基因组选择, 预测杂种优势, 在水稻可以用, 在玉米, 高粱中也可以用, 在动物选择配套系时也可以用, 根据加性效应和非加性效应进行预测. 前景广阔.这篇文章的作者, 有很多大牛, 徐世忠老师, 专门做算法的, 张启发老师, 水稻大牛, 文章本身没有数据源, 使用已有数据, 去挖掘信息, 这才是数据分析师应该有的范…1. 参考文献Cui Y , Li R , Li G , et al. H...

报错信息:devtools::install_github("dengfei2013/GS")Installation failed: An unknown option was passed in to libcurl解决方法:下载github中的zip软件包, 在Centos中解压:unzip xx.zip解压完成后,会产生xx文件夹.进入R

笔记计划分为六篇：第一篇：读取plink基因型数据和表型数据第二篇：对基因型数据质控：缺失质控，maf质控，hwe质控，样本质控第三篇：基因型数据可视化：kingship，LD，MDS，PCA第四篇：一般线性模型进行GWAS分析（GLM模型）第五篇：混合线性模型进行GWAS分析（MLM模型）第六篇：TASSEL结果可视化：QQ plot，曼哈顿图已完成前两篇，本篇是第三篇。1. 将质控的plink

有时候，安装asreml，输入激活码时，会显示联网失败。如果电脑是联网状态，就要考虑设置一下防火墙：1. 打开控制面板点击第一个系统和安全，点击高级设置：2. 设置入站规则和出站规则点击新建规则：选择端口：键入5053,5443，点击下一步：最后取一个名字：同样，设置出站规则。搞定！...

报错信息：Failed to start Install ABRT coredump hookFailed to start Login Service解决方案：使用U盘系统，进入系统文件，找到服务器的硬盘新建一个文件夹new（如果没有权限，使用sudo mkdir new），将文件挂载到new上mount /dev/mapper/centos-root new，进入new修改...

VScode配置R语言一直在Rstudio中编写R语言程序，这里，想用VScode进行R语言的编写，毕竟除了R语言，还要编写Python，Shell，Julia等语言，Vscode是通用的平台。这里，我下载的都是最新版的R和Vscode（2022-04-07）。1. 下载R语言4.1.3https://cran.r-project.org/bin/windows/base/默认安装就行，这里不勾选

报错信息：Failed to start Install ABRT coredump hookFailed to start Login Service解决方案：使用U盘系统，进入系统文件，找到服务器的硬盘新建一个文件夹new（如果没有权限，使用sudo mkdir new），将文件挂载到new上mount /dev/mapper/centos-root new，进入new修改...

本文系统介绍国家区域试验数据分析方法，针对一年多点随机区组设计，重点阐述三个核心分析环节：1）方差分析（采用区组嵌套于地点的混合模型）；2）多重比较（0.05与0.01双水平LSD检验）；3）地点变异系数计算（基于误差均方而非表观数据）。通过R代码实现完整分析流程，包括模型构建、结果解读及精度评价标准，为作物新品种审定提供规范的统计分析方法。特别强调区组嵌套效应处理、双水平差异显著性标记及误差驱动

方差分析，是统计中的基础分析方法，也是我们在分析数据时经常使用的方法。下面我总结一下R语言如何对常用的方差分析进行操作。1. 方差分析的假定上面这个思维导图，也可以看出，方差分析有三大假定：正态，独立和齐次，如果不满足，可以使用广义线性模型或者混合线性模型，或者广义线性混合模型去分析。本次我们的主题有：2. 数据来源这里，我们使用的数据来源于R包agridat，它是讲农业相关的论文，书籍中相关的数

代码比较：asreml4-r 多性状分析library(asreml)library(learnasreml)data("animalmodel.dat")data("animalmodel.ped")dat = animalmodel.datped = animalmodel.pedainv = ainverse(ped)# # asreml-3r# ainv = as...