1. 计算富集分数（ES） 富集分数：S 反应基因集（比如某个通路内的基因集）成员 s 在排序基因集 L（比如根据 logFC 排序的差异基因集，默认降序，所以上调基因在顶端）的两端富集的程度。正值ES表示基因集 S 在基因集 L 的顶部富集，负值ES表示基因集 S 在基因集 L 的底部富集。第三部分是排序后所有基因 rank 值的分布，热图红色部分对应的基因在 A 组高表达，蓝色部分对应的基因在

运营至今合作的科研客户超2000家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL、Plant Cell 等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。另外你可以根据自己的喜好选择上调，下调和不显著基因的颜色，输出名默认是re

康乃馨（Dianthus caryophyllus L.）对乙烯高度敏感，通常作为研究乙烯诱导花瓣衰老机制的模型植物。花瓣衰老由复杂的调控网络控制，组蛋白修饰等表观遗传调控会影响染色质状态和基因。

研究验证了这些基因在模拟糖尿病视网膜病变的体外模型中的表达变化，并发现高糖诱导了GSDMD和GSDME蛋白水平的增加，进一步揭示了细胞焦亡在糖尿病视网膜病变中的作用机制。细胞焦亡(Pyroptosis)又称细胞炎性坏死，是由gasdermin蛋白介导的细胞程序性坏死，表现为细胞不断胀大直至细胞膜破裂，导致细胞内容物的释放进而激活强烈的炎症反应。突变的胱天蛋白酶-3诱导gasdermin E（GSD

为了探究RcHSF30在月季中的生物学功能，作者在月季“Baobai”中过表达RcHSF30发现显著提高了植株耐热性，将致死温度从44.73℃升至47.16℃，热胁迫下转基因植株萎蔫程度轻，NBT和DAB组织化学染色表明，野生型叶片相对于RcHSF30-OE植物表现出更深的染色（图8B、8C），且热胁迫相关基因（HSP18.1、HSP70、BAG6和GOLS2）表达显著上调，证实RcHSF30通过

针对木瓜采后极易软化、1-MCP处理时长不当又会产生硬芯“橡胶质感”这一产业痛点，本研究以破色期果实为材料，设置无1-MCP处理、1-MCP 2h和1-MCP 16h三组，通过ATAC-seq与RNA-seq联合分析，系统解析染色质开放图谱与基因表达谱。将ATAC-seq差异peaks与RNA-seq差异表达基因（DEGs）交叉整合，锁定CpAGL18等MADS-box转录因子及CpACS1（乙烯

科研常用小工具单细胞比率可视化 - 教程来啦~

构成每个KOG的蛋白被假定为来自于一个祖先蛋白，这些蛋白可能是orthologs（来自于不同物种的由垂直家系进化而来的蛋白，通常保留与原始蛋白相同的功能）或者paralogs（在一定物种中来源于基因复制的蛋白，可能进化出新的与原来有关的功能）。不仅提供了蛋白质相互作用网络的可视化，还能提供蛋白质家族、途径、亚细胞定位等信息，并且具有一些分析工具，如聚类分析、GO富集分析和KEGG富集分析等，可帮助

还在苦恼没有好用的转录因子数据库？还处于只知道JASPAR数据库的境地？现在已经悄咪咪的出现了20+转录因子整合数据库知道不？不知道没关系，小编来告诉你！

本文主要介绍了单细胞标记的marker基因数据库 Cell Marker2.0，包括其优势、使用方法、在线分析工具及数据下载功能等具体使用指南，希望可以为您的单细胞研究提供有力支持。