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【R语言】——基因GO/KEGG功能富集结果可视化(保姆级教程)
上期“原来基因功能富集分析这么简单”介绍如何使用DAVID在线分析工具对基因进行GO/KEGG功能富集分析。注:DAVID导出来的“%”这列为“Gene ratio”;上面只展示“BP”的数据,其余“CC”和“MF”也是类似格式,故不一一列举。好了本次分享就到这里,下期将分享使用R clusterProfiler包对基因进行GO/KEGG功能富集分析,敬请期待。关注“在打豆豆的小潘学长”公众号,发

原来基因功能富集分析这么简单
因此,研究者可通过多个功能注释数据库对基因进行功能富集分析,将这一系列基因集分成不同的功能类别,从中寻找在生物学过程中起关键作用的生物学通路,从而揭示和理解这些生物学过程的基本及潜在的分子机制。事实上,分子水平的落脚点是在基因水平上,但是基因的种类有很多,而理解这些基因所代表的生物学意义的最佳途径就是。基因本体论(Gene Ontology,GO)数据库是GO联合会在2000年构建的一个数据库,旨

【R语言】——相关性分析和热图绘制
一、什么是相关性分析?相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性的元素之间需要存在一定的联系或者概率才可以进行相关性分析。在组学测序(如转录组)中需设置多个生物学重复,而对多个生物学重复样本的相关性分析,可从中判断生物学重复样本数据是否可以用于接下来的分析。如有一生物学重复不一致的情况,可去除变异数据,预防某一重复数据不可用,进而影响实验数据

到底了








