安装编译组件
sudo yum install libseccomp-devel
make BUILDTAGS='seccomp nokmem'
编译完成之后会在当前目录下看到一个runc的可执行文件,等kubelet编译完成之后会将其替换

二.编译kubelet

1. 下载kubernetes源码

mkdir -p /root/k8s/
cd /root/k8s/
git clone https://github.com/kubernetes/kubernetes
cd kubernetes/
git checkout v1.15.3

2. 制作编译环境的镜像(Dockerfile如下)

FROM centos:centos7.3.1611

ENV GOROOT /usr/local/go
ENV GOPATH /usr/local/gopath
ENV PATH /usr/local/go/bin:$PATH

RUN yum install rpm-build which where rsync gcc gcc-c++ automake autoconf libtool make -y \
    && curl -L https://studygolang.com/dl/golang/go1.12.9.linux-amd64.tar.gz | tar zxvf - -C /usr/local

3. 在制作好的go环境镜像中来进行编译kubelet

docker run  -it --rm   -v /root/k8s/kubernetes:/usr/local/gopath/src/k8s.io/kubernetes   build-k8s:centos-7.3-go-1.12.9-k8s-1.15.3   bash
cd /usr/local/gopath/src/k8s.io/kubernetes
#编译
GO111MODULE=off KUBE_GIT_TREE_STATE=clean KUBE_GIT_VERSION=v1.15.3 make kubelet GOFLAGS="-tags=nokmem"

三.替换原有的runc和kubelet

1. 将原有runc和kubelet备份

mv /usr/bin/kubelet /home/kubelet
mv /usr/bin/docker-runc /home/docker-runc

2. 停止docker和kubelet

systemctl stop docker
systemctl stop kubelet

3. 将编译好的runc和kubelet进行替换

cp kubelet /usr/bin/kubelet
cp kubelet /usr/local/bin/kubelet
cp runc /usr/bin/docker-runc

4. 检查kmem是否关闭前需要将此节点的pod杀掉重启或者重启服务器,当结果为0时成功

cat /sys/fs/cgroup/memory/kubepods/burstable/memory.kmem.usage_in_bytes

5. 是否还存在内存泄露的情况

cat /sys/fs/cgroup/memory/kubepods/memory.kmem.slabinfo

二.k8s证书过期问题的两种处理方法

前情提要

​ 公司测试环境的k8s集群使用已经很长时间了,突然有一天开发联系我说k8s集群无法访问了,我开始以为是测试环境的机器磁盘空间不够了,导致组件异常或者把开发使用的镜像自动清理掉了,但是当我登上机器去查验的时候发现不是这个原因.当时觉得也很疑惑,因为开发环境没几个人在用,咋还会有问题呢,所以就去查验log的相关报错信息.

问题现象

​ 出现k8s api无法调取的现象，使用kubectl命令获取资源均返回如下报错:

Unable to connect to the server: x509: certificate has expired or is not yet valid

经网上搜索之后发现应该是k8s集群的证书过期了,使用命令排查证书的过期时间

kubeadm alpha certs check-expiration

发现确实是证书过期了

相关介绍以及问题解决

​ 因为我们是使用kubeadm部署的k8s集群,所以更新起证书来也是比较方便的,默认的证书时间有效期是一年,我们集群的k8s版本是1.15.3版本是可以使用以下命令来更新证书的,但是一年之后还是会到期,这样就很麻烦,所以我们需要了解一下k8s的证书,然后我们来生成一个时间很长的证书,这样我们就可以不用去总更新证书了.

kubeadm alpha certs renew all --config=kubeadm.yaml
 systemctl restart kubelet
 kubeadm init phase kubeconfig all --config kubeadm.yaml
 然后将生成的配置文件替换,重启 kube-apiserver、kube-controller、kube-scheduler、etcd 这4个容器即可

另外 kubeadm 会在控制面板升级的时候自动更新所有证书，所以使用 kubeadm 搭建得集群最佳的做法是经常升级集群，这样可以确保你的集群保持最新状态并保持合理的安全性。但是对于实际的生产环境我们可能并不会去频繁得升级集群，所以这个时候我们就需要去手动更新证书。

下面我们通过调用k8s的api来实现更新一个10年的证书

首先在/etc/kubernetes/manifests/kube-controller-manager.yaml文件加入配置
spec:
  containers:
  - command:
    - kube-controller-manager
    # 设置证书有效期为 10年
    - --experimental-cluster-signing-duration=87600h 
    - --client-ca-file=/etc/kubernetes/pki/ca.crt

修改完成后 kube-controller-manager 会自动重启生效。然后我们需要使用下面的命令为 Kubernetes 证书 API 创建一个证书签名请求。如果您设置例如 cert-manager 等外部签名者，则会自动批准证书签名请求（CSRs）。否者，您必须使用 kubectl certificate 命令手动批准证书。以下 kubeadm 命令输出要批准的证书名称，然后等待批准发生：

kubeadm alpha certs renew all --use-api --config kubeadm.yaml &

需要将全部pending的证书全部批准

我们还不能直接重启控制面板的几个组件，这是因为使用 kubeadm 安装的集群对应的 etcd 默认是使用的 /etc/kubernetes/pki/etcd/ca.crt 这个证书进行前面的，而上面我们用命令 kubectl certificate approve 批准过后的证书是使用的默认的 /etc/kubernetes/pki/ca.crt 证书进行签发的，所以我们需要替换 etcd 中的 ca 机构证书:

# 先拷贝静态 Pod 资源清单
 cp -r /etc/kubernetes/manifests/ /etc/kubernetes/manifests.bak
 vi /etc/kubernetes/manifests/etcd.yaml
......
spec:
  containers:
  - command:
    - etcd
    # 修改为 CA 文件
    - --peer-trusted-ca-file=/etc/kubernetes/pki/ca.crt
    - --trusted-ca-file=/etc/kubernetes/pki/ca.crt
......
    volumeMounts:
    - mountPath: /var/lib/etcd
      name: etcd-data
    - mountPath: /etc/kubernetes/pki  # 更改证书目录
      name: etcd-certs
  volumes:
  - hostPath:
      path: /etc/kubernetes/pki  # 将 pki 目录挂载到 etcd 中去
      type: DirectoryOrCreate
    name: etcd-certs
  - hostPath:
      path: /var/lib/etcd 
      type: DirectoryOrCreate
    name: etcd-data
......

由于 kube-apiserver 要连接 etcd 集群，所以也需要重新修改对应的 etcd ca 文件：

 vi /etc/kubernetes/manifests/kube-apiserver.yaml
......
spec:
  containers:
  - command:
    - kube-apiserver
    # 将etcd ca文件修改为默认的ca.crt文件
    - --etcd-cafile=/etc/kubernetes/pki/ca.crt
......

除此之外还需要替换 requestheader-client-ca-file 文件，默认是 /etc/kubernetes/pki/front-proxy-ca.crt 文件，现在也需要替换成默认的 CA 文件，否则使用聚合 API，比如安装了 metrics-server 后执行 kubectl top 命令就会报错：

 cp /etc/kubernetes/pki/ca.crt /etc/kubernetes/pki/front-proxy-ca.crt
 cp /etc/kubernetes/pki/ca.key /etc/kubernetes/pki/front-proxy-ca.key

这样我们就得到了一个10年证书的k8s集群,还可以通过重新编译kubeadm来实现一个10年证书的,这个我没有尝试,不过在初始化集群的时候也是一个方法.