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Discovery Studio官方教程(Help-Tutorials) 创建2D QASR模型

若事先没有计算过化合物的2D性质,则在Calculable Properties栏中选择需要计算的性质。如果能够搜集到一系列结构类似物的生物活性数据,则可以采用。由于本教程不使用文献报道的理化参数(W,1ΧR,J)作为构建QSAR模型的参数,所以需要使用DS来计算训练集化合物的其他理化性质。的方法流程有全面的了解,不采用文章中所使用的理化性质作为构建构效关系模型的参数。

#学习方法#科技
Discovery Studio | 构建基于受体结构的药效团模型(SBP)

SBP方法首先通过对活性部位的分析产生特征相互作用图(feature interaction map),特征相互作用图用于反映可能的配体与蛋白之间的合理的相互作用,接着通过特征相互作用图产生药效团模型,进一步利用药效团模型发现潜在的活性化合物。蛋白活性位点处药效团模型共由18个特征元素表征,特征元素的选取是基于观察到的配体和蛋白间相互作用,以及从单一蛋白结构得到的作用。CTRL-选取donor f

#学习方法#科技#学习 +2
Discovery Studio官方教程(Help-Tutorials) 可视化分子对接非键作用

最终过滤得到19个对接构象,这19个对接构象满足以下条件:是每个配体分子对接结果中-CDOCKER_INTERACTION_ENERGY最高的对接构象,和ILE274可以形成疏水作用,和SER67可以形成氢键作用。在基于结构的药物设计过程中,识别和优化配体分子和受体分子间的相互作用是一个基本过程,因此,全面细致的分析非键相互作用非常关键。打开一个个分子窗口和图形窗口,分子窗口中包含了所有的共500

#学习方法#科技#学习 +2
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