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物种分歧时间、分子进化速率计算(TimeTree、PAML mcmctree、codeml 、MEGA 看这一篇文章就够!)

分歧时间是当前进化分析的一个热点,以某几个特定类群的化石时间作为校正,然后通过基因序列间的分歧程度以及分子钟来估算物种间的分歧时间,同时估算系统发育树上其它节点的发生时间,从而推断相关类群的起源和不同类群的分歧时间。目前,采用依据BI树和ML树估计物种分歧时间的程序很多,例如R8S、MCMCTREE、MULTIDIVTIME、BEAST、MEGA等,通过不同的策略将化石时间信息整合到一个系统发育树

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#网络#python#数据库 +2
物种分歧时间、分子进化速率计算(TimeTree、PAML mcmctree、codeml 、MEGA 看这一篇文章就够!)

分歧时间是当前进化分析的一个热点,以某几个特定类群的化石时间作为校正,然后通过基因序列间的分歧程度以及分子钟来估算物种间的分歧时间,同时估算系统发育树上其它节点的发生时间,从而推断相关类群的起源和不同类群的分歧时间。目前,采用依据BI树和ML树估计物种分歧时间的程序很多,例如R8S、MCMCTREE、MULTIDIVTIME、BEAST、MEGA等,通过不同的策略将化石时间信息整合到一个系统发育树

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