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育种中一般配合力和特殊配合力的计算方法

研究生期间,学习数量遗传学时,对配合力的概念感到很神奇,曾经和同学讨论过,按道理说曹操的一般配合力很高,几个孩子都很出色。那么问题来了,什么是一般配合力?一般配合力就是可以稳定遗传的因素,即曹操和不同女性生育的孩子,都很出色,这表明这种出色不因为不同女性的差异而变化,说明这种出色是遗传自父亲,因此曹操的一般配合力比较高。那么什么是特殊配合力呢?看一下曹操的父母,这可以理解为其父母之间的特殊配合..

Excel如何插入中国地图进行可视化

Excel如何插入中国地图进行可视化目的我的目的是下面这张图:或者下面这张图:或者下面这张图:今天,我们演示一下如何在Excel中插入中国地图,并对各个省份的销售额做一个可视化。上网上搜索了一下。看了网上面的解决方案,大体包括:下载一个地图,然后读取到Excel中……各种复杂下载Power Map插件,然鹅网站挂掉了……各种复杂安装插件Data Map插件,看起来还是很复杂网上面的东西,过时,老套

R语言中写入xlsx的不同sheet表格

参考:R数据写入Excel不同sheet发现里面的openxlsx不能使用了, 而writexl这个包还是挺友好的, 例子:测试思路模拟两个数据框新建一个list表写入excel中代码aa<-data.frame(1:5,2:6)ab<-data.frame(2:60,13:71)aaablibrary(writexl)sheets =

Spyder: 一款优秀的Python 数据科学开发环境

个人感想看到Udemy中机器学习的教程,讲师用的是Rstudio操作的R,用的是Spyder操作的Python,惊艳了我。决定学习一下这个编辑器的操作,做一下记录。1. Spyder编辑器介绍Spyder是一个强大的科学环境是用Python编写编辑器,由科学家,工程师和数据分析师所设计。它具有一个综合开发工具的高级编辑、分析、调试和概要分析功能与科学包的数据探索、交互执行、深度检查和漂亮的可视化功

GWAS分析中SNP解释百分比PVE | 第四篇,MLM模型中如何手动计算PVE?

系列部分:GWAS分析中SNP解释百分比PVE | 第一篇,SNP解释百分比之和为何大于1?GWAS分析中SNP解释百分比PVE | 第二篇,GLM模型中如何计算PVE?GWAS分析中SNP解释百分比PVE | 第三篇,MLM模型中如何计算PVE?今天介绍一下如何手动计算MLM模型GWAS的PVE结果。因为GAPIT中的MLM模型又PVE结果,但是常用的GEMMA、GCTA的GWAS结果并没有PV

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GWAS分析中SNP解释百分比PVE | 第二篇,GLM模型中如何计算PVE?

上一篇,介绍了一下显著性的SNP,他们的解释表型变异百分比(PVE)之和,为何可能大于1.https://yijiaobani.blog.csdn.net/article/details/122093602这篇我们介绍一下GLM模型中,PVE的计算方法。1. 数据描述协变量是PCA的前三个,数据具体如下:表型数据:1641 1641 153.9734231642 1642 113.11930116

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python list 转化为矩阵报错:AttributeError: 'list' object has no attribute 'reshape'

报错类型>>> b['1', '0.1', '1', '0.1']>>> b.reshape(2,2)Traceback (most recent call last):File "<stdin>", line 1, in <module>AttributeError: 'list' object has no attri...

机器学习 | R语言中的方差分析汇总

方差分析,是统计中的基础分析方法,也是我们在分析数据时经常使用的方法。下面我总结一下R语言如何对常用的方差分析进行操作。1. 方差分析的假定上面这个思维导图,也可以看出,方差分析有三大假定:正态,独立和齐次,如果不满足,可以使用广义线性模型或者混合线性模型,或者广义线性混合模型去分析。本次我们的主题有:2. 数据来源这里,我们使用的数据来源于R包agridat,它是讲农业相关的论文,书籍中相关的数

asreml3r 和 asreml4r 多性状分析代码比较

代码比较:asreml4-r 多性状分析library(asreml)library(learnasreml)data("animalmodel.dat")data("animalmodel.ped")dat = animalmodel.datped = animalmodel.pedainv = ainverse(ped)# # asreml-3r# ainv = as...

如何下载learnasreml软件包 R包

learnasreml软件包介绍:大家好,我是邓飞,learnasreml是我编写的学习asreml软件的包,里面有一些常用的数据,结果整理代码,方便更好的学习和使用asreml软件。该包在windows10和Centos系统下测试。运行命令:if (!requireNamespace("devtools")) install.packages("devtools")library(dev...

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