针对木瓜采后极易软化、1-MCP处理时长不当又会产生硬芯“橡胶质感”这一产业痛点，本研究以破色期果实为材料，设置无1-MCP处理、1-MCP 2h和1-MCP 16h三组，通过ATAC-seq与RNA-seq联合分析，系统解析染色质开放图谱与基因表达谱。将ATAC-seq差异peaks与RNA-seq差异表达基因（DEGs）交叉整合，锁定CpAGL18等MADS-box转录因子及CpACS1（乙烯

深度学习作为一种极具潜力的多功能工具，在图像处理及大数据分析领域展现出显著优势。

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一文教您如何进行DAP-seq的数据挖掘，筛选验证位点：从分析前思路→分析思路→如何筛选验证位点。

随着测序成本的下降，转录组测序已成为现代生物学研究中不可或缺的工具。通过对转录组进行分析，我们可以深入了解基因表达调控、细胞分化和疾病发生等复杂生物学过程。在转录组分析中，可视化分析结果至关重要。转录组文章中有一些高频的可视化分析结果，比如说，这些图可以帮助我们快速识别差异表达的基因、生物学途径和潜在的疾病标志物。本期，我们详细介绍下转录组相关的可视化结果。火山图（Volcano Plot）是一种

构成每个KOG的蛋白被假定为来自于一个祖先蛋白，这些蛋白可能是orthologs（来自于不同物种的由垂直家系进化而来的蛋白，通常保留与原始蛋白相同的功能）或者paralogs（在一定物种中来源于基因复制的蛋白，可能进化出新的与原来有关的功能）。不仅提供了蛋白质相互作用网络的可视化，还能提供蛋白质家族、途径、亚细胞定位等信息，并且具有一些分析工具，如聚类分析、GO富集分析和KEGG富集分析等，可帮助

还在苦恼没有好用的转录因子数据库？还处于只知道JASPAR数据库的境地？现在已经悄咪咪的出现了20+转录因子整合数据库知道不？不知道没关系，小编来告诉你！

康乃馨（Dianthus caryophyllus L.）对乙烯高度敏感，通常作为研究乙烯诱导花瓣衰老机制的模型植物。花瓣衰老由复杂的调控网络控制，组蛋白修饰等表观遗传调控会影响染色质状态和基因。

研究验证了这些基因在模拟糖尿病视网膜病变的体外模型中的表达变化，并发现高糖诱导了GSDMD和GSDME蛋白水平的增加，进一步揭示了细胞焦亡在糖尿病视网膜病变中的作用机制。细胞焦亡(Pyroptosis)又称细胞炎性坏死，是由gasdermin蛋白介导的细胞程序性坏死，表现为细胞不断胀大直至细胞膜破裂，导致细胞内容物的释放进而激活强烈的炎症反应。突变的胱天蛋白酶-3诱导gasdermin E（GSD

构成每个KOG的蛋白被假定为来自于一个祖先蛋白，这些蛋白可能是orthologs（来自于不同物种的由垂直家系进化而来的蛋白，通常保留与原始蛋白相同的功能）或者paralogs（在一定物种中来源于基因复制的蛋白，可能进化出新的与原来有关的功能）。不仅提供了蛋白质相互作用网络的可视化，还能提供蛋白质家族、途径、亚细胞定位等信息，并且具有一些分析工具，如聚类分析、GO富集分析和KEGG富集分析等，可帮助