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【R语言】——10xGenomics单细胞转录组测序数据下载与读取
本期将给大家介绍如何从NCBI上下载单细胞测序数据,以及应用“Seurat”R包读取10x Genomics格式(.mtx/.tsv)单细胞数据。PS. 本期主要介绍10x Genomics格式(.mtx/.tsv),其他格式的单细胞数据的下载与读取会陆续在后面几期介绍。

原来基因功能富集分析这么简单
因此,研究者可通过多个功能注释数据库对基因进行功能富集分析,将这一系列基因集分成不同的功能类别,从中寻找在生物学过程中起关键作用的生物学通路,从而揭示和理解这些生物学过程的基本及潜在的分子机制。事实上,分子水平的落脚点是在基因水平上,但是基因的种类有很多,而理解这些基因所代表的生物学意义的最佳途径就是。基因本体论(Gene Ontology,GO)数据库是GO联合会在2000年构建的一个数据库,旨

【R语言】——相关性分析和热图绘制
一、什么是相关性分析?相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性的元素之间需要存在一定的联系或者概率才可以进行相关性分析。在组学测序(如转录组)中需设置多个生物学重复,而对多个生物学重复样本的相关性分析,可从中判断生物学重复样本数据是否可以用于接下来的分析。如有一生物学重复不一致的情况,可去除变异数据,预防某一重复数据不可用,进而影响实验数据

到底了








